Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H9

Igkv1-132, Immunoglobulin kappa variable 1-132 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Igkv1-132A0A0B4J1H9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Igkv1-132A0A0B4J1H9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Igkv1-132A0A0B4J1H9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Igkv1-132A0A0B4J1H9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Igkv1-132A0A0B4J1H9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Igkv1-132A0A0B4J1H9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Igkv1-132A0A0B4J1H9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Igkv1-132A0A0B4J1H9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Igkv1-132A0A0B4J1H9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Igkv1-132A0A0B4J1H9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms