Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 YJL182CYJL182C 318 nt-0.47□□□□□ -2.48
NFI1Q12216 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt-0.48□□□□□ -2.49
NFI1Q12216 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt-0.48□□□□□ -2.49
NFI1Q12216 YML100W-AYML100W-A 174 nt-0.49□□□□□ -2.49
NFI1Q12216 snR50snR50 90 nt-0.52□□□□□ -2.49
NFI1Q12216 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.52□□□□□ -2.49
NFI1Q12216 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt-0.53□□□□□ -2.49
NFI1Q12216 YOR170WYOR170W 306 nt-0.53□□□□□ -2.49
NFI1Q12216 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt-0.53□□□□□ -2.49
NFI1Q12216 snR33snR33 183 nt-0.53□□□□□ -2.49
NFI1Q12216 snR69snR69 101 nt-0.54□□□□□ -2.5
NFI1Q12216 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.56□□□□□ -2.5
NFI1Q12216 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.56□□□□□ -2.5
NFI1Q12216 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.56□□□□□ -2.5
NFI1Q12216 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt-0.57□□□□□ -2.5
NFI1Q12216 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt-0.57□□□□□ -2.5
NFI1Q12216 YNL266WYNL266W 420 nt-0.57□□□□□ -2.5
NFI1Q12216 snR39BsnR39B 96 nt-0.58□□□□□ -2.5
NFI1Q12216 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt-0.59□□□□□ -2.5
NFI1Q12216 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt-0.6□□□□□ -2.51
NFI1Q12216 YER090C-AYER090C-A 90 nt-0.61□□□□□ -2.51
NFI1Q12216 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt-0.61□□□□□ -2.51
NFI1Q12216 YOR302WYOR302W 78 nt-0.61□□□□□ -2.51
NFI1Q12216 RDS3YPR094W 324 nt-0.61□□□□□ -2.51
NFI1Q12216 JLP2YMR132C 627 nt-0.62□□□□□ -2.51
NFI1Q12216 snR161snR161 161 nt-0.62□□□□□ -2.51
NFI1Q12216 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.62□□□□□ -2.51
NFI1Q12216 PMP2YEL017C-A 132 nt-0.63□□□□□ -2.51
NFI1Q12216 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt-0.66□□□□□ -2.52
NFI1Q12216 YBR178WYBR178W 375 nt-0.66□□□□□ -2.52
NFI1Q12216 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-0.69□□□□□ -2.52
NFI1Q12216 snR52snR52 92 nt-0.69□□□□□ -2.52
NFI1Q12216 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-0.7□□□□□ -2.52
NFI1Q12216 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.71□□□□□ -2.52
NFI1Q12216 snR67snR67 82 nt-0.72□□□□□ -2.52
NFI1Q12216 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-0.74□□□□□ -2.53
NFI1Q12216 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt-0.74□□□□□ -2.53
NFI1Q12216 SKI7YOR076C 2244 nt-0.74□□□□□ -2.53
NFI1Q12216 snR48snR48 113 nt-0.76□□□□□ -2.53
NFI1Q12216 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt-0.79□□□□□ -2.54
NFI1Q12216 YNL205CYNL205C 423 nt-0.79□□□□□ -2.54
NFI1Q12216 snR80snR80 171 nt-0.81□□□□□ -2.54
NFI1Q12216 YOR102WYOR102W 351 nt-0.82□□□□□ -2.54
NFI1Q12216 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt-0.83□□□□□ -2.54
NFI1Q12216 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.84□□□□□ -2.54
NFI1Q12216 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-0.85□□□□□ -2.55
NFI1Q12216 YML054C-AYML054C-A 159 nt-0.87□□□□□ -2.55
NFI1Q12216 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-0.89□□□□□ -2.55
NFI1Q12216 YNL198CYNL198C 303 nt-0.95□□□□□ -2.56
NFI1Q12216 snR77snR77 88 nt-0.96□□□□□ -2.56
NFI1Q12216 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt-0.96□□□□□ -2.56
NFI1Q12216 YBL053WYBL053W 375 nt-0.96□□□□□ -2.56
NFI1Q12216 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.97□□□□□ -2.56
NFI1Q12216 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-0.98□□□□□ -2.57
NFI1Q12216 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-1□□□□□ -2.57
NFI1Q12216 YNR077CYNR077C 255 nt-1□□□□□ -2.57
NFI1Q12216 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-1□□□□□ -2.57
NFI1Q12216 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-1.01□□□□□ -2.57
NFI1Q12216 snR81snR81 201 nt-1.03□□□□□ -2.57
NFI1Q12216 SOM1YEL059C-A 225 nt-1.04□□□□□ -2.58
NFI1Q12216 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.04□□□□□ -2.58
NFI1Q12216 Q0142Q0142 177 nt-1.05□□□□□ -2.58
NFI1Q12216 YJL150WYJL150W 303 nt-1.06□□□□□ -2.58
NFI1Q12216 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-1.11□□□□□ -2.59
NFI1Q12216 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt-1.16□□□□□ -2.6
NFI1Q12216 RPL41AYDL184C 78 nt-1.17□□□□□ -2.6
NFI1Q12216 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-1.17□□□□□ -2.6
NFI1Q12216 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt-1.19□□□□□ -2.6
NFI1Q12216 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-1.19□□□□□ -2.6
NFI1Q12216 YGR151CYGR151C 336 nt-1.2□□□□□ -2.6
NFI1Q12216 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-1.2□□□□□ -2.6
NFI1Q12216 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-1.21□□□□□ -2.6
NFI1Q12216 YOR309CYOR309C 381 nt-1.23□□□□□ -2.61
NFI1Q12216 SPG3YDR504C 384 nt-1.24□□□□□ -2.61
NFI1Q12216 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-1.25□□□□□ -2.61
NFI1Q12216 snR38snR38 95 nt-1.27□□□□□ -2.61
NFI1Q12216 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-1.29□□□□□ -2.62
NFI1Q12216 snR47snR47 99 nt-1.29□□□□□ -2.62
NFI1Q12216 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt-1.29□□□□□ -2.62
NFI1Q12216 YNL338WYNL338W 159 nt-1.36□□□□□ -2.63
NFI1Q12216 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt-1.37□□□□□ -2.63
NFI1Q12216 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt-1.38□□□□□ -2.63
NFI1Q12216 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-1.41□□□□□ -2.64
NFI1Q12216 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-1.41□□□□□ -2.64
NFI1Q12216 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-1.42□□□□□ -2.64
NFI1Q12216 snR6snR6 112 nt-1.45□□□□□ -2.64
NFI1Q12216 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-1.46□□□□□ -2.64
NFI1Q12216 RPL41BYDL133C-A 78 nt-1.5□□□□□ -2.65
NFI1Q12216 YKL225WYKL225W 348 nt-1.5□□□□□ -2.65
NFI1Q12216 YNL337WYNL337W 255 nt-1.51□□□□□ -2.65
NFI1Q12216 snR73snR73 106 nt-1.52□□□□□ -2.65
NFI1Q12216 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.54□□□□□ -2.66
NFI1Q12216 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-1.55□□□□□ -2.66
NFI1Q12216 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt-1.62□□□□□ -2.67
NFI1Q12216 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-1.63□□□□□ -2.67
NFI1Q12216 snR85snR85 171 nt-1.64□□□□□ -2.67
NFI1Q12216 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-1.64□□□□□ -2.67
NFI1Q12216 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt-1.65□□□□□ -2.67
NFI1Q12216 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-1.66□□□□□ -2.68
NFI1Q12216 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-1.7□□□□□ -2.68
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