Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtprfA2A8L5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtprfA2A8L5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtprfA2A8L5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtprfA2A8L5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PtprfA2A8L5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprfA2A8L5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprfA2A8L5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprfA2A8L5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtprfA2A8L5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PtprfA2A8L5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtprfA2A8L5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtprfA2A8L5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtprfA2A8L5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtprfA2A8L5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtprfA2A8L5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtprfA2A8L5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtprfA2A8L5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtprfA2A8L5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PtprfA2A8L5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtprfA2A8L5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtprfA2A8L5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtprfA2A8L5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtprfA2A8L5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtprfA2A8L5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtprfA2A8L5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtprfA2A8L5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtprfA2A8L5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtprfA2A8L5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtprfA2A8L5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtprfA2A8L5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprfA2A8L5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprfA2A8L5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprfA2A8L5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprfA2A8L5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprfA2A8L5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtprfA2A8L5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprfA2A8L5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtprfA2A8L5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtprfA2A8L5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtprfA2A8L5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtprfA2A8L5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtprfA2A8L5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtprfA2A8L5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtprfA2A8L5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprfA2A8L5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprfA2A8L5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprfA2A8L5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprfA2A8L5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprfA2A8L5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtprfA2A8L5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtprfA2A8L5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PtprfA2A8L5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PtprfA2A8L5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprfA2A8L5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprfA2A8L5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprfA2A8L5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtprfA2A8L5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtprfA2A8L5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprfA2A8L5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprfA2A8L5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprfA2A8L5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprfA2A8L5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprfA2A8L5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprfA2A8L5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtprfA2A8L5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtprfA2A8L5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtprfA2A8L5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PtprfA2A8L5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PtprfA2A8L5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprfA2A8L5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprfA2A8L5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprfA2A8L5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprfA2A8L5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprfA2A8L5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprfA2A8L5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprfA2A8L5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprfA2A8L5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprfA2A8L5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprfA2A8L5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprfA2A8L5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtprfA2A8L5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PtprfA2A8L5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PtprfA2A8L5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtprfA2A8L5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtprfA2A8L5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtprfA2A8L5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtprfA2A8L5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtprfA2A8L5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtprfA2A8L5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtprfA2A8L5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PtprfA2A8L5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtprfA2A8L5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtprfA2A8L5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PtprfA2A8L5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtprfA2A8L5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprfA2A8L5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprfA2A8L5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprfA2A8L5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprfA2A8L5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms