Protein–RNA interactions for Protein: E9Q366

Speer4f2, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4f2, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f2E9Q366 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Speer4f2E9Q366 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Speer4f2E9Q366 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Speer4f2E9Q366 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Speer4f2E9Q366 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Speer4f2E9Q366 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Speer4f2E9Q366 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Speer4f2E9Q366 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Speer4f2E9Q366 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Speer4f2E9Q366 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Speer4f2E9Q366 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Speer4f2E9Q366 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Speer4f2E9Q366 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Speer4f2E9Q366 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Speer4f2E9Q366 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Speer4f2E9Q366 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Speer4f2E9Q366 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Speer4f2E9Q366 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Speer4f2E9Q366 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Speer4f2E9Q366 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Speer4f2E9Q366 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Speer4f2E9Q366 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Speer4f2E9Q366 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Speer4f2E9Q366 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Speer4f2E9Q366 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Speer4f2E9Q366 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Speer4f2E9Q366 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Speer4f2E9Q366 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Speer4f2E9Q366 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Speer4f2E9Q366 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Speer4f2E9Q366 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Speer4f2E9Q366 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Speer4f2E9Q366 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Speer4f2E9Q366 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Speer4f2E9Q366 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Speer4f2E9Q366 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Speer4f2E9Q366 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Speer4f2E9Q366 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Speer4f2E9Q366 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Speer4f2E9Q366 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Speer4f2E9Q366 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Speer4f2E9Q366 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Speer4f2E9Q366 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Speer4f2E9Q366 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Speer4f2E9Q366 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Speer4f2E9Q366 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Speer4f2E9Q366 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Speer4f2E9Q366 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Speer4f2E9Q366 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Speer4f2E9Q366 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Speer4f2E9Q366 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Speer4f2E9Q366 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Speer4f2E9Q366 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Speer4f2E9Q366 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Speer4f2E9Q366 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Speer4f2E9Q366 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Speer4f2E9Q366 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Speer4f2E9Q366 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Speer4f2E9Q366 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Speer4f2E9Q366 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Speer4f2E9Q366 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Speer4f2E9Q366 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Speer4f2E9Q366 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Speer4f2E9Q366 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Speer4f2E9Q366 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Speer4f2E9Q366 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Speer4f2E9Q366 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Speer4f2E9Q366 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Speer4f2E9Q366 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Speer4f2E9Q366 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Speer4f2E9Q366 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Speer4f2E9Q366 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Speer4f2E9Q366 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Speer4f2E9Q366 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Speer4f2E9Q366 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Speer4f2E9Q366 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Speer4f2E9Q366 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Speer4f2E9Q366 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Speer4f2E9Q366 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Speer4f2E9Q366 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Speer4f2E9Q366 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Speer4f2E9Q366 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Speer4f2E9Q366 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Speer4f2E9Q366 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Speer4f2E9Q366 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Speer4f2E9Q366 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Speer4f2E9Q366 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Speer4f2E9Q366 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Speer4f2E9Q366 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Speer4f2E9Q366 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Speer4f2E9Q366 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Speer4f2E9Q366 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Speer4f2E9Q366 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Speer4f2E9Q366 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Speer4f2E9Q366 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Speer4f2E9Q366 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Speer4f2E9Q366 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Speer4f2E9Q366 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Speer4f2E9Q366 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Speer4f2E9Q366 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 362.5 ms