Protein–RNA interactions for Protein: P38176

AVT5, Vacuolar amino acid transporter 5, yeastyeast

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT5P38176 MET1YKR069W 1782 nt6.8□□□□□ -1.32
AVT5P38176 POT1YIL160C 1254 nt6.79□□□□□ -1.32
AVT5P38176 HIS3YOR202W 663 nt6.79□□□□□ -1.32
AVT5P38176 CDC13YDL220C 2775 nt6.78□□□□□ -1.32
AVT5P38176 GGA2YHR108W 1758 nt6.77□□□□□ -1.33
AVT5P38176 SGF73YGL066W 1974 nt6.77□□□□□ -1.33
AVT5P38176 MET13YGL125W 1803 nt6.76□□□□□ -1.33
AVT5P38176 LEU2YCL018W 1095 nt6.75□□□□□ -1.33
AVT5P38176 KGD2YDR148C 1392 nt6.74□□□□□ -1.33
AVT5P38176 LYS20YDL182W 1287 nt6.74□□□□□ -1.33
AVT5P38176 GNP1YDR508C 1992 nt6.73□□□□□ -1.33
AVT5P38176 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt6.73□□□□□ -1.33
AVT5P38176 YKL053WYKL053W 375 nt6.73□□□□□ -1.33
AVT5P38176 RPL12BYDR418W 498 nt6.72□□□□□ -1.33
AVT5P38176 SBP1YHL034C 885 nt6.72□□□□□ -1.33
AVT5P38176 YLR030WYLR030W 792 nt6.72□□□□□ -1.33
AVT5P38176 GSF2YML048W 1212 nt6.72□□□□□ -1.33
AVT5P38176 EDC3YEL015W 1656 nt6.71□□□□□ -1.33
AVT5P38176 TPC1YGR096W 945 nt6.71□□□□□ -1.34
AVT5P38176 ADH6YMR318C 1083 nt6.71□□□□□ -1.34
AVT5P38176 MET8YBR213W 825 nt6.71□□□□□ -1.34
AVT5P38176 SAN1YDR143C 1833 nt6.71□□□□□ -1.34
AVT5P38176 PPS1YBR276C 2424 nt6.7□□□□□ -1.34
AVT5P38176 YKR018CYKR018C 2178 nt6.7□□□□□ -1.34
AVT5P38176 YNL140CYNL140C 570 nt6.7□□□□□ -1.34
AVT5P38176 STE4YOR212W 1272 nt6.7□□□□□ -1.34
AVT5P38176 SRP54YPR088C 1626 nt6.69□□□□□ -1.34
AVT5P38176 TRR1YDR353W 960 nt6.69□□□□□ -1.34
AVT5P38176 RPL2AYFR031C-A 765 nt6.69□□□□□ -1.34
AVT5P38176 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt6.69□□□□□ -1.34
AVT5P38176 TIF3YPR163C 1311 nt6.69□□□□□ -1.34
AVT5P38176 NAM8YHR086W 1572 nt6.69□□□□□ -1.34
AVT5P38176 TUB4YLR212C 1422 nt6.68□□□□□ -1.34
AVT5P38176 CPD1YGR247W 720 nt6.67□□□□□ -1.34
AVT5P38176 PRB1YEL060C 1908 nt6.67□□□□□ -1.34
AVT5P38176 RSC9YML127W 1746 nt6.67□□□□□ -1.34
AVT5P38176 NIF3YGL221C 867 nt6.66□□□□□ -1.34
AVT5P38176 KRE1YNL322C 942 nt6.66□□□□□ -1.34
AVT5P38176 YOR389WYOR389W 1875 nt6.66□□□□□ -1.34
AVT5P38176 ICL2YPR006C 1728 nt6.65□□□□□ -1.34
AVT5P38176 REX2YLR059C 810 nt6.65□□□□□ -1.34
AVT5P38176 YLR349WYLR349W 507 nt6.65□□□□□ -1.34
AVT5P38176 YPT11YNL304W 1254 nt6.65□□□□□ -1.34
AVT5P38176 CMK2YOL016C 1344 nt6.65□□□□□ -1.35
AVT5P38176 GAS1YMR307W 1680 nt6.65□□□□□ -1.35
AVT5P38176 FSH2YMR222C 672 nt6.64□□□□□ -1.35
AVT5P38176 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt6.64□□□□□ -1.35
AVT5P38176 RCF2YNR018W 675 nt6.63□□□□□ -1.35
AVT5P38176 SPE2YOL052C 1191 nt6.63□□□□□ -1.35
AVT5P38176 RFS1YBR052C 633 nt6.63□□□□□ -1.35
AVT5P38176 MRN1YPL184C 1839 nt6.63□□□□□ -1.35
AVT5P38176 AAC3YBR085W 924 nt6.63□□□□□ -1.35
AVT5P38176 THP3YPR045C 1413 nt6.62□□□□□ -1.35
AVT5P38176 PTC6YCR079W 1329 nt6.62□□□□□ -1.35
AVT5P38176 AGP2YBR132C 1791 nt6.62□□□□□ -1.35
AVT5P38176 TOD6YBL054W 1578 nt6.61□□□□□ -1.35
AVT5P38176 YJL009WYJL009W 327 nt6.61□□□□□ -1.35
AVT5P38176 MAL31YBR298C 1845 nt6.6□□□□□ -1.35
AVT5P38176 CKI1YLR133W 1749 nt6.6□□□□□ -1.35
AVT5P38176 PPZ2YDR436W 2133 nt6.6□□□□□ -1.35
AVT5P38176 YCR061WYCR061W 1896 nt6.6□□□□□ -1.35
AVT5P38176 SSC1YJR045C 1965 nt6.59□□□□□ -1.35
AVT5P38176 INO1YJL153C 1602 nt6.59□□□□□ -1.35
AVT5P38176 PAR32YDL173W 888 nt6.59□□□□□ -1.35
AVT5P38176 INM1YHR046C 888 nt6.59□□□□□ -1.35
AVT5P38176 YEL023CYEL023C 2049 nt6.59□□□□□ -1.36
AVT5P38176 VTS1YOR359W 1572 nt6.58□□□□□ -1.36
AVT5P38176 RMD8YFR048W 1989 nt6.58□□□□□ -1.36
AVT5P38176 TMS1YDR105C 1422 nt6.58□□□□□ -1.36
AVT5P38176 SEC24YIL109C 2781 nt6.57□□□□□ -1.36
AVT5P38176 SRF1YDL133W 1314 nt6.57□□□□□ -1.36
AVT5P38176 PAB1YER165W 1734 nt6.57□□□□□ -1.36
AVT5P38176 YKR012CYKR012C 378 nt6.57□□□□□ -1.36
AVT5P38176 MEP1YGR121C 1479 nt6.57□□□□□ -1.36
AVT5P38176 BAP3YDR046C 1815 nt6.57□□□□□ -1.36
AVT5P38176 ADH7YCR105W 1086 nt6.56□□□□□ -1.36
AVT5P38176 STF1YDL130W-A 261 nt6.56□□□□□ -1.36
AVT5P38176 GLY1YEL046C 1164 nt6.56□□□□□ -1.36
AVT5P38176 NAS2YIL007C 663 nt6.56□□□□□ -1.36
AVT5P38176 RSM7YJR113C 744 nt6.56□□□□□ -1.36
AVT5P38176 LRO1YNR008W 1986 nt6.56□□□□□ -1.36
AVT5P38176 STP3YLR375W 1032 nt6.55□□□□□ -1.36
AVT5P38176 SDS24YBR214W 1584 nt6.55□□□□□ -1.36
AVT5P38176 KTR4YBR199W 1395 nt6.55□□□□□ -1.36
AVT5P38176 YIR035CYIR035C 765 nt6.54□□□□□ -1.36
AVT5P38176 YOR041CYOR041C 432 nt6.54□□□□□ -1.36
AVT5P38176 ACO1YLR304C 2337 nt6.54□□□□□ -1.36
AVT5P38176 TGL5YOR081C 2250 nt6.53□□□□□ -1.36
AVT5P38176 GUT1YHL032C 2130 nt6.53□□□□□ -1.36
AVT5P38176 GNA1YFL017C 480 nt6.53□□□□□ -1.36
AVT5P38176 PAU5YFL020C 369 nt6.53□□□□□ -1.36
AVT5P38176 PAU15YIR041W 375 nt6.53□□□□□ -1.36
AVT5P38176 VBA3YCL069W 1377 nt6.53□□□□□ -1.36
AVT5P38176 IGD1YFR017C 588 nt6.52□□□□□ -1.37
AVT5P38176 TPO1YLL028W 1761 nt6.52□□□□□ -1.37
AVT5P38176 NAS6YGR232W 687 nt6.51□□□□□ -1.37
AVT5P38176 CDD1YLR245C 429 nt6.51□□□□□ -1.37
AVT5P38176 PMT1YDL095W 2454 nt6.51□□□□□ -1.37
AVT5P38176 ENO1YGR254W 1314 nt6.5□□□□□ -1.37
AVT5P38176 TOS2YGR221C 1869 nt6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 54.9 ms