Protein–RNA interactions for Protein: O35235

Tnfsf11, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf11O35235 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfsf11O35235 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfsf11O35235 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfsf11O35235 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnfsf11O35235 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnfsf11O35235 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnfsf11O35235 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf11O35235 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf11O35235 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf11O35235 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf11O35235 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf11O35235 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf11O35235 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf11O35235 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf11O35235 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf11O35235 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf11O35235 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf11O35235 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf11O35235 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfsf11O35235 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf11O35235 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf11O35235 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf11O35235 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf11O35235 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf11O35235 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf11O35235 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf11O35235 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf11O35235 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf11O35235 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf11O35235 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf11O35235 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf11O35235 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf11O35235 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfsf11O35235 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfsf11O35235 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfsf11O35235 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfsf11O35235 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfsf11O35235 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfsf11O35235 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfsf11O35235 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfsf11O35235 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tnfsf11O35235 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsf11O35235 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsf11O35235 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsf11O35235 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsf11O35235 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsf11O35235 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf11O35235 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf11O35235 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf11O35235 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf11O35235 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf11O35235 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf11O35235 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf11O35235 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf11O35235 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf11O35235 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf11O35235 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf11O35235 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf11O35235 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf11O35235 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfsf11O35235 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfsf11O35235 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfsf11O35235 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfsf11O35235 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfsf11O35235 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfsf11O35235 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfsf11O35235 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfsf11O35235 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfsf11O35235 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfsf11O35235 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfsf11O35235 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfsf11O35235 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfsf11O35235 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfsf11O35235 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfsf11O35235 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfsf11O35235 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfsf11O35235 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfsf11O35235 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfsf11O35235 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf11O35235 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf11O35235 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf11O35235 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf11O35235 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf11O35235 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf11O35235 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfsf11O35235 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfsf11O35235 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfsf11O35235 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfsf11O35235 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfsf11O35235 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfsf11O35235 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf11O35235 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf11O35235 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf11O35235 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf11O35235 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf11O35235 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf11O35235 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf11O35235 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf11O35235 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf11O35235 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms