Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ckap5A2AGT5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ckap5A2AGT5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ckap5A2AGT5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ckap5A2AGT5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ckap5A2AGT5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ckap5A2AGT5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ckap5A2AGT5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ckap5A2AGT5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ckap5A2AGT5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ckap5A2AGT5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ckap5A2AGT5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ckap5A2AGT5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ckap5A2AGT5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ckap5A2AGT5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ckap5A2AGT5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ckap5A2AGT5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ckap5A2AGT5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ckap5A2AGT5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ckap5A2AGT5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ckap5A2AGT5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ckap5A2AGT5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ckap5A2AGT5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ckap5A2AGT5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ckap5A2AGT5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ckap5A2AGT5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ckap5A2AGT5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ckap5A2AGT5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ckap5A2AGT5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ckap5A2AGT5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ckap5A2AGT5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ckap5A2AGT5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ckap5A2AGT5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ckap5A2AGT5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ckap5A2AGT5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ckap5A2AGT5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ckap5A2AGT5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ckap5A2AGT5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ckap5A2AGT5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ckap5A2AGT5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ckap5A2AGT5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ckap5A2AGT5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ckap5A2AGT5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ckap5A2AGT5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ckap5A2AGT5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ckap5A2AGT5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ckap5A2AGT5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ckap5A2AGT5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ckap5A2AGT5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ckap5A2AGT5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ckap5A2AGT5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ckap5A2AGT5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ckap5A2AGT5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ckap5A2AGT5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ckap5A2AGT5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ckap5A2AGT5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ckap5A2AGT5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ckap5A2AGT5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ckap5A2AGT5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ckap5A2AGT5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ckap5A2AGT5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ckap5A2AGT5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ckap5A2AGT5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ckap5A2AGT5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ckap5A2AGT5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ckap5A2AGT5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ckap5A2AGT5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ckap5A2AGT5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ckap5A2AGT5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ckap5A2AGT5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ckap5A2AGT5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ckap5A2AGT5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ckap5A2AGT5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ckap5A2AGT5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ckap5A2AGT5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ckap5A2AGT5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ckap5A2AGT5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ckap5A2AGT5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ckap5A2AGT5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ckap5A2AGT5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ckap5A2AGT5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ckap5A2AGT5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ckap5A2AGT5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ckap5A2AGT5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ckap5A2AGT5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ckap5A2AGT5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ckap5A2AGT5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ckap5A2AGT5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ckap5A2AGT5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ckap5A2AGT5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ckap5A2AGT5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ckap5A2AGT5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ckap5A2AGT5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ckap5A2AGT5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ckap5A2AGT5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ckap5A2AGT5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ckap5A2AGT5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ckap5A2AGT5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ckap5A2AGT5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ckap5A2AGT5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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