Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00205P59089 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms