Protein–RNA interactions for Protein: B1AUF7

1700042G07Rik, MCG1049117, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700042G07RikB1AUF7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700042G07RikB1AUF7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700042G07RikB1AUF7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700042G07RikB1AUF7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700042G07RikB1AUF7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
1700042G07RikB1AUF7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
1700042G07RikB1AUF7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
1700042G07RikB1AUF7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
1700042G07RikB1AUF7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.35
1700042G07RikB1AUF7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
1700042G07RikB1AUF7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700042G07RikB1AUF7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
1700042G07RikB1AUF7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700042G07RikB1AUF7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700042G07RikB1AUF7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700042G07RikB1AUF7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700042G07RikB1AUF7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700042G07RikB1AUF7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
1700042G07RikB1AUF7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700042G07RikB1AUF7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
1700042G07RikB1AUF7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700042G07RikB1AUF7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700042G07RikB1AUF7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
1700042G07RikB1AUF7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700042G07RikB1AUF7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700042G07RikB1AUF7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700042G07RikB1AUF7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
1700042G07RikB1AUF7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700042G07RikB1AUF7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700042G07RikB1AUF7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700042G07RikB1AUF7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700042G07RikB1AUF7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700042G07RikB1AUF7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700042G07RikB1AUF7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700042G07RikB1AUF7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700042G07RikB1AUF7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
1700042G07RikB1AUF7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700042G07RikB1AUF7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700042G07RikB1AUF7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700042G07RikB1AUF7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
1700042G07RikB1AUF7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
1700042G07RikB1AUF7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700042G07RikB1AUF7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700042G07RikB1AUF7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700042G07RikB1AUF7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
1700042G07RikB1AUF7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700042G07RikB1AUF7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700042G07RikB1AUF7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700042G07RikB1AUF7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700042G07RikB1AUF7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700042G07RikB1AUF7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
1700042G07RikB1AUF7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
1700042G07RikB1AUF7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
1700042G07RikB1AUF7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
1700042G07RikB1AUF7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
1700042G07RikB1AUF7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
1700042G07RikB1AUF7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
1700042G07RikB1AUF7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
1700042G07RikB1AUF7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
1700042G07RikB1AUF7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
1700042G07RikB1AUF7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
1700042G07RikB1AUF7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
1700042G07RikB1AUF7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
1700042G07RikB1AUF7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
1700042G07RikB1AUF7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
1700042G07RikB1AUF7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
1700042G07RikB1AUF7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
1700042G07RikB1AUF7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
1700042G07RikB1AUF7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
1700042G07RikB1AUF7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
1700042G07RikB1AUF7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
1700042G07RikB1AUF7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
1700042G07RikB1AUF7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
1700042G07RikB1AUF7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
1700042G07RikB1AUF7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
1700042G07RikB1AUF7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
1700042G07RikB1AUF7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
1700042G07RikB1AUF7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
1700042G07RikB1AUF7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
1700042G07RikB1AUF7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
1700042G07RikB1AUF7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
1700042G07RikB1AUF7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
1700042G07RikB1AUF7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
1700042G07RikB1AUF7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
1700042G07RikB1AUF7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700042G07RikB1AUF7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700042G07RikB1AUF7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700042G07RikB1AUF7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700042G07RikB1AUF7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700042G07RikB1AUF7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700042G07RikB1AUF7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700042G07RikB1AUF7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700042G07RikB1AUF7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
1700042G07RikB1AUF7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700042G07RikB1AUF7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700042G07RikB1AUF7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700042G07RikB1AUF7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700042G07RikB1AUF7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700042G07RikB1AUF7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700042G07RikB1AUF7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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