Protein–RNA interactions for Protein: Q12241

VAM3, Syntaxin VAM3, yeastyeast

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VAM3Q12241 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.06□□□□□ -1.28
VAM3Q12241 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.06□□□□□ -1.28
VAM3Q12241 PTC6YCR079W 1329 nt7.05□□□□□ -1.28
VAM3Q12241 THP3YPR045C 1413 nt7.05□□□□□ -1.28
VAM3Q12241 YJL009WYJL009W 327 nt7.04□□□□□ -1.28
VAM3Q12241 REX2YLR059C 810 nt7.04□□□□□ -1.28
VAM3Q12241 YPT11YNL304W 1254 nt7.04□□□□□ -1.28
VAM3Q12241 YBR232CYBR232C 360 nt7.04□□□□□ -1.28
VAM3Q12241 ECM27YJR106W 2178 nt7.03□□□□□ -1.28
VAM3Q12241 NAS2YIL007C 663 nt7.03□□□□□ -1.28
VAM3Q12241 SPE2YOL052C 1191 nt7.03□□□□□ -1.28
VAM3Q12241 HIS3YOR202W 663 nt7.02□□□□□ -1.29
VAM3Q12241 BAP3YDR046C 1815 nt7.01□□□□□ -1.29
VAM3Q12241 IGD1YFR017C 588 nt7.01□□□□□ -1.29
VAM3Q12241 CDD1YLR245C 429 nt7.01□□□□□ -1.29
VAM3Q12241 PFS2YNL317W 1398 nt7□□□□□ -1.29
VAM3Q12241 GGC1YDL198C 903 nt6.99□□□□□ -1.29
VAM3Q12241 ABP1YCR088W 1779 nt6.99□□□□□ -1.29
VAM3Q12241 CTF3YLR381W 2202 nt6.99□□□□□ -1.29
VAM3Q12241 MDH2YOL126C 1134 nt6.98□□□□□ -1.29
VAM3Q12241 YIL108WYIL108W 2091 nt6.97□□□□□ -1.29
VAM3Q12241 YIR035CYIR035C 765 nt6.97□□□□□ -1.29
VAM3Q12241 CMK2YOL016C 1344 nt6.97□□□□□ -1.29
VAM3Q12241 HEL1YKR017C 1656 nt6.96□□□□□ -1.29
VAM3Q12241 LYS20YDL182W 1287 nt6.96□□□□□ -1.3
VAM3Q12241 YKR012CYKR012C 378 nt6.96□□□□□ -1.3
VAM3Q12241 TIF3YPR163C 1311 nt6.96□□□□□ -1.3
VAM3Q12241 SMC5YOL034W 3282 nt6.96□□□□□ -1.3
VAM3Q12241 YBR056WYBR056W 1506 nt6.96□□□□□ -1.3
VAM3Q12241 NDE2YDL085W 1638 nt6.95□□□□□ -1.3
VAM3Q12241 HSV2YGR223C 1347 nt6.95□□□□□ -1.3
VAM3Q12241 SDS24YBR214W 1584 nt6.95□□□□□ -1.3
VAM3Q12241 SLM3YDL033C 1254 nt6.94□□□□□ -1.3
VAM3Q12241 PHB2YGR231C 933 nt6.94□□□□□ -1.3
VAM3Q12241 RSM7YJR113C 744 nt6.94□□□□□ -1.3
VAM3Q12241 YJR149WYJR149W 1215 nt6.94□□□□□ -1.3
VAM3Q12241 BUB2YMR055C 921 nt6.94□□□□□ -1.3
VAM3Q12241 YNL140CYNL140C 570 nt6.94□□□□□ -1.3
VAM3Q12241 ADH3YMR083W 1128 nt6.93□□□□□ -1.3
VAM3Q12241 SEN2YLR105C 1134 nt6.92□□□□□ -1.3
VAM3Q12241 VBA3YCL069W 1377 nt6.92□□□□□ -1.3
VAM3Q12241 MEP1YGR121C 1479 nt6.92□□□□□ -1.3
VAM3Q12241 MSB3YNL293W 1902 nt6.91□□□□□ -1.3
VAM3Q12241 CRN1YLR429W 1956 nt6.91□□□□□ -1.3
VAM3Q12241 BUD31YCR063W 474 nt6.9□□□□□ -1.3
VAM3Q12241 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt6.9□□□□□ -1.3
VAM3Q12241 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt6.9□□□□□ -1.3
VAM3Q12241 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt6.9□□□□□ -1.3
VAM3Q12241 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt6.9□□□□□ -1.3
VAM3Q12241 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt6.9□□□□□ -1.3
VAM3Q12241 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt6.9□□□□□ -1.3
VAM3Q12241 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt6.9□□□□□ -1.3
VAM3Q12241 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt6.9□□□□□ -1.3
VAM3Q12241 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt6.9□□□□□ -1.3
VAM3Q12241 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt6.9□□□□□ -1.3
VAM3Q12241 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt6.9□□□□□ -1.3
VAM3Q12241 INM1YHR046C 888 nt6.9□□□□□ -1.3
VAM3Q12241 FLX1YIL134W 936 nt6.9□□□□□ -1.3
VAM3Q12241 ENO1YGR254W 1314 nt6.9□□□□□ -1.3
VAM3Q12241 YCR061WYCR061W 1896 nt6.9□□□□□ -1.31
VAM3Q12241 GLY1YEL046C 1164 nt6.89□□□□□ -1.31
VAM3Q12241 MOB1YIL106W 945 nt6.89□□□□□ -1.31
VAM3Q12241 IPL1YPL209C 1104 nt6.89□□□□□ -1.31
VAM3Q12241 INO1YJL153C 1602 nt6.89□□□□□ -1.31
VAM3Q12241 TGL5YOR081C 2250 nt6.88□□□□□ -1.31
VAM3Q12241 YJL064WYJL064W 396 nt6.88□□□□□ -1.31
VAM3Q12241 NAP1YKR048C 1254 nt6.88□□□□□ -1.31
VAM3Q12241 PMT7YDR307W 1989 nt6.88□□□□□ -1.31
VAM3Q12241 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt6.87□□□□□ -1.31
VAM3Q12241 TDA4YJR116W 840 nt6.87□□□□□ -1.31
VAM3Q12241 YFR020WYFR020W 699 nt6.86□□□□□ -1.31
VAM3Q12241 CYC3YAL039C 810 nt6.86□□□□□ -1.31
VAM3Q12241 ADH6YMR318C 1083 nt6.86□□□□□ -1.31
VAM3Q12241 PAU19YMR325W 375 nt6.86□□□□□ -1.31
VAM3Q12241 CKI1YLR133W 1749 nt6.86□□□□□ -1.31
VAM3Q12241 HXT13YEL069C 1695 nt6.86□□□□□ -1.31
VAM3Q12241 MRN1YPL184C 1839 nt6.85□□□□□ -1.31
VAM3Q12241 TOP3YLR234W 1971 nt6.85□□□□□ -1.31
VAM3Q12241 YKR023WYKR023W 1593 nt6.84□□□□□ -1.31
VAM3Q12241 SRP102YKL154W 735 nt6.84□□□□□ -1.31
VAM3Q12241 HDA1YNL021W 2121 nt6.83□□□□□ -1.32
VAM3Q12241 YCR025CYCR025C 411 nt6.83□□□□□ -1.32
VAM3Q12241 RPL2AYFR031C-A 765 nt6.83□□□□□ -1.32
VAM3Q12241 YLR460CYLR460C 1131 nt6.83□□□□□ -1.32
VAM3Q12241 YGR137WYGR137W 375 nt6.82□□□□□ -1.32
VAM3Q12241 CDC13YDL220C 2775 nt6.82□□□□□ -1.32
VAM3Q12241 LRO1YNR008W 1986 nt6.82□□□□□ -1.32
VAM3Q12241 YLR280CYLR280C 351 nt6.81□□□□□ -1.32
VAM3Q12241 KTR4YBR199W 1395 nt6.81□□□□□ -1.32
VAM3Q12241 YPL264CYPL264C 1062 nt6.8□□□□□ -1.32
VAM3Q12241 WSC4YHL028W 1818 nt6.8□□□□□ -1.32
VAM3Q12241 EHT1YBR177C 1356 nt6.8□□□□□ -1.32
VAM3Q12241 UBP13YBL067C 2244 nt6.8□□□□□ -1.32
VAM3Q12241 YEN1YER041W 2280 nt6.79□□□□□ -1.32
VAM3Q12241 ATG22YCL038C 1587 nt6.79□□□□□ -1.32
VAM3Q12241 DIP5YPL265W 1827 nt6.79□□□□□ -1.32
VAM3Q12241 COG1YGL223C 1254 nt6.79□□□□□ -1.32
VAM3Q12241 CHS7YHR142W 951 nt6.79□□□□□ -1.32
VAM3Q12241 AIM34YMR003W 597 nt6.79□□□□□ -1.32
VAM3Q12241 WSC3YOL105C 1671 nt6.79□□□□□ -1.32
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