Protein–RNA interactions for Protein: Q12461

RRD2, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator 2, yeastyeast

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRD2Q12461 RPS26AYGL189C 360 nt0.47□□□□□ -2.33
RRD2Q12461 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt0.47□□□□□ -2.33
RRD2Q12461 GLG1YKR058W 1851 nt0.47□□□□□ -2.33
RRD2Q12461 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt0.46□□□□□ -2.34
RRD2Q12461 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt0.46□□□□□ -2.34
RRD2Q12461 Q0032Q0032 291 nt0.45□□□□□ -2.34
RRD2Q12461 YOR225WYOR225W 330 nt0.44□□□□□ -2.34
RRD2Q12461 snR39BsnR39B 96 nt0.44□□□□□ -2.34
RRD2Q12461 NIP1YMR309C 2439 nt0.44□□□□□ -2.34
RRD2Q12461 snR48snR48 113 nt0.43□□□□□ -2.34
RRD2Q12461 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt0.39□□□□□ -2.35
RRD2Q12461 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt0.39□□□□□ -2.35
RRD2Q12461 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.39□□□□□ -2.35
RRD2Q12461 YLR294CYLR294C 330 nt0.38□□□□□ -2.35
RRD2Q12461 RCO1YMR075W 2055 nt0.32□□□□□ -2.36
RRD2Q12461 MLP2YIL149C 5040 nt0.3□□□□□ -2.36
RRD2Q12461 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt0.3□□□□□ -2.36
RRD2Q12461 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.26□□□□□ -2.37
RRD2Q12461 YBR099CYBR099C 384 nt0.26□□□□□ -2.37
RRD2Q12461 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.25□□□□□ -2.37
RRD2Q12461 EST1YLR233C 2100 nt0.23□□□□□ -2.37
RRD2Q12461 SOM1YEL059C-A 225 nt0.23□□□□□ -2.37
RRD2Q12461 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.23□□□□□ -2.37
RRD2Q12461 RPM2YML091C 3609 nt0.22□□□□□ -2.37
RRD2Q12461 YGR164WYGR164W 336 nt0.22□□□□□ -2.37
RRD2Q12461 YNL205CYNL205C 423 nt0.22□□□□□ -2.37
RRD2Q12461 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt0.22□□□□□ -2.37
RRD2Q12461 PMP2YEL017C-A 132 nt0.21□□□□□ -2.38
RRD2Q12461 snR69snR69 101 nt0.2□□□□□ -2.38
RRD2Q12461 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt0.2□□□□□ -2.38
RRD2Q12461 ESP1YGR098C 4893 nt0.2□□□□□ -2.38
RRD2Q12461 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt0.18□□□□□ -2.38
RRD2Q12461 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt0.17□□□□□ -2.38
RRD2Q12461 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt0.16□□□□□ -2.38
RRD2Q12461 YBR178WYBR178W 375 nt0.16□□□□□ -2.38
RRD2Q12461 snR45snR45 172 nt0.16□□□□□ -2.38
RRD2Q12461 SEC10YLR166C 2616 nt0.15□□□□□ -2.39
RRD2Q12461 YNL266WYNL266W 420 nt0.14□□□□□ -2.39
RRD2Q12461 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt0.12□□□□□ -2.39
RRD2Q12461 YNL170WYNL170W 396 nt0.12□□□□□ -2.39
RRD2Q12461 snR128snR128 126 nt0.11□□□□□ -2.39
RRD2Q12461 RDS3YPR094W 324 nt0.11□□□□□ -2.39
RRD2Q12461 SOV1YMR066W 2697 nt0.1□□□□□ -2.39
RRD2Q12461 ATP8Q0080 147 nt0.08□□□□□ -2.4
RRD2Q12461 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt0.06□□□□□ -2.4
RRD2Q12461 snR50snR50 90 nt0.06□□□□□ -2.4
RRD2Q12461 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt0.05□□□□□ -2.4
RRD2Q12461 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt0.04□□□□□ -2.4
RRD2Q12461 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt0.04□□□□□ -2.4
RRD2Q12461 Q0092Q0092 141 nt0.01□□□□□ -2.41
RRD2Q12461 YER090C-AYER090C-A 90 nt0□□□□□ -2.41
RRD2Q12461 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-0.02□□□□□ -2.41
RRD2Q12461 TFB5YDR079C-A 219 nt-0.06□□□□□ -2.42
RRD2Q12461 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-0.09□□□□□ -2.42
RRD2Q12461 YML100W-AYML100W-A 174 nt-0.1□□□□□ -2.43
RRD2Q12461 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt-0.1□□□□□ -2.43
RRD2Q12461 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.11□□□□□ -2.43
RRD2Q12461 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.12□□□□□ -2.43
RRD2Q12461 snR67snR67 82 nt-0.15□□□□□ -2.43
RRD2Q12461 SBH2YER019C-A 267 nt-0.15□□□□□ -2.43
RRD2Q12461 YML054C-AYML054C-A 159 nt-0.15□□□□□ -2.43
RRD2Q12461 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-0.18□□□□□ -2.44
RRD2Q12461 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-0.18□□□□□ -2.44
RRD2Q12461 snR81snR81 201 nt-0.2□□□□□ -2.44
RRD2Q12461 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt-0.2□□□□□ -2.44
RRD2Q12461 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-0.22□□□□□ -2.44
RRD2Q12461 snR61snR61 90 nt-0.24□□□□□ -2.45
RRD2Q12461 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-0.24□□□□□ -2.45
RRD2Q12461 SKI7YOR076C 2244 nt-0.27□□□□□ -2.45
RRD2Q12461 Q0143Q0143 153 nt-0.27□□□□□ -2.45
RRD2Q12461 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.28□□□□□ -2.45
RRD2Q12461 snR47snR47 99 nt-0.3□□□□□ -2.46
RRD2Q12461 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-0.33□□□□□ -2.46
RRD2Q12461 RPL41AYDL184C 78 nt-0.35□□□□□ -2.47
RRD2Q12461 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-0.35□□□□□ -2.47
RRD2Q12461 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-0.36□□□□□ -2.47
RRD2Q12461 URB1YKL014C 5295 nt-0.39□□□□□ -2.47
RRD2Q12461 snR85snR85 171 nt-0.4□□□□□ -2.47
RRD2Q12461 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-0.4□□□□□ -2.47
RRD2Q12461 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-0.4□□□□□ -2.47
RRD2Q12461 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.42□□□□□ -2.48
RRD2Q12461 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.42□□□□□ -2.48
RRD2Q12461 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.42□□□□□ -2.48
RRD2Q12461 snR161snR161 161 nt-0.44□□□□□ -2.48
RRD2Q12461 snR33snR33 183 nt-0.44□□□□□ -2.48
RRD2Q12461 snR38snR38 95 nt-0.45□□□□□ -2.48
RRD2Q12461 YMR326CYMR326C 309 nt-0.47□□□□□ -2.48
RRD2Q12461 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-0.48□□□□□ -2.49
RRD2Q12461 snR62snR62 100 nt-0.53□□□□□ -2.49
RRD2Q12461 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-0.53□□□□□ -2.49
RRD2Q12461 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-0.54□□□□□ -2.5
RRD2Q12461 YBL109WYBL109W 336 nt-0.55□□□□□ -2.5
RRD2Q12461 YHR217CYHR217C 462 nt-0.56□□□□□ -2.5
RRD2Q12461 YKL225WYKL225W 348 nt-0.56□□□□□ -2.5
RRD2Q12461 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.57□□□□□ -2.5
RRD2Q12461 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-0.67□□□□□ -2.52
RRD2Q12461 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt-0.69□□□□□ -2.52
RRD2Q12461 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.69□□□□□ -2.52
RRD2Q12461 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.7□□□□□ -2.52
RRD2Q12461 YNR077CYNR077C 255 nt-0.71□□□□□ -2.52
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.8 ms