Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ntf3P20181 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ntf3P20181 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ntf3P20181 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ntf3P20181 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ntf3P20181 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ntf3P20181 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ntf3P20181 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ntf3P20181 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ntf3P20181 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ntf3P20181 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ntf3P20181 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ntf3P20181 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ntf3P20181 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ntf3P20181 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ntf3P20181 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ntf3P20181 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ntf3P20181 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ntf3P20181 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ntf3P20181 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ntf3P20181 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ntf3P20181 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ntf3P20181 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ntf3P20181 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ntf3P20181 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ntf3P20181 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ntf3P20181 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ntf3P20181 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ntf3P20181 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ntf3P20181 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ntf3P20181 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ntf3P20181 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ntf3P20181 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ntf3P20181 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ntf3P20181 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ntf3P20181 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ntf3P20181 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ntf3P20181 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ntf3P20181 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ntf3P20181 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ntf3P20181 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ntf3P20181 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ntf3P20181 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ntf3P20181 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ntf3P20181 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ntf3P20181 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ntf3P20181 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ntf3P20181 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ntf3P20181 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ntf3P20181 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ntf3P20181 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ntf3P20181 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ntf3P20181 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ntf3P20181 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ntf3P20181 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ntf3P20181 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ntf3P20181 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ntf3P20181 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ntf3P20181 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ntf3P20181 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ntf3P20181 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ntf3P20181 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ntf3P20181 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ntf3P20181 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ntf3P20181 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ntf3P20181 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ntf3P20181 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ntf3P20181 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ntf3P20181 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ntf3P20181 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ntf3P20181 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ntf3P20181 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ntf3P20181 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ntf3P20181 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ntf3P20181 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ntf3P20181 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ntf3P20181 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ntf3P20181 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ntf3P20181 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ntf3P20181 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ntf3P20181 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ntf3P20181 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ntf3P20181 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ntf3P20181 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ntf3P20181 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ntf3P20181 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ntf3P20181 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ntf3P20181 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ntf3P20181 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ntf3P20181 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ntf3P20181 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ntf3P20181 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ntf3P20181 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ntf3P20181 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ntf3P20181 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ntf3P20181 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ntf3P20181 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ntf3P20181 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ntf3P20181 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ntf3P20181 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 203 ms