Protein–RNA interactions for Protein: P53978

HEF3, Elongation factor 3B, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HEF3P53978 BUD20YLR074C 501 nt9.87□□□□□ -0.83
HEF3P53978 MFT1YML062C 1179 nt9.87□□□□□ -0.83
HEF3P53978 HXT8YJL214W 1710 nt9.87□□□□□ -0.83
HEF3P53978 PUP3YER094C 618 nt9.86□□□□□ -0.83
HEF3P53978 EHT1YBR177C 1356 nt9.86□□□□□ -0.83
HEF3P53978 YIL168WYIL168W 384 nt9.85□□□□□ -0.83
HEF3P53978 FTH1YBR207W 1398 nt9.85□□□□□ -0.83
HEF3P53978 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt9.84□□□□□ -0.83
HEF3P53978 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt9.84□□□□□ -0.83
HEF3P53978 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt9.84□□□□□ -0.83
HEF3P53978 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt9.84□□□□□ -0.83
HEF3P53978 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt9.84□□□□□ -0.83
HEF3P53978 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt9.84□□□□□ -0.83
HEF3P53978 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt9.84□□□□□ -0.83
HEF3P53978 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt9.84□□□□□ -0.83
HEF3P53978 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt9.84□□□□□ -0.83
HEF3P53978 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt9.84□□□□□ -0.83
HEF3P53978 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt9.84□□□□□ -0.83
HEF3P53978 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt9.84□□□□□ -0.83
HEF3P53978 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt9.84□□□□□ -0.83
HEF3P53978 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt9.84□□□□□ -0.83
HEF3P53978 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt9.84□□□□□ -0.83
HEF3P53978 LEA1YPL213W 717 nt9.84□□□□□ -0.83
HEF3P53978 ELP4YPL101W 1371 nt9.84□□□□□ -0.83
HEF3P53978 YMR206WYMR206W 942 nt9.83□□□□□ -0.84
HEF3P53978 HIS3YOR202W 663 nt9.83□□□□□ -0.84
HEF3P53978 YPR084WYPR084W 1371 nt9.83□□□□□ -0.84
HEF3P53978 DIP5YPL265W 1827 nt9.81□□□□□ -0.84
HEF3P53978 JHD1YER051W 1479 nt9.8□□□□□ -0.84
HEF3P53978 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt9.8□□□□□ -0.84
HEF3P53978 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt9.8□□□□□ -0.84
HEF3P53978 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt9.8□□□□□ -0.84
HEF3P53978 SUP51tL(UAA)J 84 nt9.8□□□□□ -0.84
HEF3P53978 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt9.8□□□□□ -0.84
HEF3P53978 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt9.8□□□□□ -0.84
HEF3P53978 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt9.8□□□□□ -0.84
HEF3P53978 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt9.8□□□□□ -0.84
HEF3P53978 ATP2YJR121W 1536 nt9.8□□□□□ -0.84
HEF3P53978 BUD31YCR063W 474 nt9.78□□□□□ -0.84
HEF3P53978 KAE1YKR038C 1161 nt9.78□□□□□ -0.84
HEF3P53978 GDH1YOR375C 1365 nt9.77□□□□□ -0.84
HEF3P53978 MRP1YDR347W 966 nt9.77□□□□□ -0.85
HEF3P53978 ARO3YDR035W 1113 nt9.76□□□□□ -0.85
HEF3P53978 HRA1HRA1 564 nt9.76□□□□□ -0.85
HEF3P53978 YOR343CYOR343C 327 nt9.76□□□□□ -0.85
HEF3P53978 ALG7YBR243C 1347 nt9.76□□□□□ -0.85
HEF3P53978 TOS1YBR162C 1368 nt9.75□□□□□ -0.85
HEF3P53978 TIM50YPL063W 1431 nt9.74□□□□□ -0.85
HEF3P53978 TDH1YJL052W 999 nt9.74□□□□□ -0.85
HEF3P53978 RCF1YML030W 480 nt9.74□□□□□ -0.85
HEF3P53978 MRN1YPL184C 1839 nt9.74□□□□□ -0.85
HEF3P53978 TAD2YJL035C 753 nt9.73□□□□□ -0.85
HEF3P53978 NDE2YDL085W 1638 nt9.71□□□□□ -0.85
HEF3P53978 ADE1YAR015W 921 nt9.71□□□□□ -0.86
HEF3P53978 PRE10YOR362C 867 nt9.71□□□□□ -0.86
HEF3P53978 WSC4YHL028W 1818 nt9.7□□□□□ -0.86
HEF3P53978 MIM1YOL026C 342 nt9.7□□□□□ -0.86
HEF3P53978 APT1YML022W 564 nt9.69□□□□□ -0.86
HEF3P53978 SNP1YIL061C 903 nt9.68□□□□□ -0.86
HEF3P53978 MRP7YNL005C 1116 nt9.68□□□□□ -0.86
HEF3P53978 MTC6YHR151C 1581 nt9.67□□□□□ -0.86
HEF3P53978 GLY1YEL046C 1164 nt9.67□□□□□ -0.86
HEF3P53978 NCA3YJL116C 1014 nt9.67□□□□□ -0.86
HEF3P53978 TGL5YOR081C 2250 nt9.67□□□□□ -0.86
HEF3P53978 YJL043WYJL043W 774 nt9.65□□□□□ -0.86
HEF3P53978 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt9.65□□□□□ -0.86
HEF3P53978 HAC1YFL031W 717 nt9.64□□□□□ -0.87
HEF3P53978 TDA4YJR116W 840 nt9.64□□□□□ -0.87
HEF3P53978 ELP6YMR312W 822 nt9.64□□□□□ -0.87
HEF3P53978 YNL140CYNL140C 570 nt9.64□□□□□ -0.87
HEF3P53978 ORT1YOR130C 879 nt9.64□□□□□ -0.87
HEF3P53978 snR4snR4 186 nt9.64□□□□□ -0.87
HEF3P53978 WSC3YOL105C 1671 nt9.64□□□□□ -0.87
HEF3P53978 HBS1YKR084C 1836 nt9.63□□□□□ -0.87
HEF3P53978 DST1YGL043W 930 nt9.63□□□□□ -0.87
HEF3P53978 INM1YHR046C 888 nt9.63□□□□□ -0.87
HEF3P53978 NUP53YMR153W 1428 nt9.62□□□□□ -0.87
HEF3P53978 TIF3YPR163C 1311 nt9.61□□□□□ -0.87
HEF3P53978 DUR3YHL016C 2208 nt9.6□□□□□ -0.87
HEF3P53978 ARG7YMR062C 1326 nt9.6□□□□□ -0.87
HEF3P53978 PMU1YKL128C 888 nt9.6□□□□□ -0.87
HEF3P53978 YOR072WYOR072W 315 nt9.6□□□□□ -0.87
HEF3P53978 RRT6YGL146C 936 nt9.59□□□□□ -0.87
HEF3P53978 YGR137WYGR137W 375 nt9.57□□□□□ -0.88
HEF3P53978 MNN9YPL050C 1188 nt9.57□□□□□ -0.88
HEF3P53978 PSP2YML017W 1782 nt9.57□□□□□ -0.88
HEF3P53978 PNS1YOR161C 1620 nt9.56□□□□□ -0.88
HEF3P53978 RPL12BYDR418W 498 nt9.56□□□□□ -0.88
HEF3P53978 MEX67YPL169C 1800 nt9.55□□□□□ -0.88
HEF3P53978 TPO1YLL028W 1761 nt9.55□□□□□ -0.88
HEF3P53978 PET494YNR045W 1470 nt9.54□□□□□ -0.88
HEF3P53978 FRE6YLL051C 2139 nt9.54□□□□□ -0.88
HEF3P53978 ALD5YER073W 1563 nt9.54□□□□□ -0.88
HEF3P53978 SPR1YOR190W 1338 nt9.54□□□□□ -0.88
HEF3P53978 KTR4YBR199W 1395 nt9.53□□□□□ -0.88
HEF3P53978 YML034C-AYML034C-A 399 nt9.53□□□□□ -0.88
HEF3P53978 ESBP6YNL125C 2022 nt9.53□□□□□ -0.88
HEF3P53978 HAM1YJR069C 594 nt9.52□□□□□ -0.89
HEF3P53978 FUS3YBL016W 1062 nt9.52□□□□□ -0.89
HEF3P53978 AOS1YPR180W 1044 nt9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 77.9 ms