Protein–RNA interactions for Protein: Q3UC65

Rsrp1, Arginine/serine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsrp1Q3UC65 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rsrp1Q3UC65 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rsrp1Q3UC65 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rsrp1Q3UC65 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rsrp1Q3UC65 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rsrp1Q3UC65 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rsrp1Q3UC65 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rsrp1Q3UC65 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rsrp1Q3UC65 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rsrp1Q3UC65 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rsrp1Q3UC65 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rsrp1Q3UC65 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Rsrp1Q3UC65 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rsrp1Q3UC65 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rsrp1Q3UC65 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rsrp1Q3UC65 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rsrp1Q3UC65 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rsrp1Q3UC65 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Rsrp1Q3UC65 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rsrp1Q3UC65 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rsrp1Q3UC65 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rsrp1Q3UC65 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rsrp1Q3UC65 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rsrp1Q3UC65 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rsrp1Q3UC65 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rsrp1Q3UC65 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rsrp1Q3UC65 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rsrp1Q3UC65 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rsrp1Q3UC65 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rsrp1Q3UC65 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rsrp1Q3UC65 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rsrp1Q3UC65 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rsrp1Q3UC65 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rsrp1Q3UC65 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rsrp1Q3UC65 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rsrp1Q3UC65 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rsrp1Q3UC65 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rsrp1Q3UC65 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rsrp1Q3UC65 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rsrp1Q3UC65 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rsrp1Q3UC65 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rsrp1Q3UC65 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rsrp1Q3UC65 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rsrp1Q3UC65 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rsrp1Q3UC65 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rsrp1Q3UC65 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rsrp1Q3UC65 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rsrp1Q3UC65 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rsrp1Q3UC65 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rsrp1Q3UC65 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rsrp1Q3UC65 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rsrp1Q3UC65 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rsrp1Q3UC65 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rsrp1Q3UC65 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rsrp1Q3UC65 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rsrp1Q3UC65 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rsrp1Q3UC65 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rsrp1Q3UC65 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rsrp1Q3UC65 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rsrp1Q3UC65 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rsrp1Q3UC65 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rsrp1Q3UC65 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rsrp1Q3UC65 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rsrp1Q3UC65 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rsrp1Q3UC65 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rsrp1Q3UC65 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rsrp1Q3UC65 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rsrp1Q3UC65 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rsrp1Q3UC65 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rsrp1Q3UC65 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsrp1Q3UC65 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsrp1Q3UC65 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rsrp1Q3UC65 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rsrp1Q3UC65 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rsrp1Q3UC65 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rsrp1Q3UC65 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rsrp1Q3UC65 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rsrp1Q3UC65 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rsrp1Q3UC65 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rsrp1Q3UC65 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rsrp1Q3UC65 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rsrp1Q3UC65 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rsrp1Q3UC65 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rsrp1Q3UC65 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rsrp1Q3UC65 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rsrp1Q3UC65 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rsrp1Q3UC65 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rsrp1Q3UC65 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rsrp1Q3UC65 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rsrp1Q3UC65 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rsrp1Q3UC65 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rsrp1Q3UC65 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rsrp1Q3UC65 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rsrp1Q3UC65 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rsrp1Q3UC65 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rsrp1Q3UC65 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rsrp1Q3UC65 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rsrp1Q3UC65 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsrp1Q3UC65 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rsrp1Q3UC65 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms