Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL1

Tigd2, Tigger transposable element-derived protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd2Q0VBL1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tigd2Q0VBL1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tigd2Q0VBL1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tigd2Q0VBL1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tigd2Q0VBL1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tigd2Q0VBL1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tigd2Q0VBL1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tigd2Q0VBL1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tigd2Q0VBL1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tigd2Q0VBL1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tigd2Q0VBL1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tigd2Q0VBL1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tigd2Q0VBL1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tigd2Q0VBL1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tigd2Q0VBL1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tigd2Q0VBL1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tigd2Q0VBL1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tigd2Q0VBL1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tigd2Q0VBL1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tigd2Q0VBL1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tigd2Q0VBL1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tigd2Q0VBL1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tigd2Q0VBL1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tigd2Q0VBL1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tigd2Q0VBL1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tigd2Q0VBL1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tigd2Q0VBL1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tigd2Q0VBL1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tigd2Q0VBL1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tigd2Q0VBL1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tigd2Q0VBL1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tigd2Q0VBL1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tigd2Q0VBL1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tigd2Q0VBL1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tigd2Q0VBL1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tigd2Q0VBL1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tigd2Q0VBL1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tigd2Q0VBL1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tigd2Q0VBL1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tigd2Q0VBL1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tigd2Q0VBL1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tigd2Q0VBL1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tigd2Q0VBL1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tigd2Q0VBL1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Tigd2Q0VBL1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Tigd2Q0VBL1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tigd2Q0VBL1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tigd2Q0VBL1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Tigd2Q0VBL1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tigd2Q0VBL1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tigd2Q0VBL1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tigd2Q0VBL1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tigd2Q0VBL1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tigd2Q0VBL1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tigd2Q0VBL1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tigd2Q0VBL1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tigd2Q0VBL1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tigd2Q0VBL1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tigd2Q0VBL1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tigd2Q0VBL1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Tigd2Q0VBL1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tigd2Q0VBL1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tigd2Q0VBL1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tigd2Q0VBL1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tigd2Q0VBL1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tigd2Q0VBL1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tigd2Q0VBL1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Tigd2Q0VBL1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tigd2Q0VBL1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tigd2Q0VBL1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tigd2Q0VBL1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tigd2Q0VBL1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tigd2Q0VBL1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tigd2Q0VBL1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tigd2Q0VBL1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tigd2Q0VBL1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tigd2Q0VBL1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tigd2Q0VBL1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tigd2Q0VBL1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tigd2Q0VBL1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tigd2Q0VBL1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tigd2Q0VBL1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tigd2Q0VBL1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tigd2Q0VBL1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tigd2Q0VBL1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tigd2Q0VBL1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tigd2Q0VBL1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tigd2Q0VBL1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tigd2Q0VBL1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tigd2Q0VBL1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tigd2Q0VBL1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tigd2Q0VBL1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tigd2Q0VBL1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tigd2Q0VBL1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tigd2Q0VBL1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tigd2Q0VBL1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tigd2Q0VBL1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tigd2Q0VBL1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tigd2Q0VBL1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tigd2Q0VBL1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms