Protein–RNA interactions for Protein: Q3UC65

Rsrp1, Arginine/serine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsrp1Q3UC65 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
Rsrp1Q3UC65 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Rsrp1Q3UC65 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Rsrp1Q3UC65 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Rsrp1Q3UC65 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Rsrp1Q3UC65 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
Rsrp1Q3UC65 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Rsrp1Q3UC65 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Rsrp1Q3UC65 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Rsrp1Q3UC65 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Rsrp1Q3UC65 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Rsrp1Q3UC65 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
Rsrp1Q3UC65 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Rsrp1Q3UC65 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Rsrp1Q3UC65 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rsrp1Q3UC65 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rsrp1Q3UC65 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Rsrp1Q3UC65 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Rsrp1Q3UC65 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rsrp1Q3UC65 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rsrp1Q3UC65 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Rsrp1Q3UC65 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rsrp1Q3UC65 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rsrp1Q3UC65 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rsrp1Q3UC65 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rsrp1Q3UC65 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Rsrp1Q3UC65 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rsrp1Q3UC65 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rsrp1Q3UC65 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rsrp1Q3UC65 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rsrp1Q3UC65 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rsrp1Q3UC65 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rsrp1Q3UC65 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rsrp1Q3UC65 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rsrp1Q3UC65 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rsrp1Q3UC65 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Rsrp1Q3UC65 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rsrp1Q3UC65 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rsrp1Q3UC65 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rsrp1Q3UC65 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rsrp1Q3UC65 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rsrp1Q3UC65 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rsrp1Q3UC65 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rsrp1Q3UC65 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rsrp1Q3UC65 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Rsrp1Q3UC65 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rsrp1Q3UC65 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rsrp1Q3UC65 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rsrp1Q3UC65 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rsrp1Q3UC65 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Rsrp1Q3UC65 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rsrp1Q3UC65 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rsrp1Q3UC65 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rsrp1Q3UC65 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rsrp1Q3UC65 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Rsrp1Q3UC65 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rsrp1Q3UC65 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rsrp1Q3UC65 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rsrp1Q3UC65 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rsrp1Q3UC65 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Rsrp1Q3UC65 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rsrp1Q3UC65 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rsrp1Q3UC65 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rsrp1Q3UC65 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rsrp1Q3UC65 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rsrp1Q3UC65 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rsrp1Q3UC65 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rsrp1Q3UC65 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rsrp1Q3UC65 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rsrp1Q3UC65 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rsrp1Q3UC65 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rsrp1Q3UC65 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rsrp1Q3UC65 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rsrp1Q3UC65 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rsrp1Q3UC65 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rsrp1Q3UC65 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rsrp1Q3UC65 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Rsrp1Q3UC65 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rsrp1Q3UC65 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rsrp1Q3UC65 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Rsrp1Q3UC65 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rsrp1Q3UC65 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rsrp1Q3UC65 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rsrp1Q3UC65 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rsrp1Q3UC65 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rsrp1Q3UC65 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rsrp1Q3UC65 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rsrp1Q3UC65 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rsrp1Q3UC65 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rsrp1Q3UC65 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Rsrp1Q3UC65 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rsrp1Q3UC65 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rsrp1Q3UC65 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rsrp1Q3UC65 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rsrp1Q3UC65 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rsrp1Q3UC65 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rsrp1Q3UC65 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rsrp1Q3UC65 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rsrp1Q3UC65 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rsrp1Q3UC65 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms