Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ07

5830473C10Rik, RIKEN cDNA 5830473C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5830473C10RikF8VQ07 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
5830473C10RikF8VQ07 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
5830473C10RikF8VQ07 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
5830473C10RikF8VQ07 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
5830473C10RikF8VQ07 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
5830473C10RikF8VQ07 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
5830473C10RikF8VQ07 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
5830473C10RikF8VQ07 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
5830473C10RikF8VQ07 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
5830473C10RikF8VQ07 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
5830473C10RikF8VQ07 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
5830473C10RikF8VQ07 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
5830473C10RikF8VQ07 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
5830473C10RikF8VQ07 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
5830473C10RikF8VQ07 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
5830473C10RikF8VQ07 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
5830473C10RikF8VQ07 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
5830473C10RikF8VQ07 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
5830473C10RikF8VQ07 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
5830473C10RikF8VQ07 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
5830473C10RikF8VQ07 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
5830473C10RikF8VQ07 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
5830473C10RikF8VQ07 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
5830473C10RikF8VQ07 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
5830473C10RikF8VQ07 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
5830473C10RikF8VQ07 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
5830473C10RikF8VQ07 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
5830473C10RikF8VQ07 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
5830473C10RikF8VQ07 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
5830473C10RikF8VQ07 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
5830473C10RikF8VQ07 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
5830473C10RikF8VQ07 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
5830473C10RikF8VQ07 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
5830473C10RikF8VQ07 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
5830473C10RikF8VQ07 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
5830473C10RikF8VQ07 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
5830473C10RikF8VQ07 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
5830473C10RikF8VQ07 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
5830473C10RikF8VQ07 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
5830473C10RikF8VQ07 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
5830473C10RikF8VQ07 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
5830473C10RikF8VQ07 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
5830473C10RikF8VQ07 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
5830473C10RikF8VQ07 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
5830473C10RikF8VQ07 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
5830473C10RikF8VQ07 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
5830473C10RikF8VQ07 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
5830473C10RikF8VQ07 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
5830473C10RikF8VQ07 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
5830473C10RikF8VQ07 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
5830473C10RikF8VQ07 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
5830473C10RikF8VQ07 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
5830473C10RikF8VQ07 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
5830473C10RikF8VQ07 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
5830473C10RikF8VQ07 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
5830473C10RikF8VQ07 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
5830473C10RikF8VQ07 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
5830473C10RikF8VQ07 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
5830473C10RikF8VQ07 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
5830473C10RikF8VQ07 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
5830473C10RikF8VQ07 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
5830473C10RikF8VQ07 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
5830473C10RikF8VQ07 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
5830473C10RikF8VQ07 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
5830473C10RikF8VQ07 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
5830473C10RikF8VQ07 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
5830473C10RikF8VQ07 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
5830473C10RikF8VQ07 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
5830473C10RikF8VQ07 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
5830473C10RikF8VQ07 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
5830473C10RikF8VQ07 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
5830473C10RikF8VQ07 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
5830473C10RikF8VQ07 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
5830473C10RikF8VQ07 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
5830473C10RikF8VQ07 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
5830473C10RikF8VQ07 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
5830473C10RikF8VQ07 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
5830473C10RikF8VQ07 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
5830473C10RikF8VQ07 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
5830473C10RikF8VQ07 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
5830473C10RikF8VQ07 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
5830473C10RikF8VQ07 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
5830473C10RikF8VQ07 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
5830473C10RikF8VQ07 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
5830473C10RikF8VQ07 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
5830473C10RikF8VQ07 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
5830473C10RikF8VQ07 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
5830473C10RikF8VQ07 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
5830473C10RikF8VQ07 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
5830473C10RikF8VQ07 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
5830473C10RikF8VQ07 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
5830473C10RikF8VQ07 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
5830473C10RikF8VQ07 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
5830473C10RikF8VQ07 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
5830473C10RikF8VQ07 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
5830473C10RikF8VQ07 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
5830473C10RikF8VQ07 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
5830473C10RikF8VQ07 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
5830473C10RikF8VQ07 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
5830473C10RikF8VQ07 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms