Protein–RNA interactions for Protein: Q12276

HER1, HMG2-induced ER-remodeling protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HER1Q12276 SPE4YLR146C 903 nt7.71□□□□□ -1.18
HER1Q12276 ATP10YLR393W 840 nt7.7□□□□□ -1.18
HER1Q12276 ALR1YOL130W 2580 nt7.69□□□□□ -1.18
HER1Q12276 YCP4YCR004C 744 nt7.69□□□□□ -1.18
HER1Q12276 YER152W-AYER152W-A 567 nt7.69□□□□□ -1.18
HER1Q12276 BEM1YBR200W 1656 nt7.69□□□□□ -1.18
HER1Q12276 YNL140CYNL140C 570 nt7.68□□□□□ -1.18
HER1Q12276 TIF3YPR163C 1311 nt7.68□□□□□ -1.18
HER1Q12276 GAS1YMR307W 1680 nt7.67□□□□□ -1.18
HER1Q12276 SRP54YPR088C 1626 nt7.67□□□□□ -1.18
HER1Q12276 PTC6YCR079W 1329 nt7.66□□□□□ -1.18
HER1Q12276 WSC4YHL028W 1818 nt7.66□□□□□ -1.18
HER1Q12276 TPC1YGR096W 945 nt7.65□□□□□ -1.18
HER1Q12276 TOP3YLR234W 1971 nt7.64□□□□□ -1.19
HER1Q12276 YJL045WYJL045W 1905 nt7.64□□□□□ -1.19
HER1Q12276 MEP1YGR121C 1479 nt7.64□□□□□ -1.19
HER1Q12276 YER152CYER152C 1332 nt7.64□□□□□ -1.19
HER1Q12276 RRT6YGL146C 936 nt7.64□□□□□ -1.19
HER1Q12276 KRE1YNL322C 942 nt7.64□□□□□ -1.19
HER1Q12276 HXT9YJL219W 1704 nt7.64□□□□□ -1.19
HER1Q12276 SAM50YNL026W 1455 nt7.63□□□□□ -1.19
HER1Q12276 NAS2YIL007C 663 nt7.63□□□□□ -1.19
HER1Q12276 LEU2YCL018W 1095 nt7.63□□□□□ -1.19
HER1Q12276 THP3YPR045C 1413 nt7.62□□□□□ -1.19
HER1Q12276 GGC1YDL198C 903 nt7.62□□□□□ -1.19
HER1Q12276 IGD1YFR017C 588 nt7.62□□□□□ -1.19
HER1Q12276 CDD1YLR245C 429 nt7.62□□□□□ -1.19
HER1Q12276 SPE2YOL052C 1191 nt7.62□□□□□ -1.19
HER1Q12276 INO1YJL153C 1602 nt7.62□□□□□ -1.19
HER1Q12276 YBR056WYBR056W 1506 nt7.62□□□□□ -1.19
HER1Q12276 ERR3YMR323W 1314 nt7.61□□□□□ -1.19
HER1Q12276 ERR1YOR393W 1314 nt7.61□□□□□ -1.19
HER1Q12276 ERR2YPL281C 1314 nt7.61□□□□□ -1.19
HER1Q12276 RPL2AYFR031C-A 765 nt7.61□□□□□ -1.19
HER1Q12276 YMR253CYMR253C 1245 nt7.61□□□□□ -1.19
HER1Q12276 NAM8YHR086W 1572 nt7.6□□□□□ -1.19
HER1Q12276 MET13YGL125W 1803 nt7.6□□□□□ -1.19
HER1Q12276 MRN1YPL184C 1839 nt7.6□□□□□ -1.19
HER1Q12276 INM1YHR046C 888 nt7.6□□□□□ -1.19
HER1Q12276 MGM101YJR144W 810 nt7.6□□□□□ -1.19
HER1Q12276 YJR149WYJR149W 1215 nt7.6□□□□□ -1.19
HER1Q12276 FSH2YMR222C 672 nt7.6□□□□□ -1.19
HER1Q12276 BUD31YCR063W 474 nt7.59□□□□□ -1.19
HER1Q12276 GLY1YEL046C 1164 nt7.59□□□□□ -1.19
HER1Q12276 BUD20YLR074C 501 nt7.59□□□□□ -1.19
HER1Q12276 YEL023CYEL023C 2049 nt7.58□□□□□ -1.2
HER1Q12276 FRT1YOR324C 1809 nt7.58□□□□□ -1.2
HER1Q12276 CBK1YNL161W 2271 nt7.58□□□□□ -1.2
HER1Q12276 TGL5YOR081C 2250 nt7.58□□□□□ -1.2
HER1Q12276 YHR131CYHR131C 2553 nt7.58□□□□□ -1.2
HER1Q12276 SGF73YGL066W 1974 nt7.57□□□□□ -1.2
HER1Q12276 NAS6YGR232W 687 nt7.57□□□□□ -1.2
HER1Q12276 REX2YLR059C 810 nt7.57□□□□□ -1.2
HER1Q12276 MLS1YNL117W 1665 nt7.57□□□□□ -1.2
HER1Q12276 MAM3YOL060C 2121 nt7.57□□□□□ -1.2
HER1Q12276 ECM27YJR106W 2178 nt7.56□□□□□ -1.2
HER1Q12276 GCD11YER025W 1584 nt7.56□□□□□ -1.2
HER1Q12276 BUB2YMR055C 921 nt7.56□□□□□ -1.2
HER1Q12276 LRO1YNR008W 1986 nt7.55□□□□□ -1.2
HER1Q12276 YPT11YNL304W 1254 nt7.54□□□□□ -1.2
HER1Q12276 MET8YBR213W 825 nt7.54□□□□□ -1.2
HER1Q12276 YCR025CYCR025C 411 nt7.53□□□□□ -1.2
HER1Q12276 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt7.53□□□□□ -1.2
HER1Q12276 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt7.53□□□□□ -1.2
HER1Q12276 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt7.53□□□□□ -1.2
HER1Q12276 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt7.53□□□□□ -1.2
HER1Q12276 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt7.53□□□□□ -1.2
HER1Q12276 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt7.53□□□□□ -1.2
HER1Q12276 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt7.53□□□□□ -1.2
HER1Q12276 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt7.53□□□□□ -1.2
HER1Q12276 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt7.53□□□□□ -1.2
HER1Q12276 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt7.53□□□□□ -1.2
HER1Q12276 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt7.53□□□□□ -1.2
HER1Q12276 SWM1YDR260C 513 nt7.53□□□□□ -1.2
HER1Q12276 YKR012CYKR012C 378 nt7.53□□□□□ -1.2
HER1Q12276 IPL1YPL209C 1104 nt7.53□□□□□ -1.2
HER1Q12276 KTR4YBR199W 1395 nt7.53□□□□□ -1.2
HER1Q12276 PHB2YGR231C 933 nt7.52□□□□□ -1.21
HER1Q12276 YIR035CYIR035C 765 nt7.52□□□□□ -1.21
HER1Q12276 TDA4YJR116W 840 nt7.52□□□□□ -1.21
HER1Q12276 ADH3YMR083W 1128 nt7.52□□□□□ -1.21
HER1Q12276 CTF3YLR381W 2202 nt7.52□□□□□ -1.21
HER1Q12276 RSC9YML127W 1746 nt7.52□□□□□ -1.21
HER1Q12276 AQR1YNL065W 1761 nt7.51□□□□□ -1.21
HER1Q12276 STF1YDL130W-A 261 nt7.5□□□□□ -1.21
HER1Q12276 SDS24YBR214W 1584 nt7.5□□□□□ -1.21
HER1Q12276 PMA2YPL036W 2844 nt7.49□□□□□ -1.21
HER1Q12276 POB3YML069W 1659 nt7.49□□□□□ -1.21
HER1Q12276 FLX1YIL134W 936 nt7.49□□□□□ -1.21
HER1Q12276 MOB1YIL106W 945 nt7.48□□□□□ -1.21
HER1Q12276 VBA3YCL069W 1377 nt7.47□□□□□ -1.21
HER1Q12276 YLR030WYLR030W 792 nt7.47□□□□□ -1.21
HER1Q12276 MRP7YNL005C 1116 nt7.47□□□□□ -1.21
HER1Q12276 DIP5YPL265W 1827 nt7.46□□□□□ -1.21
HER1Q12276 CSM2YIL132C 642 nt7.46□□□□□ -1.22
HER1Q12276 ATO2YNR002C 849 nt7.45□□□□□ -1.22
HER1Q12276 YMR007WYMR007W 381 nt7.44□□□□□ -1.22
HER1Q12276 ENO1YGR254W 1314 nt7.44□□□□□ -1.22
HER1Q12276 RPL12BYDR418W 498 nt7.43□□□□□ -1.22
HER1Q12276 CKB1YGL019W 837 nt7.43□□□□□ -1.22
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