Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sdr16c6Q05A13 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms