Protein–RNA interactions for Protein: M0QW81

Gm3488, Predicted gene, 3488, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3488M0QW81 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm3488M0QW81 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm3488M0QW81 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm3488M0QW81 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm3488M0QW81 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm3488M0QW81 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm3488M0QW81 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm3488M0QW81 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm3488M0QW81 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm3488M0QW81 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm3488M0QW81 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm3488M0QW81 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm3488M0QW81 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm3488M0QW81 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm3488M0QW81 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm3488M0QW81 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm3488M0QW81 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm3488M0QW81 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm3488M0QW81 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm3488M0QW81 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm3488M0QW81 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm3488M0QW81 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm3488M0QW81 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm3488M0QW81 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm3488M0QW81 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm3488M0QW81 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm3488M0QW81 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm3488M0QW81 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm3488M0QW81 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm3488M0QW81 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm3488M0QW81 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm3488M0QW81 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm3488M0QW81 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm3488M0QW81 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm3488M0QW81 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm3488M0QW81 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm3488M0QW81 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm3488M0QW81 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm3488M0QW81 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm3488M0QW81 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm3488M0QW81 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm3488M0QW81 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm3488M0QW81 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm3488M0QW81 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm3488M0QW81 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gm3488M0QW81 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm3488M0QW81 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm3488M0QW81 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm3488M0QW81 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm3488M0QW81 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3488M0QW81 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3488M0QW81 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3488M0QW81 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3488M0QW81 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm3488M0QW81 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm3488M0QW81 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm3488M0QW81 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm3488M0QW81 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm3488M0QW81 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm3488M0QW81 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm3488M0QW81 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm3488M0QW81 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm3488M0QW81 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm3488M0QW81 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm3488M0QW81 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm3488M0QW81 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm3488M0QW81 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm3488M0QW81 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm3488M0QW81 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3488M0QW81 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3488M0QW81 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3488M0QW81 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3488M0QW81 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3488M0QW81 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3488M0QW81 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3488M0QW81 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3488M0QW81 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3488M0QW81 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3488M0QW81 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3488M0QW81 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3488M0QW81 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3488M0QW81 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3488M0QW81 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3488M0QW81 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3488M0QW81 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3488M0QW81 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3488M0QW81 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3488M0QW81 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3488M0QW81 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3488M0QW81 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3488M0QW81 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3488M0QW81 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3488M0QW81 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3488M0QW81 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3488M0QW81 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3488M0QW81 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3488M0QW81 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3488M0QW81 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3488M0QW81 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3488M0QW81 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms