Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Odf2A3KGV1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Odf2A3KGV1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Odf2A3KGV1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Odf2A3KGV1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Odf2A3KGV1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Odf2A3KGV1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Odf2A3KGV1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Odf2A3KGV1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Odf2A3KGV1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Odf2A3KGV1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Odf2A3KGV1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Odf2A3KGV1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Odf2A3KGV1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Odf2A3KGV1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Odf2A3KGV1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Odf2A3KGV1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Odf2A3KGV1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Odf2A3KGV1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Odf2A3KGV1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Odf2A3KGV1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Odf2A3KGV1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Odf2A3KGV1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Odf2A3KGV1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Odf2A3KGV1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Odf2A3KGV1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Odf2A3KGV1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Odf2A3KGV1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Odf2A3KGV1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Odf2A3KGV1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Odf2A3KGV1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Odf2A3KGV1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Odf2A3KGV1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Odf2A3KGV1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Odf2A3KGV1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Odf2A3KGV1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Odf2A3KGV1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Odf2A3KGV1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Odf2A3KGV1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Odf2A3KGV1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Odf2A3KGV1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Odf2A3KGV1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Odf2A3KGV1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Odf2A3KGV1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Odf2A3KGV1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Odf2A3KGV1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Odf2A3KGV1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Odf2A3KGV1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Odf2A3KGV1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Odf2A3KGV1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Odf2A3KGV1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Odf2A3KGV1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Odf2A3KGV1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Odf2A3KGV1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Odf2A3KGV1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Odf2A3KGV1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Odf2A3KGV1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Odf2A3KGV1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Odf2A3KGV1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Odf2A3KGV1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Odf2A3KGV1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Odf2A3KGV1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Odf2A3KGV1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Odf2A3KGV1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Odf2A3KGV1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Odf2A3KGV1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Odf2A3KGV1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Odf2A3KGV1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Odf2A3KGV1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Odf2A3KGV1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Odf2A3KGV1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Odf2A3KGV1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Odf2A3KGV1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Odf2A3KGV1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Odf2A3KGV1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Odf2A3KGV1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Odf2A3KGV1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Odf2A3KGV1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Odf2A3KGV1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Odf2A3KGV1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Odf2A3KGV1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Odf2A3KGV1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Odf2A3KGV1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Odf2A3KGV1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Odf2A3KGV1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Odf2A3KGV1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Odf2A3KGV1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Odf2A3KGV1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Odf2A3KGV1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Odf2A3KGV1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Odf2A3KGV1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Odf2A3KGV1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Odf2A3KGV1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Odf2A3KGV1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Odf2A3KGV1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Odf2A3KGV1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Odf2A3KGV1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Odf2A3KGV1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Odf2A3KGV1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Odf2A3KGV1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms