Protein–RNA interactions for Protein: Q3U308

Ctu2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu2Q3U308 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctu2Q3U308 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctu2Q3U308 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctu2Q3U308 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctu2Q3U308 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctu2Q3U308 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctu2Q3U308 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctu2Q3U308 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctu2Q3U308 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctu2Q3U308 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctu2Q3U308 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctu2Q3U308 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctu2Q3U308 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctu2Q3U308 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctu2Q3U308 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctu2Q3U308 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctu2Q3U308 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctu2Q3U308 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctu2Q3U308 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctu2Q3U308 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctu2Q3U308 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctu2Q3U308 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctu2Q3U308 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctu2Q3U308 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctu2Q3U308 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctu2Q3U308 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ctu2Q3U308 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ctu2Q3U308 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctu2Q3U308 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctu2Q3U308 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctu2Q3U308 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctu2Q3U308 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctu2Q3U308 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctu2Q3U308 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctu2Q3U308 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctu2Q3U308 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctu2Q3U308 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctu2Q3U308 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctu2Q3U308 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctu2Q3U308 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctu2Q3U308 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctu2Q3U308 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctu2Q3U308 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctu2Q3U308 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctu2Q3U308 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctu2Q3U308 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ctu2Q3U308 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctu2Q3U308 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctu2Q3U308 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctu2Q3U308 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctu2Q3U308 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctu2Q3U308 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctu2Q3U308 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctu2Q3U308 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctu2Q3U308 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctu2Q3U308 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctu2Q3U308 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctu2Q3U308 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctu2Q3U308 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctu2Q3U308 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctu2Q3U308 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctu2Q3U308 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctu2Q3U308 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctu2Q3U308 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctu2Q3U308 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctu2Q3U308 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctu2Q3U308 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctu2Q3U308 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctu2Q3U308 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctu2Q3U308 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctu2Q3U308 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctu2Q3U308 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctu2Q3U308 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctu2Q3U308 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctu2Q3U308 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctu2Q3U308 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctu2Q3U308 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctu2Q3U308 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctu2Q3U308 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctu2Q3U308 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctu2Q3U308 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctu2Q3U308 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctu2Q3U308 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctu2Q3U308 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctu2Q3U308 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctu2Q3U308 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctu2Q3U308 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctu2Q3U308 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctu2Q3U308 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctu2Q3U308 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctu2Q3U308 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctu2Q3U308 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctu2Q3U308 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctu2Q3U308 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctu2Q3U308 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctu2Q3U308 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctu2Q3U308 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctu2Q3U308 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctu2Q3U308 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctu2Q3U308 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms