Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Cnga1P29974 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Cnga1P29974 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Cnga1P29974 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Cnga1P29974 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Cnga1P29974 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
Cnga1P29974 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Cnga1P29974 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Cnga1P29974 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Cnga1P29974 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Cnga1P29974 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Cnga1P29974 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Cnga1P29974 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Cnga1P29974 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Cnga1P29974 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Cnga1P29974 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Cnga1P29974 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Cnga1P29974 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Cnga1P29974 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Cnga1P29974 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Cnga1P29974 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Cnga1P29974 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Cnga1P29974 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Cnga1P29974 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Cnga1P29974 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Cnga1P29974 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Cnga1P29974 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Cnga1P29974 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Cnga1P29974 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Cnga1P29974 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Cnga1P29974 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Cnga1P29974 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Cnga1P29974 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Cnga1P29974 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Cnga1P29974 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Cnga1P29974 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Cnga1P29974 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cnga1P29974 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cnga1P29974 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Cnga1P29974 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Cnga1P29974 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Cnga1P29974 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Cnga1P29974 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Cnga1P29974 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Cnga1P29974 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Cnga1P29974 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Cnga1P29974 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Cnga1P29974 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Cnga1P29974 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Cnga1P29974 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Cnga1P29974 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Cnga1P29974 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Cnga1P29974 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Cnga1P29974 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Cnga1P29974 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
Cnga1P29974 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
Cnga1P29974 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Cnga1P29974 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Cnga1P29974 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Cnga1P29974 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Cnga1P29974 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Cnga1P29974 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Cnga1P29974 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Cnga1P29974 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Cnga1P29974 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Cnga1P29974 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Cnga1P29974 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Cnga1P29974 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Cnga1P29974 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Cnga1P29974 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cnga1P29974 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Cnga1P29974 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Cnga1P29974 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Cnga1P29974 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Cnga1P29974 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Cnga1P29974 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Cnga1P29974 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Cnga1P29974 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cnga1P29974 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cnga1P29974 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Cnga1P29974 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Cnga1P29974 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Cnga1P29974 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Cnga1P29974 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Cnga1P29974 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Cnga1P29974 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Cnga1P29974 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Cnga1P29974 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cnga1P29974 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cnga1P29974 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cnga1P29974 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Cnga1P29974 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cnga1P29974 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Cnga1P29974 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Cnga1P29974 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Cnga1P29974 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Cnga1P29974 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Cnga1P29974 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Cnga1P29974 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Cnga1P29974 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms