Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V9

Putative uncharacterized protein ENSP00000334305, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3C1V9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q3C1V9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q3C1V9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q3C1V9 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q3C1V9 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q3C1V9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q3C1V9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q3C1V9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3C1V9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3C1V9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3C1V9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3C1V9 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3C1V9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3C1V9 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3C1V9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3C1V9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3C1V9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3C1V9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3C1V9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3C1V9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3C1V9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3C1V9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3C1V9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3C1V9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3C1V9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3C1V9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3C1V9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3C1V9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3C1V9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3C1V9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3C1V9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3C1V9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3C1V9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3C1V9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3C1V9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3C1V9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3C1V9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3C1V9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3C1V9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3C1V9 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3C1V9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3C1V9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3C1V9 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3C1V9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3C1V9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3C1V9 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3C1V9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3C1V9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3C1V9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3C1V9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3C1V9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3C1V9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3C1V9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3C1V9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3C1V9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3C1V9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3C1V9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3C1V9 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3C1V9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3C1V9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3C1V9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3C1V9 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3C1V9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3C1V9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3C1V9 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3C1V9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3C1V9 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3C1V9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3C1V9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3C1V9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3C1V9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3C1V9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3C1V9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3C1V9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3C1V9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3C1V9 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q3C1V9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q3C1V9 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q3C1V9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q3C1V9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q3C1V9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Q3C1V9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q3C1V9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q3C1V9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q3C1V9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q3C1V9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q3C1V9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q3C1V9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q3C1V9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q3C1V9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q3C1V9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q3C1V9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q3C1V9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q3C1V9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q3C1V9 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q3C1V9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q3C1V9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q3C1V9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q3C1V9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q3C1V9 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms