Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
XntrpcF8VQM8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
XntrpcF8VQM8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
XntrpcF8VQM8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
XntrpcF8VQM8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
XntrpcF8VQM8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
XntrpcF8VQM8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
XntrpcF8VQM8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
XntrpcF8VQM8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
XntrpcF8VQM8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
XntrpcF8VQM8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
XntrpcF8VQM8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
XntrpcF8VQM8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
XntrpcF8VQM8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
XntrpcF8VQM8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
XntrpcF8VQM8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
XntrpcF8VQM8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
XntrpcF8VQM8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
XntrpcF8VQM8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
XntrpcF8VQM8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
XntrpcF8VQM8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
XntrpcF8VQM8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
XntrpcF8VQM8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
XntrpcF8VQM8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
XntrpcF8VQM8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
XntrpcF8VQM8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
XntrpcF8VQM8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
XntrpcF8VQM8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
XntrpcF8VQM8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
XntrpcF8VQM8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
XntrpcF8VQM8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
XntrpcF8VQM8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
XntrpcF8VQM8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
XntrpcF8VQM8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
XntrpcF8VQM8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
XntrpcF8VQM8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
XntrpcF8VQM8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
XntrpcF8VQM8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
XntrpcF8VQM8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
XntrpcF8VQM8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
XntrpcF8VQM8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
XntrpcF8VQM8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
XntrpcF8VQM8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
XntrpcF8VQM8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
XntrpcF8VQM8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
XntrpcF8VQM8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
XntrpcF8VQM8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
XntrpcF8VQM8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
XntrpcF8VQM8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
XntrpcF8VQM8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
XntrpcF8VQM8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
XntrpcF8VQM8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
XntrpcF8VQM8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
XntrpcF8VQM8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
XntrpcF8VQM8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XntrpcF8VQM8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XntrpcF8VQM8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XntrpcF8VQM8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
XntrpcF8VQM8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
XntrpcF8VQM8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
XntrpcF8VQM8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XntrpcF8VQM8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XntrpcF8VQM8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XntrpcF8VQM8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XntrpcF8VQM8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XntrpcF8VQM8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
XntrpcF8VQM8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XntrpcF8VQM8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
XntrpcF8VQM8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
XntrpcF8VQM8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
XntrpcF8VQM8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
XntrpcF8VQM8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
XntrpcF8VQM8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
XntrpcF8VQM8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
XntrpcF8VQM8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
XntrpcF8VQM8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
XntrpcF8VQM8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XntrpcF8VQM8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
XntrpcF8VQM8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
XntrpcF8VQM8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
XntrpcF8VQM8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
XntrpcF8VQM8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
XntrpcF8VQM8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
XntrpcF8VQM8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
XntrpcF8VQM8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
XntrpcF8VQM8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
XntrpcF8VQM8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
XntrpcF8VQM8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
XntrpcF8VQM8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
XntrpcF8VQM8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
XntrpcF8VQM8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
XntrpcF8VQM8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
XntrpcF8VQM8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
XntrpcF8VQM8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
XntrpcF8VQM8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
XntrpcF8VQM8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
XntrpcF8VQM8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
XntrpcF8VQM8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
XntrpcF8VQM8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
XntrpcF8VQM8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms