Protein–RNA interactions for Protein: O88978

Lrrc6, Protein tilB homolog, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc6O88978 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrc6O88978 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrc6O88978 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrc6O88978 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrrc6O88978 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrrc6O88978 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrrc6O88978 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrc6O88978 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrc6O88978 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrc6O88978 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrc6O88978 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrc6O88978 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrc6O88978 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrc6O88978 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrc6O88978 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrc6O88978 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrc6O88978 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrc6O88978 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrc6O88978 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrc6O88978 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrrc6O88978 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrrc6O88978 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrrc6O88978 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrc6O88978 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrc6O88978 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrc6O88978 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrc6O88978 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrc6O88978 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrc6O88978 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrc6O88978 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrc6O88978 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrc6O88978 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrc6O88978 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrc6O88978 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrc6O88978 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrc6O88978 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrc6O88978 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrc6O88978 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrrc6O88978 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrrc6O88978 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lrrc6O88978 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lrrc6O88978 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lrrc6O88978 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Lrrc6O88978 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrrc6O88978 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrrc6O88978 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrrc6O88978 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrrc6O88978 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrrc6O88978 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrc6O88978 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrc6O88978 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrc6O88978 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrc6O88978 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrc6O88978 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrc6O88978 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrc6O88978 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrc6O88978 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrc6O88978 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrc6O88978 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrc6O88978 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrc6O88978 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrc6O88978 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrc6O88978 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrc6O88978 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrc6O88978 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrc6O88978 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrc6O88978 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrc6O88978 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrrc6O88978 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lrrc6O88978 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrc6O88978 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrc6O88978 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrc6O88978 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrc6O88978 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrc6O88978 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrc6O88978 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrc6O88978 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrc6O88978 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrc6O88978 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrc6O88978 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrc6O88978 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrc6O88978 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrc6O88978 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrc6O88978 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrc6O88978 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrc6O88978 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrc6O88978 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrc6O88978 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrc6O88978 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrc6O88978 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrc6O88978 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrc6O88978 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrc6O88978 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrc6O88978 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrc6O88978 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrc6O88978 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrc6O88978 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrc6O88978 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrc6O88978 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrc6O88978 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms