Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ChkaO54804 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ChkaO54804 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ChkaO54804 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ChkaO54804 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ChkaO54804 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ChkaO54804 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ChkaO54804 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ChkaO54804 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ChkaO54804 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ChkaO54804 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ChkaO54804 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ChkaO54804 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ChkaO54804 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ChkaO54804 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ChkaO54804 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ChkaO54804 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ChkaO54804 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ChkaO54804 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ChkaO54804 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ChkaO54804 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ChkaO54804 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ChkaO54804 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ChkaO54804 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ChkaO54804 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ChkaO54804 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ChkaO54804 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ChkaO54804 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ChkaO54804 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ChkaO54804 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ChkaO54804 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ChkaO54804 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ChkaO54804 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ChkaO54804 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ChkaO54804 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ChkaO54804 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ChkaO54804 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ChkaO54804 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ChkaO54804 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ChkaO54804 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ChkaO54804 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ChkaO54804 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ChkaO54804 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ChkaO54804 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ChkaO54804 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ChkaO54804 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ChkaO54804 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ChkaO54804 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ChkaO54804 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ChkaO54804 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ChkaO54804 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ChkaO54804 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ChkaO54804 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ChkaO54804 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ChkaO54804 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ChkaO54804 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ChkaO54804 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ChkaO54804 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ChkaO54804 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ChkaO54804 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ChkaO54804 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ChkaO54804 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
ChkaO54804 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
ChkaO54804 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ChkaO54804 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ChkaO54804 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ChkaO54804 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ChkaO54804 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ChkaO54804 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ChkaO54804 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ChkaO54804 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ChkaO54804 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ChkaO54804 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ChkaO54804 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ChkaO54804 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ChkaO54804 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ChkaO54804 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ChkaO54804 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ChkaO54804 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ChkaO54804 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ChkaO54804 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ChkaO54804 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ChkaO54804 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ChkaO54804 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ChkaO54804 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ChkaO54804 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ChkaO54804 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ChkaO54804 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ChkaO54804 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ChkaO54804 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ChkaO54804 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ChkaO54804 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ChkaO54804 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ChkaO54804 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ChkaO54804 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ChkaO54804 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ChkaO54804 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ChkaO54804 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ChkaO54804 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ChkaO54804 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms