Protein–RNA interactions for Protein: P70441

Slc9a3r1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3r1P70441 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc9a3r1P70441 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc9a3r1P70441 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc9a3r1P70441 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc9a3r1P70441 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc9a3r1P70441 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc9a3r1P70441 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc9a3r1P70441 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc9a3r1P70441 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc9a3r1P70441 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc9a3r1P70441 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc9a3r1P70441 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc9a3r1P70441 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc9a3r1P70441 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc9a3r1P70441 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc9a3r1P70441 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc9a3r1P70441 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc9a3r1P70441 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc9a3r1P70441 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc9a3r1P70441 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc9a3r1P70441 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc9a3r1P70441 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc9a3r1P70441 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc9a3r1P70441 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc9a3r1P70441 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc9a3r1P70441 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc9a3r1P70441 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc9a3r1P70441 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc9a3r1P70441 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc9a3r1P70441 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc9a3r1P70441 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc9a3r1P70441 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Slc9a3r1P70441 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc9a3r1P70441 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc9a3r1P70441 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc9a3r1P70441 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc9a3r1P70441 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc9a3r1P70441 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc9a3r1P70441 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc9a3r1P70441 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc9a3r1P70441 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc9a3r1P70441 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc9a3r1P70441 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc9a3r1P70441 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc9a3r1P70441 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc9a3r1P70441 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc9a3r1P70441 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc9a3r1P70441 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc9a3r1P70441 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc9a3r1P70441 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc9a3r1P70441 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc9a3r1P70441 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc9a3r1P70441 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc9a3r1P70441 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc9a3r1P70441 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc9a3r1P70441 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc9a3r1P70441 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc9a3r1P70441 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc9a3r1P70441 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc9a3r1P70441 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc9a3r1P70441 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc9a3r1P70441 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc9a3r1P70441 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc9a3r1P70441 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc9a3r1P70441 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc9a3r1P70441 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc9a3r1P70441 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc9a3r1P70441 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc9a3r1P70441 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc9a3r1P70441 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc9a3r1P70441 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc9a3r1P70441 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc9a3r1P70441 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc9a3r1P70441 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc9a3r1P70441 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc9a3r1P70441 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc9a3r1P70441 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc9a3r1P70441 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc9a3r1P70441 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc9a3r1P70441 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc9a3r1P70441 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc9a3r1P70441 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc9a3r1P70441 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc9a3r1P70441 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc9a3r1P70441 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc9a3r1P70441 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc9a3r1P70441 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc9a3r1P70441 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc9a3r1P70441 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc9a3r1P70441 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc9a3r1P70441 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc9a3r1P70441 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc9a3r1P70441 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc9a3r1P70441 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc9a3r1P70441 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc9a3r1P70441 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc9a3r1P70441 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc9a3r1P70441 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc9a3r1P70441 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc9a3r1P70441 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms