Protein–RNA interactions for Protein: Q03702

CCE1, Cruciform cutting endonuclease 1, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CCE1Q03702 RHO1YPR165W 630 nt7.8□□□□□ -1.16
CCE1Q03702 YOR343CYOR343C 327 nt7.79□□□□□ -1.16
CCE1Q03702 PAU21YOR394W 495 nt7.79□□□□□ -1.16
CCE1Q03702 PAU22YPL282C 495 nt7.79□□□□□ -1.16
CCE1Q03702 PET18YCR020C 648 nt7.78□□□□□ -1.16
CCE1Q03702 YER156CYER156C 1017 nt7.78□□□□□ -1.16
CCE1Q03702 THI73YLR004C 1572 nt7.77□□□□□ -1.17
CCE1Q03702 GDH1YOR375C 1365 nt7.77□□□□□ -1.17
CCE1Q03702 RNA170RNA170 169 nt7.77□□□□□ -1.17
CCE1Q03702 RPS6AYPL090C 711 nt7.76□□□□□ -1.17
CCE1Q03702 RPS6BYBR181C 711 nt7.76□□□□□ -1.17
CCE1Q03702 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt7.75□□□□□ -1.17
CCE1Q03702 BXI1YNL305C 894 nt7.75□□□□□ -1.17
CCE1Q03702 YBR056WYBR056W 1506 nt7.74□□□□□ -1.17
CCE1Q03702 snR86snR86 1004 nt7.74□□□□□ -1.17
CCE1Q03702 MTO1YGL236C 2010 nt7.74□□□□□ -1.17
CCE1Q03702 ADA2YDR448W 1305 nt7.74□□□□□ -1.17
CCE1Q03702 RPL12BYDR418W 498 nt7.73□□□□□ -1.17
CCE1Q03702 PUP3YER094C 618 nt7.73□□□□□ -1.17
CCE1Q03702 PMU1YKL128C 888 nt7.73□□□□□ -1.17
CCE1Q03702 YGR137WYGR137W 375 nt7.72□□□□□ -1.17
CCE1Q03702 TAD2YJL035C 753 nt7.72□□□□□ -1.17
CCE1Q03702 TDH1YJL052W 999 nt7.72□□□□□ -1.17
CCE1Q03702 PRE10YOR362C 867 nt7.72□□□□□ -1.17
CCE1Q03702 MCM5YLR274W 2328 nt7.71□□□□□ -1.18
CCE1Q03702 UTR5YEL035C 501 nt7.71□□□□□ -1.18
CCE1Q03702 MEP1YGR121C 1479 nt7.69□□□□□ -1.18
CCE1Q03702 RCF1YML030W 480 nt7.69□□□□□ -1.18
CCE1Q03702 NDE2YDL085W 1638 nt7.69□□□□□ -1.18
CCE1Q03702 ATP2YJR121W 1536 nt7.68□□□□□ -1.18
CCE1Q03702 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt7.68□□□□□ -1.18
CCE1Q03702 ELP4YPL101W 1371 nt7.68□□□□□ -1.18
CCE1Q03702 NBA1YOL070C 1506 nt7.67□□□□□ -1.18
CCE1Q03702 FRA1YLL029W 2250 nt7.65□□□□□ -1.18
CCE1Q03702 THI6YPL214C 1623 nt7.65□□□□□ -1.18
CCE1Q03702 EHT1YBR177C 1356 nt7.65□□□□□ -1.18
CCE1Q03702 TRP2YER090W 1524 nt7.64□□□□□ -1.19
CCE1Q03702 TIM50YPL063W 1431 nt7.64□□□□□ -1.19
CCE1Q03702 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt7.63□□□□□ -1.19
CCE1Q03702 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt7.63□□□□□ -1.19
CCE1Q03702 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt7.63□□□□□ -1.19
CCE1Q03702 SUP51tL(UAA)J 84 nt7.63□□□□□ -1.19
CCE1Q03702 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt7.63□□□□□ -1.19
CCE1Q03702 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt7.63□□□□□ -1.19
CCE1Q03702 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt7.63□□□□□ -1.19
CCE1Q03702 YIL168WYIL168W 384 nt7.63□□□□□ -1.19
CCE1Q03702 RSC4YKR008W 1878 nt7.63□□□□□ -1.19
CCE1Q03702 HXK1YFR053C 1458 nt7.62□□□□□ -1.19
CCE1Q03702 TOS1YBR162C 1368 nt7.62□□□□□ -1.19
CCE1Q03702 WSC3YOL105C 1671 nt7.62□□□□□ -1.19
CCE1Q03702 INO1YJL153C 1602 nt7.62□□□□□ -1.19
CCE1Q03702 SHC1YER096W 1539 nt7.62□□□□□ -1.19
CCE1Q03702 BUD31YCR063W 474 nt7.61□□□□□ -1.19
CCE1Q03702 TDA4YJR116W 840 nt7.61□□□□□ -1.19
CCE1Q03702 HIS3YOR202W 663 nt7.61□□□□□ -1.19
CCE1Q03702 ALD5YER073W 1563 nt7.61□□□□□ -1.19
CCE1Q03702 JHD1YER051W 1479 nt7.61□□□□□ -1.19
CCE1Q03702 NUP53YMR153W 1428 nt7.61□□□□□ -1.19
CCE1Q03702 LRO1YNR008W 1986 nt7.6□□□□□ -1.19
CCE1Q03702 YDR476CYDR476C 675 nt7.6□□□□□ -1.19
CCE1Q03702 YJL043WYJL043W 774 nt7.59□□□□□ -1.19
CCE1Q03702 ADE1YAR015W 921 nt7.59□□□□□ -1.19
CCE1Q03702 LEA1YPL213W 717 nt7.58□□□□□ -1.2
CCE1Q03702 INM1YHR046C 888 nt7.57□□□□□ -1.2
CCE1Q03702 TGL5YOR081C 2250 nt7.57□□□□□ -1.2
CCE1Q03702 ARG7YMR062C 1326 nt7.56□□□□□ -1.2
CCE1Q03702 HXT8YJL214W 1710 nt7.56□□□□□ -1.2
CCE1Q03702 HXT11YOL156W 1704 nt7.56□□□□□ -1.2
CCE1Q03702 FUS3YBL016W 1062 nt7.56□□□□□ -1.2
CCE1Q03702 YNL140CYNL140C 570 nt7.56□□□□□ -1.2
CCE1Q03702 YOR268CYOR268C 399 nt7.56□□□□□ -1.2
CCE1Q03702 PSP2YML017W 1782 nt7.56□□□□□ -1.2
CCE1Q03702 FET5YFL041W 1869 nt7.55□□□□□ -1.2
CCE1Q03702 PET494YNR045W 1470 nt7.55□□□□□ -1.2
CCE1Q03702 TIF3YPR163C 1311 nt7.54□□□□□ -1.2
CCE1Q03702 MNN9YPL050C 1188 nt7.54□□□□□ -1.2
CCE1Q03702 GLY1YEL046C 1164 nt7.53□□□□□ -1.2
CCE1Q03702 EDC2YER035W 438 nt7.53□□□□□ -1.2
CCE1Q03702 MRP7YNL005C 1116 nt7.53□□□□□ -1.2
CCE1Q03702 KAE1YKR038C 1161 nt7.52□□□□□ -1.21
CCE1Q03702 CPT1YNL130C 1182 nt7.52□□□□□ -1.21
CCE1Q03702 SPR1YOR190W 1338 nt7.52□□□□□ -1.21
CCE1Q03702 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt7.51□□□□□ -1.21
CCE1Q03702 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt7.51□□□□□ -1.21
CCE1Q03702 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt7.51□□□□□ -1.21
CCE1Q03702 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt7.51□□□□□ -1.21
CCE1Q03702 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt7.51□□□□□ -1.21
CCE1Q03702 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt7.51□□□□□ -1.21
CCE1Q03702 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt7.51□□□□□ -1.21
CCE1Q03702 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt7.51□□□□□ -1.21
CCE1Q03702 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt7.51□□□□□ -1.21
CCE1Q03702 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt7.51□□□□□ -1.21
CCE1Q03702 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt7.51□□□□□ -1.21
CCE1Q03702 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt7.51□□□□□ -1.21
CCE1Q03702 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt7.51□□□□□ -1.21
CCE1Q03702 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt7.51□□□□□ -1.21
CCE1Q03702 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt7.51□□□□□ -1.21
CCE1Q03702 YLR072WYLR072W 2082 nt7.51□□□□□ -1.21
CCE1Q03702 DIP5YPL265W 1827 nt7.5□□□□□ -1.21
CCE1Q03702 HAC1YFL031W 717 nt7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 120.5 ms