Protein–RNA interactions for Protein: Q00286

Pou1f1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou1f1Q00286 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pou1f1Q00286 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pou1f1Q00286 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pou1f1Q00286 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pou1f1Q00286 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pou1f1Q00286 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pou1f1Q00286 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pou1f1Q00286 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pou1f1Q00286 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pou1f1Q00286 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pou1f1Q00286 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pou1f1Q00286 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pou1f1Q00286 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pou1f1Q00286 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pou1f1Q00286 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pou1f1Q00286 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pou1f1Q00286 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pou1f1Q00286 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pou1f1Q00286 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pou1f1Q00286 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pou1f1Q00286 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pou1f1Q00286 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pou1f1Q00286 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pou1f1Q00286 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pou1f1Q00286 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pou1f1Q00286 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pou1f1Q00286 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pou1f1Q00286 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pou1f1Q00286 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pou1f1Q00286 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pou1f1Q00286 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pou1f1Q00286 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pou1f1Q00286 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pou1f1Q00286 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pou1f1Q00286 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pou1f1Q00286 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pou1f1Q00286 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pou1f1Q00286 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pou1f1Q00286 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pou1f1Q00286 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pou1f1Q00286 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pou1f1Q00286 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pou1f1Q00286 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pou1f1Q00286 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pou1f1Q00286 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pou1f1Q00286 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pou1f1Q00286 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pou1f1Q00286 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pou1f1Q00286 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pou1f1Q00286 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pou1f1Q00286 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pou1f1Q00286 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pou1f1Q00286 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pou1f1Q00286 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pou1f1Q00286 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pou1f1Q00286 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pou1f1Q00286 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pou1f1Q00286 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pou1f1Q00286 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pou1f1Q00286 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pou1f1Q00286 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pou1f1Q00286 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pou1f1Q00286 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pou1f1Q00286 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pou1f1Q00286 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pou1f1Q00286 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pou1f1Q00286 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pou1f1Q00286 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pou1f1Q00286 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pou1f1Q00286 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Pou1f1Q00286 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pou1f1Q00286 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pou1f1Q00286 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pou1f1Q00286 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pou1f1Q00286 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pou1f1Q00286 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pou1f1Q00286 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pou1f1Q00286 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pou1f1Q00286 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pou1f1Q00286 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pou1f1Q00286 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pou1f1Q00286 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pou1f1Q00286 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pou1f1Q00286 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pou1f1Q00286 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pou1f1Q00286 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pou1f1Q00286 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pou1f1Q00286 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pou1f1Q00286 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pou1f1Q00286 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pou1f1Q00286 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pou1f1Q00286 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pou1f1Q00286 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pou1f1Q00286 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pou1f1Q00286 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pou1f1Q00286 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pou1f1Q00286 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pou1f1Q00286 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pou1f1Q00286 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pou1f1Q00286 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms