Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
2610021A01RikE9Q0Q3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
2610021A01RikE9Q0Q3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
2610021A01RikE9Q0Q3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
2610021A01RikE9Q0Q3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
2610021A01RikE9Q0Q3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
2610021A01RikE9Q0Q3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
2610021A01RikE9Q0Q3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.31■■□□□ 1
2610021A01RikE9Q0Q3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
2610021A01RikE9Q0Q3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
2610021A01RikE9Q0Q3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
2610021A01RikE9Q0Q3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
2610021A01RikE9Q0Q3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
2610021A01RikE9Q0Q3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
2610021A01RikE9Q0Q3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
2610021A01RikE9Q0Q3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
2610021A01RikE9Q0Q3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
2610021A01RikE9Q0Q3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
2610021A01RikE9Q0Q3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.28■■□□□ 1
2610021A01RikE9Q0Q3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
2610021A01RikE9Q0Q3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
2610021A01RikE9Q0Q3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
2610021A01RikE9Q0Q3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
2610021A01RikE9Q0Q3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
2610021A01RikE9Q0Q3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
2610021A01RikE9Q0Q3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
2610021A01RikE9Q0Q3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
2610021A01RikE9Q0Q3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
2610021A01RikE9Q0Q3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
2610021A01RikE9Q0Q3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
2610021A01RikE9Q0Q3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
2610021A01RikE9Q0Q3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
2610021A01RikE9Q0Q3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
2610021A01RikE9Q0Q3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
2610021A01RikE9Q0Q3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
2610021A01RikE9Q0Q3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
2610021A01RikE9Q0Q3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
2610021A01RikE9Q0Q3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
2610021A01RikE9Q0Q3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
2610021A01RikE9Q0Q3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
2610021A01RikE9Q0Q3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
2610021A01RikE9Q0Q3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
2610021A01RikE9Q0Q3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
2610021A01RikE9Q0Q3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
2610021A01RikE9Q0Q3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
2610021A01RikE9Q0Q3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
2610021A01RikE9Q0Q3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
2610021A01RikE9Q0Q3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
2610021A01RikE9Q0Q3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
2610021A01RikE9Q0Q3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
2610021A01RikE9Q0Q3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
2610021A01RikE9Q0Q3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
2610021A01RikE9Q0Q3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
2610021A01RikE9Q0Q3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
2610021A01RikE9Q0Q3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
2610021A01RikE9Q0Q3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
2610021A01RikE9Q0Q3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
2610021A01RikE9Q0Q3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
2610021A01RikE9Q0Q3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
2610021A01RikE9Q0Q3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
2610021A01RikE9Q0Q3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
2610021A01RikE9Q0Q3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
2610021A01RikE9Q0Q3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
2610021A01RikE9Q0Q3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
2610021A01RikE9Q0Q3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
2610021A01RikE9Q0Q3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
2610021A01RikE9Q0Q3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
2610021A01RikE9Q0Q3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
2610021A01RikE9Q0Q3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
2610021A01RikE9Q0Q3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
2610021A01RikE9Q0Q3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
2610021A01RikE9Q0Q3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
2610021A01RikE9Q0Q3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
2610021A01RikE9Q0Q3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
2610021A01RikE9Q0Q3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
2610021A01RikE9Q0Q3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
2610021A01RikE9Q0Q3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
2610021A01RikE9Q0Q3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
2610021A01RikE9Q0Q3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
2610021A01RikE9Q0Q3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
2610021A01RikE9Q0Q3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms