Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prrt4B2RU40 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prrt4B2RU40 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prrt4B2RU40 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prrt4B2RU40 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prrt4B2RU40 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prrt4B2RU40 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Prrt4B2RU40 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prrt4B2RU40 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prrt4B2RU40 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prrt4B2RU40 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prrt4B2RU40 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prrt4B2RU40 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prrt4B2RU40 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prrt4B2RU40 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prrt4B2RU40 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prrt4B2RU40 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prrt4B2RU40 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prrt4B2RU40 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prrt4B2RU40 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prrt4B2RU40 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prrt4B2RU40 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prrt4B2RU40 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prrt4B2RU40 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prrt4B2RU40 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prrt4B2RU40 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prrt4B2RU40 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prrt4B2RU40 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prrt4B2RU40 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prrt4B2RU40 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Prrt4B2RU40 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prrt4B2RU40 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prrt4B2RU40 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prrt4B2RU40 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prrt4B2RU40 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prrt4B2RU40 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prrt4B2RU40 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prrt4B2RU40 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prrt4B2RU40 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prrt4B2RU40 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prrt4B2RU40 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prrt4B2RU40 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Prrt4B2RU40 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prrt4B2RU40 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prrt4B2RU40 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prrt4B2RU40 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prrt4B2RU40 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prrt4B2RU40 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prrt4B2RU40 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prrt4B2RU40 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prrt4B2RU40 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prrt4B2RU40 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Prrt4B2RU40 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prrt4B2RU40 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prrt4B2RU40 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prrt4B2RU40 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prrt4B2RU40 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prrt4B2RU40 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prrt4B2RU40 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Prrt4B2RU40 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prrt4B2RU40 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prrt4B2RU40 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prrt4B2RU40 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prrt4B2RU40 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prrt4B2RU40 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prrt4B2RU40 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prrt4B2RU40 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prrt4B2RU40 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prrt4B2RU40 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prrt4B2RU40 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prrt4B2RU40 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prrt4B2RU40 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prrt4B2RU40 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prrt4B2RU40 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prrt4B2RU40 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prrt4B2RU40 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Prrt4B2RU40 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prrt4B2RU40 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prrt4B2RU40 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prrt4B2RU40 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Prrt4B2RU40 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prrt4B2RU40 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prrt4B2RU40 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prrt4B2RU40 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prrt4B2RU40 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prrt4B2RU40 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Prrt4B2RU40 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prrt4B2RU40 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prrt4B2RU40 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prrt4B2RU40 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prrt4B2RU40 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prrt4B2RU40 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prrt4B2RU40 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prrt4B2RU40 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prrt4B2RU40 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prrt4B2RU40 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prrt4B2RU40 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prrt4B2RU40 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prrt4B2RU40 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prrt4B2RU40 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms