Protein–RNA interactions for Protein: Q12745

SEC39, Protein transport protein SEC39, yeastyeast

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC39Q12745 YJL150WYJL150W 303 nt0.22□□□□□ -2.37
SEC39Q12745 YBR099CYBR099C 384 nt0.21□□□□□ -2.38
SEC39Q12745 RPM2YML091C 3609 nt0.21□□□□□ -2.38
SEC39Q12745 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt0.19□□□□□ -2.38
SEC39Q12745 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.19□□□□□ -2.38
SEC39Q12745 snR48snR48 113 nt0.17□□□□□ -2.38
SEC39Q12745 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt0.14□□□□□ -2.39
SEC39Q12745 snR39BsnR39B 96 nt0.13□□□□□ -2.39
SEC39Q12745 SOV1YMR066W 2697 nt0.12□□□□□ -2.39
SEC39Q12745 EST1YLR233C 2100 nt0.11□□□□□ -2.39
SEC39Q12745 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt0.11□□□□□ -2.39
SEC39Q12745 YOR102WYOR102W 351 nt0.1□□□□□ -2.39
SEC39Q12745 snR45snR45 172 nt0.1□□□□□ -2.39
SEC39Q12745 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt0.07□□□□□ -2.4
SEC39Q12745 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt0.06□□□□□ -2.4
SEC39Q12745 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt0.06□□□□□ -2.4
SEC39Q12745 YNL198CYNL198C 303 nt0.04□□□□□ -2.4
SEC39Q12745 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt0.02□□□□□ -2.41
SEC39Q12745 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt0□□□□□ -2.41
SEC39Q12745 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt0□□□□□ -2.41
SEC39Q12745 YBL053WYBL053W 375 nt0□□□□□ -2.41
SEC39Q12745 snR128snR128 126 nt-0.01□□□□□ -2.41
SEC39Q12745 YGR151CYGR151C 336 nt-0.02□□□□□ -2.41
SEC39Q12745 snR69snR69 101 nt-0.03□□□□□ -2.41
SEC39Q12745 PMP2YEL017C-A 132 nt-0.05□□□□□ -2.42
SEC39Q12745 YGR164WYGR164W 336 nt-0.06□□□□□ -2.42
SEC39Q12745 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt-0.08□□□□□ -2.42
SEC39Q12745 YNL205CYNL205C 423 nt-0.08□□□□□ -2.42
SEC39Q12745 YNL337WYNL337W 255 nt-0.08□□□□□ -2.42
SEC39Q12745 TFB5YDR079C-A 219 nt-0.11□□□□□ -2.43
SEC39Q12745 YNL338WYNL338W 159 nt-0.13□□□□□ -2.43
SEC39Q12745 RDS3YPR094W 324 nt-0.13□□□□□ -2.43
SEC39Q12745 SEC10YLR166C 2616 nt-0.17□□□□□ -2.44
SEC39Q12745 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-0.19□□□□□ -2.44
SEC39Q12745 SBH2YER019C-A 267 nt-0.21□□□□□ -2.44
SEC39Q12745 YBR178WYBR178W 375 nt-0.21□□□□□ -2.44
SEC39Q12745 Q0032Q0032 291 nt-0.23□□□□□ -2.45
SEC39Q12745 SOM1YEL059C-A 225 nt-0.24□□□□□ -2.45
SEC39Q12745 YER090C-AYER090C-A 90 nt-0.24□□□□□ -2.45
SEC39Q12745 YML100W-AYML100W-A 174 nt-0.25□□□□□ -2.45
SEC39Q12745 YNL266WYNL266W 420 nt-0.25□□□□□ -2.45
SEC39Q12745 snR50snR50 90 nt-0.26□□□□□ -2.45
SEC39Q12745 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt-0.27□□□□□ -2.45
SEC39Q12745 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-0.28□□□□□ -2.45
SEC39Q12745 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt-0.31□□□□□ -2.46
SEC39Q12745 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-0.31□□□□□ -2.46
SEC39Q12745 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt-0.31□□□□□ -2.46
SEC39Q12745 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.31□□□□□ -2.46
SEC39Q12745 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-0.32□□□□□ -2.46
SEC39Q12745 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt-0.41□□□□□ -2.48
SEC39Q12745 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-0.42□□□□□ -2.48
SEC39Q12745 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.44□□□□□ -2.48
SEC39Q12745 snR67snR67 82 nt-0.45□□□□□ -2.48
SEC39Q12745 YOR225WYOR225W 330 nt-0.45□□□□□ -2.48
SEC39Q12745 YLR294CYLR294C 330 nt-0.5□□□□□ -2.49
SEC39Q12745 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.52□□□□□ -2.49
SEC39Q12745 URB1YKL014C 5295 nt-0.54□□□□□ -2.5
SEC39Q12745 YML054C-AYML054C-A 159 nt-0.61□□□□□ -2.51
SEC39Q12745 SKI7YOR076C 2244 nt-0.61□□□□□ -2.51
SEC39Q12745 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-0.67□□□□□ -2.52
SEC39Q12745 snR161snR161 161 nt-0.69□□□□□ -2.52
SEC39Q12745 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-0.7□□□□□ -2.52
SEC39Q12745 snR33snR33 183 nt-0.72□□□□□ -2.52
SEC39Q12745 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-0.76□□□□□ -2.53
SEC39Q12745 YNL170WYNL170W 396 nt-0.78□□□□□ -2.53
SEC39Q12745 YNR077CYNR077C 255 nt-0.78□□□□□ -2.53
SEC39Q12745 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-0.79□□□□□ -2.54
SEC39Q12745 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.8□□□□□ -2.54
SEC39Q12745 snR81snR81 201 nt-0.84□□□□□ -2.54
SEC39Q12745 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.85□□□□□ -2.55
SEC39Q12745 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.85□□□□□ -2.55
SEC39Q12745 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.85□□□□□ -2.55
SEC39Q12745 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-0.86□□□□□ -2.55
SEC39Q12745 RPL41AYDL184C 78 nt-0.9□□□□□ -2.55
SEC39Q12745 ATP8Q0080 147 nt-0.9□□□□□ -2.55
SEC39Q12745 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-0.91□□□□□ -2.56
SEC39Q12745 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-0.93□□□□□ -2.56
SEC39Q12745 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-0.93□□□□□ -2.56
SEC39Q12745 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt-0.94□□□□□ -2.56
SEC39Q12745 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-0.95□□□□□ -2.56
SEC39Q12745 snR47snR47 99 nt-0.95□□□□□ -2.56
SEC39Q12745 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.96□□□□□ -2.56
SEC39Q12745 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt-0.97□□□□□ -2.56
SEC39Q12745 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-0.97□□□□□ -2.56
SEC39Q12745 snR61snR61 90 nt-0.98□□□□□ -2.57
SEC39Q12745 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-1□□□□□ -2.57
SEC39Q12745 snR38snR38 95 nt-1.02□□□□□ -2.57
SEC39Q12745 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.06□□□□□ -2.58
SEC39Q12745 snR77snR77 88 nt-1.07□□□□□ -2.58
SEC39Q12745 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-1.1□□□□□ -2.59
SEC39Q12745 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-1.11□□□□□ -2.59
SEC39Q12745 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-1.11□□□□□ -2.59
SEC39Q12745 Q0092Q0092 141 nt-1.12□□□□□ -2.59
SEC39Q12745 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-1.19□□□□□ -2.6
SEC39Q12745 YKL225WYKL225W 348 nt-1.21□□□□□ -2.6
SEC39Q12745 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-1.25□□□□□ -2.61
SEC39Q12745 Q0143Q0143 153 nt-1.29□□□□□ -2.62
SEC39Q12745 snR62snR62 100 nt-1.3□□□□□ -2.62
SEC39Q12745 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.39□□□□□ -2.63
SEC39Q12745 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-1.46□□□□□ -2.64
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