Protein–RNA interactions for Protein: L7N2A2

Gm8906, Predicted gene 8906 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8906L7N2A2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8906L7N2A2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm8906L7N2A2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm8906L7N2A2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm8906L7N2A2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm8906L7N2A2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm8906L7N2A2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm8906L7N2A2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm8906L7N2A2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm8906L7N2A2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm8906L7N2A2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm8906L7N2A2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm8906L7N2A2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm8906L7N2A2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm8906L7N2A2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8906L7N2A2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8906L7N2A2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gm8906L7N2A2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8906L7N2A2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8906L7N2A2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8906L7N2A2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8906L7N2A2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8906L7N2A2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm8906L7N2A2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8906L7N2A2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8906L7N2A2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8906L7N2A2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8906L7N2A2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8906L7N2A2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm8906L7N2A2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm8906L7N2A2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm8906L7N2A2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm8906L7N2A2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm8906L7N2A2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm8906L7N2A2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm8906L7N2A2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm8906L7N2A2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm8906L7N2A2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm8906L7N2A2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm8906L7N2A2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm8906L7N2A2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm8906L7N2A2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm8906L7N2A2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm8906L7N2A2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm8906L7N2A2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm8906L7N2A2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm8906L7N2A2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm8906L7N2A2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm8906L7N2A2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm8906L7N2A2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm8906L7N2A2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm8906L7N2A2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm8906L7N2A2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm8906L7N2A2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm8906L7N2A2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm8906L7N2A2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm8906L7N2A2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm8906L7N2A2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm8906L7N2A2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm8906L7N2A2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm8906L7N2A2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm8906L7N2A2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm8906L7N2A2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm8906L7N2A2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm8906L7N2A2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm8906L7N2A2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm8906L7N2A2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm8906L7N2A2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm8906L7N2A2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm8906L7N2A2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm8906L7N2A2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm8906L7N2A2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm8906L7N2A2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm8906L7N2A2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm8906L7N2A2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm8906L7N2A2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm8906L7N2A2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm8906L7N2A2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm8906L7N2A2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm8906L7N2A2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm8906L7N2A2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm8906L7N2A2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm8906L7N2A2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm8906L7N2A2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm8906L7N2A2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm8906L7N2A2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm8906L7N2A2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm8906L7N2A2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm8906L7N2A2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm8906L7N2A2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm8906L7N2A2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm8906L7N2A2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm8906L7N2A2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm8906L7N2A2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm8906L7N2A2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm8906L7N2A2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm8906L7N2A2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm8906L7N2A2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm8906L7N2A2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm8906L7N2A2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms