Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Acod1P54987 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Acod1P54987 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Acod1P54987 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Acod1P54987 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Acod1P54987 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Acod1P54987 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Acod1P54987 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Acod1P54987 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Acod1P54987 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Acod1P54987 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Acod1P54987 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Acod1P54987 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Acod1P54987 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Acod1P54987 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Acod1P54987 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Acod1P54987 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Acod1P54987 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Acod1P54987 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Acod1P54987 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Acod1P54987 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Acod1P54987 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Acod1P54987 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Acod1P54987 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acod1P54987 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acod1P54987 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acod1P54987 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acod1P54987 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acod1P54987 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Acod1P54987 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Acod1P54987 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Acod1P54987 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Acod1P54987 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Acod1P54987 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Acod1P54987 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Acod1P54987 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Acod1P54987 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Acod1P54987 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Acod1P54987 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Acod1P54987 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Acod1P54987 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Acod1P54987 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Acod1P54987 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Acod1P54987 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Acod1P54987 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Acod1P54987 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Acod1P54987 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Acod1P54987 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Acod1P54987 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Acod1P54987 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Acod1P54987 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Acod1P54987 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acod1P54987 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acod1P54987 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acod1P54987 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Acod1P54987 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Acod1P54987 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Acod1P54987 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Acod1P54987 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Acod1P54987 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Acod1P54987 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Acod1P54987 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Acod1P54987 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Acod1P54987 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Acod1P54987 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Acod1P54987 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Acod1P54987 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Acod1P54987 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Acod1P54987 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Acod1P54987 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Acod1P54987 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Acod1P54987 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Acod1P54987 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Acod1P54987 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Acod1P54987 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Acod1P54987 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Acod1P54987 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Acod1P54987 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Acod1P54987 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Acod1P54987 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Acod1P54987 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Acod1P54987 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Acod1P54987 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Acod1P54987 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Acod1P54987 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Acod1P54987 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Acod1P54987 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Acod1P54987 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Acod1P54987 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Acod1P54987 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Acod1P54987 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Acod1P54987 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Acod1P54987 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Acod1P54987 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Acod1P54987 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Acod1P54987 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Acod1P54987 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Acod1P54987 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Acod1P54987 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Acod1P54987 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms