Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpv2Q9WTR1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.8 ms