Protein–RNA interactions for Protein: P19783

Cox4i1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox4i1P19783 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cox4i1P19783 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cox4i1P19783 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cox4i1P19783 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cox4i1P19783 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cox4i1P19783 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cox4i1P19783 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cox4i1P19783 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cox4i1P19783 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cox4i1P19783 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cox4i1P19783 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cox4i1P19783 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cox4i1P19783 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cox4i1P19783 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cox4i1P19783 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cox4i1P19783 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cox4i1P19783 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cox4i1P19783 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cox4i1P19783 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cox4i1P19783 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cox4i1P19783 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cox4i1P19783 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cox4i1P19783 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cox4i1P19783 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cox4i1P19783 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cox4i1P19783 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cox4i1P19783 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cox4i1P19783 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cox4i1P19783 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cox4i1P19783 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cox4i1P19783 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cox4i1P19783 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cox4i1P19783 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cox4i1P19783 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cox4i1P19783 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cox4i1P19783 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cox4i1P19783 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cox4i1P19783 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cox4i1P19783 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cox4i1P19783 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cox4i1P19783 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cox4i1P19783 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cox4i1P19783 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cox4i1P19783 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cox4i1P19783 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cox4i1P19783 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cox4i1P19783 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cox4i1P19783 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cox4i1P19783 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cox4i1P19783 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cox4i1P19783 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cox4i1P19783 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cox4i1P19783 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cox4i1P19783 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cox4i1P19783 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cox4i1P19783 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cox4i1P19783 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cox4i1P19783 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cox4i1P19783 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Cox4i1P19783 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cox4i1P19783 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Cox4i1P19783 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cox4i1P19783 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cox4i1P19783 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cox4i1P19783 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cox4i1P19783 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cox4i1P19783 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cox4i1P19783 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cox4i1P19783 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cox4i1P19783 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cox4i1P19783 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cox4i1P19783 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cox4i1P19783 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cox4i1P19783 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cox4i1P19783 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cox4i1P19783 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cox4i1P19783 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cox4i1P19783 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cox4i1P19783 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cox4i1P19783 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cox4i1P19783 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cox4i1P19783 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cox4i1P19783 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cox4i1P19783 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cox4i1P19783 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cox4i1P19783 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cox4i1P19783 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cox4i1P19783 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cox4i1P19783 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cox4i1P19783 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cox4i1P19783 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cox4i1P19783 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cox4i1P19783 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cox4i1P19783 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Cox4i1P19783 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cox4i1P19783 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cox4i1P19783 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cox4i1P19783 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cox4i1P19783 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cox4i1P19783 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms