Protein–RNA interactions for Protein: F6YKI2

Gm8220, Predicted gene 8220 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8220F6YKI2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm8220F6YKI2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm8220F6YKI2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm8220F6YKI2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm8220F6YKI2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm8220F6YKI2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm8220F6YKI2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm8220F6YKI2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm8220F6YKI2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm8220F6YKI2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm8220F6YKI2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm8220F6YKI2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm8220F6YKI2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm8220F6YKI2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm8220F6YKI2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm8220F6YKI2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm8220F6YKI2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm8220F6YKI2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm8220F6YKI2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm8220F6YKI2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm8220F6YKI2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm8220F6YKI2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm8220F6YKI2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm8220F6YKI2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm8220F6YKI2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm8220F6YKI2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm8220F6YKI2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm8220F6YKI2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm8220F6YKI2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm8220F6YKI2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm8220F6YKI2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm8220F6YKI2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm8220F6YKI2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm8220F6YKI2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm8220F6YKI2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm8220F6YKI2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm8220F6YKI2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm8220F6YKI2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm8220F6YKI2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm8220F6YKI2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm8220F6YKI2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm8220F6YKI2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm8220F6YKI2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm8220F6YKI2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm8220F6YKI2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm8220F6YKI2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm8220F6YKI2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm8220F6YKI2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm8220F6YKI2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm8220F6YKI2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm8220F6YKI2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm8220F6YKI2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm8220F6YKI2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm8220F6YKI2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm8220F6YKI2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm8220F6YKI2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm8220F6YKI2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm8220F6YKI2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm8220F6YKI2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm8220F6YKI2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm8220F6YKI2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm8220F6YKI2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm8220F6YKI2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm8220F6YKI2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm8220F6YKI2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm8220F6YKI2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm8220F6YKI2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm8220F6YKI2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm8220F6YKI2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm8220F6YKI2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm8220F6YKI2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm8220F6YKI2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm8220F6YKI2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm8220F6YKI2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm8220F6YKI2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm8220F6YKI2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm8220F6YKI2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm8220F6YKI2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm8220F6YKI2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm8220F6YKI2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm8220F6YKI2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm8220F6YKI2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm8220F6YKI2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm8220F6YKI2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm8220F6YKI2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm8220F6YKI2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm8220F6YKI2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm8220F6YKI2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm8220F6YKI2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm8220F6YKI2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm8220F6YKI2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm8220F6YKI2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm8220F6YKI2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm8220F6YKI2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm8220F6YKI2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm8220F6YKI2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm8220F6YKI2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm8220F6YKI2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm8220F6YKI2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm8220F6YKI2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms