Protein–RNA interactions for Protein: P40501

AVT7, Vacuolar amino acid transporter 7, yeastyeast

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT7P40501 YLR280CYLR280C 351 nt7.19□□□□□ -1.26
AVT7P40501 FTH1YBR207W 1398 nt7.19□□□□□ -1.26
AVT7P40501 ALR1YOL130W 2580 nt7.18□□□□□ -1.26
AVT7P40501 YPT11YNL304W 1254 nt7.18□□□□□ -1.26
AVT7P40501 ERO1YML130C 1692 nt7.18□□□□□ -1.26
AVT7P40501 ADE16YLR028C 1776 nt7.17□□□□□ -1.26
AVT7P40501 VBA3YCL069W 1377 nt7.17□□□□□ -1.26
AVT7P40501 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.16□□□□□ -1.26
AVT7P40501 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.16□□□□□ -1.26
AVT7P40501 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.16□□□□□ -1.26
AVT7P40501 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.16□□□□□ -1.26
AVT7P40501 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.16□□□□□ -1.26
AVT7P40501 YGR210CYGR210C 1236 nt7.16□□□□□ -1.26
AVT7P40501 YJL009WYJL009W 327 nt7.16□□□□□ -1.26
AVT7P40501 TOM71YHR117W 1920 nt7.16□□□□□ -1.26
AVT7P40501 FCY1YPR062W 477 nt7.15□□□□□ -1.26
AVT7P40501 DIA4YHR011W 1341 nt7.15□□□□□ -1.26
AVT7P40501 BUD20YLR074C 501 nt7.14□□□□□ -1.27
AVT7P40501 DUS3YLR401C 2007 nt7.14□□□□□ -1.27
AVT7P40501 HIS3YOR202W 663 nt7.14□□□□□ -1.27
AVT7P40501 ABP1YCR088W 1779 nt7.12□□□□□ -1.27
AVT7P40501 MET30YIL046W 1923 nt7.11□□□□□ -1.27
AVT7P40501 YIR035CYIR035C 765 nt7.1□□□□□ -1.27
AVT7P40501 YPL108WYPL108W 507 nt7.1□□□□□ -1.27
AVT7P40501 HEM14YER014W 1620 nt7.09□□□□□ -1.27
AVT7P40501 RSM7YJR113C 744 nt7.09□□□□□ -1.27
AVT7P40501 YJR149WYJR149W 1215 nt7.09□□□□□ -1.27
AVT7P40501 YBR056WYBR056W 1506 nt7.09□□□□□ -1.27
AVT7P40501 YFR020WYFR020W 699 nt7.08□□□□□ -1.28
AVT7P40501 BUB2YMR055C 921 nt7.08□□□□□ -1.28
AVT7P40501 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.07□□□□□ -1.28
AVT7P40501 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.07□□□□□ -1.28
AVT7P40501 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.07□□□□□ -1.28
AVT7P40501 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt7.07□□□□□ -1.28
AVT7P40501 YOR343CYOR343C 327 nt7.07□□□□□ -1.28
AVT7P40501 MEP1YGR121C 1479 nt7.06□□□□□ -1.28
AVT7P40501 YNL190WYNL190W 615 nt7.06□□□□□ -1.28
AVT7P40501 PAU21YOR394W 495 nt7.06□□□□□ -1.28
AVT7P40501 PAU22YPL282C 495 nt7.06□□□□□ -1.28
AVT7P40501 PFS2YNL317W 1398 nt7.06□□□□□ -1.28
AVT7P40501 TIF3YPR163C 1311 nt7.05□□□□□ -1.28
AVT7P40501 GRH1YDR517W 1119 nt7.05□□□□□ -1.28
AVT7P40501 HRA1HRA1 564 nt7.05□□□□□ -1.28
AVT7P40501 MDH2YOL126C 1134 nt7.05□□□□□ -1.28
AVT7P40501 NDE2YDL085W 1638 nt7.05□□□□□ -1.28
AVT7P40501 YNL140CYNL140C 570 nt7.04□□□□□ -1.28
AVT7P40501 FRA1YLL029W 2250 nt7.04□□□□□ -1.28
AVT7P40501 RPL12BYDR418W 498 nt7.03□□□□□ -1.28
AVT7P40501 YJL160CYJL160C 864 nt7.03□□□□□ -1.28
AVT7P40501 YMR166CYMR166C 1107 nt7.03□□□□□ -1.28
AVT7P40501 BUD31YCR063W 474 nt7.02□□□□□ -1.29
AVT7P40501 YLR460CYLR460C 1131 nt7.02□□□□□ -1.29
AVT7P40501 HSV2YGR223C 1347 nt7.01□□□□□ -1.29
AVT7P40501 INO1YJL153C 1602 nt7.01□□□□□ -1.29
AVT7P40501 GLY1YEL046C 1164 nt7.01□□□□□ -1.29
AVT7P40501 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt7.01□□□□□ -1.29
AVT7P40501 LSP1YPL004C 1026 nt7.01□□□□□ -1.29
AVT7P40501 INM1YHR046C 888 nt7□□□□□ -1.29
AVT7P40501 TGL5YOR081C 2250 nt6.99□□□□□ -1.29
AVT7P40501 MAS1YLR163C 1389 nt6.99□□□□□ -1.29
AVT7P40501 SLM3YDL033C 1254 nt6.99□□□□□ -1.29
AVT7P40501 MRP1YDR347W 966 nt6.99□□□□□ -1.29
AVT7P40501 MCM5YLR274W 2328 nt6.99□□□□□ -1.29
AVT7P40501 MRN1YPL184C 1839 nt6.97□□□□□ -1.29
AVT7P40501 CHS7YHR142W 951 nt6.97□□□□□ -1.29
AVT7P40501 TDA4YJR116W 840 nt6.97□□□□□ -1.29
AVT7P40501 LAS17YOR181W 1902 nt6.97□□□□□ -1.29
AVT7P40501 RRT14YIL127C 621 nt6.96□□□□□ -1.3
AVT7P40501 NSG2YNL156C 900 nt6.96□□□□□ -1.3
AVT7P40501 MFT1YML062C 1179 nt6.95□□□□□ -1.3
AVT7P40501 PMT7YDR307W 1989 nt6.95□□□□□ -1.3
AVT7P40501 EHT1YBR177C 1356 nt6.95□□□□□ -1.3
AVT7P40501 CAK1YFL029C 1107 nt6.94□□□□□ -1.3
AVT7P40501 OLA1YBR025C 1185 nt6.94□□□□□ -1.3
AVT7P40501 LRO1YNR008W 1986 nt6.93□□□□□ -1.3
AVT7P40501 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt6.93□□□□□ -1.3
AVT7P40501 RPL2AYFR031C-A 765 nt6.93□□□□□ -1.3
AVT7P40501 GDH1YOR375C 1365 nt6.93□□□□□ -1.3
AVT7P40501 OCH1YGL038C 1443 nt6.93□□□□□ -1.3
AVT7P40501 DIP5YPL265W 1827 nt6.92□□□□□ -1.3
AVT7P40501 PET18YCR020C 648 nt6.92□□□□□ -1.3
AVT7P40501 AIM34YMR003W 597 nt6.92□□□□□ -1.3
AVT7P40501 YPR084WYPR084W 1371 nt6.92□□□□□ -1.3
AVT7P40501 KTR4YBR199W 1395 nt6.92□□□□□ -1.3
AVT7P40501 YER156CYER156C 1017 nt6.9□□□□□ -1.3
AVT7P40501 YGR137WYGR137W 375 nt6.9□□□□□ -1.3
AVT7P40501 RCF1YML030W 480 nt6.9□□□□□ -1.3
AVT7P40501 RNA170RNA170 169 nt6.9□□□□□ -1.3
AVT7P40501 MRP7YNL005C 1116 nt6.9□□□□□ -1.3
AVT7P40501 YOR268CYOR268C 399 nt6.9□□□□□ -1.3
AVT7P40501 ADA2YDR448W 1305 nt6.9□□□□□ -1.3
AVT7P40501 WSC3YOL105C 1671 nt6.9□□□□□ -1.31
AVT7P40501 MET22YOL064C 1074 nt6.89□□□□□ -1.31
AVT7P40501 WSC4YHL028W 1818 nt6.89□□□□□ -1.31
AVT7P40501 TAD2YJL035C 753 nt6.88□□□□□ -1.31
AVT7P40501 YMR206WYMR206W 942 nt6.88□□□□□ -1.31
AVT7P40501 RSC4YKR008W 1878 nt6.87□□□□□ -1.31
AVT7P40501 MET13YGL125W 1803 nt6.87□□□□□ -1.31
AVT7P40501 GGC1YDL198C 903 nt6.87□□□□□ -1.31
AVT7P40501 UTR5YEL035C 501 nt6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 54.4 ms