Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGR5

Hdhd2, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd2Q3UGR5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hdhd2Q3UGR5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hdhd2Q3UGR5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hdhd2Q3UGR5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hdhd2Q3UGR5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Hdhd2Q3UGR5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hdhd2Q3UGR5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hdhd2Q3UGR5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hdhd2Q3UGR5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hdhd2Q3UGR5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hdhd2Q3UGR5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hdhd2Q3UGR5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hdhd2Q3UGR5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hdhd2Q3UGR5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hdhd2Q3UGR5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hdhd2Q3UGR5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Hdhd2Q3UGR5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hdhd2Q3UGR5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hdhd2Q3UGR5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hdhd2Q3UGR5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hdhd2Q3UGR5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hdhd2Q3UGR5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hdhd2Q3UGR5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hdhd2Q3UGR5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hdhd2Q3UGR5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hdhd2Q3UGR5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hdhd2Q3UGR5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hdhd2Q3UGR5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hdhd2Q3UGR5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hdhd2Q3UGR5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hdhd2Q3UGR5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hdhd2Q3UGR5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hdhd2Q3UGR5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hdhd2Q3UGR5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hdhd2Q3UGR5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hdhd2Q3UGR5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hdhd2Q3UGR5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hdhd2Q3UGR5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdhd2Q3UGR5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdhd2Q3UGR5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdhd2Q3UGR5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdhd2Q3UGR5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdhd2Q3UGR5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdhd2Q3UGR5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hdhd2Q3UGR5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hdhd2Q3UGR5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hdhd2Q3UGR5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hdhd2Q3UGR5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hdhd2Q3UGR5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hdhd2Q3UGR5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hdhd2Q3UGR5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hdhd2Q3UGR5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdhd2Q3UGR5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdhd2Q3UGR5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdhd2Q3UGR5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hdhd2Q3UGR5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hdhd2Q3UGR5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hdhd2Q3UGR5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hdhd2Q3UGR5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hdhd2Q3UGR5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hdhd2Q3UGR5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hdhd2Q3UGR5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hdhd2Q3UGR5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hdhd2Q3UGR5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdhd2Q3UGR5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdhd2Q3UGR5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdhd2Q3UGR5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hdhd2Q3UGR5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hdhd2Q3UGR5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hdhd2Q3UGR5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hdhd2Q3UGR5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hdhd2Q3UGR5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hdhd2Q3UGR5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdhd2Q3UGR5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdhd2Q3UGR5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdhd2Q3UGR5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdhd2Q3UGR5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdhd2Q3UGR5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdhd2Q3UGR5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdhd2Q3UGR5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdhd2Q3UGR5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdhd2Q3UGR5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdhd2Q3UGR5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdhd2Q3UGR5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hdhd2Q3UGR5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hdhd2Q3UGR5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hdhd2Q3UGR5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hdhd2Q3UGR5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdhd2Q3UGR5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdhd2Q3UGR5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdhd2Q3UGR5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdhd2Q3UGR5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdhd2Q3UGR5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hdhd2Q3UGR5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hdhd2Q3UGR5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hdhd2Q3UGR5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Hdhd2Q3UGR5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hdhd2Q3UGR5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hdhd2Q3UGR5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hdhd2Q3UGR5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms