Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms