Protein–RNA interactions for Protein: Q12212

SIA1, Protein SIA1, yeast

Predictions only

Length 622 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SIA1	Q12212	YNL097C-B	YNL097C-B	123 nt		-0.55	□□□□□ -2.5
SIA1	Q12212	tT(UGU)G1	tT(UGU)G1	72 nt		-0.56	□□□□□ -2.5
SIA1	Q12212	tT(UGU)G2	tT(UGU)G2	72 nt		-0.56	□□□□□ -2.5
SIA1	Q12212	tT(UGU)P	tT(UGU)P	72 nt		-0.56	□□□□□ -2.5
SIA1	Q12212	YOR170W	YOR170W	306 nt		-0.56	□□□□□ -2.5
SIA1	Q12212	YML100W-A	YML100W-A	174 nt		-0.58	□□□□□ -2.5
SIA1	Q12212	tM(CAU)Q2	tM(CAU)Q2	78 nt		-0.6	□□□□□ -2.51
SIA1	Q12212	YDR524W-C	YDR524W-C	90 nt		-0.61	□□□□□ -2.51
SIA1	Q12212	YIL071W-A	YIL071W-A	477 nt		-0.61	□□□□□ -2.51
SIA1	Q12212	snR33	snR33	183 nt		-0.61	□□□□□ -2.51
SIA1	Q12212	YOR302W	YOR302W	78 nt		-0.62	□□□□□ -2.51
SIA1	Q12212	YDL007C-A	YDL007C-A	258 nt		-0.63	□□□□□ -2.51
SIA1	Q12212	snR69	snR69	101 nt		-0.64	□□□□□ -2.51
SIA1	Q12212	snR161	snR161	161 nt		-0.65	□□□□□ -2.51
SIA1	Q12212	tQ(UUG)Q	tQ(UUG)Q	76 nt		-0.66	□□□□□ -2.52
SIA1	Q12212	YOR231C-A	YOR231C-A	201 nt		-0.67	□□□□□ -2.52
SIA1	Q12212	YGR146C-A	YGR146C-A	162 nt		-0.68	□□□□□ -2.52
SIA1	Q12212	YGL188C-A	YGL188C-A	141 nt		-0.69	□□□□□ -2.52
SIA1	Q12212	snR39B	snR39B	96 nt		-0.69	□□□□□ -2.52
SIA1	Q12212	tA(UGC)Q	tA(UGC)Q	76 nt		-0.7	□□□□□ -2.52
SIA1	Q12212	YOR329W-A	YOR329W-A	210 nt		-0.72	□□□□□ -2.52
SIA1	Q12212	PMP2	YEL017C-A	132 nt		-0.75	□□□□□ -2.53
SIA1	Q12212	PAU9	YBL108C-A	129 nt		-0.75	□□□□□ -2.53
SIA1	Q12212	RDS3	YPR094W	324 nt		-0.76	□□□□□ -2.53
SIA1	Q12212	YER090C-A	YER090C-A	90 nt		-0.78	□□□□□ -2.53
SIA1	Q12212	YHL009W-B	YHL009W-B	5409 nt		-0.82	□□□□□ -2.54
SIA1	Q12212	snR80	snR80	171 nt		-0.82	□□□□□ -2.54
SIA1	Q12212	YNL266W	YNL266W	420 nt		-0.82	□□□□□ -2.54
SIA1	Q12212	snR48	snR48	113 nt		-0.82	□□□□□ -2.54
SIA1	Q12212	snR50	snR50	90 nt		-0.83	□□□□□ -2.54
SIA1	Q12212	snR52	snR52	92 nt		-0.85	□□□□□ -2.55
SIA1	Q12212	tP(UGG)Q	tP(UGG)Q	72 nt		-0.87	□□□□□ -2.55
SIA1	Q12212	YLR342W-A	YLR342W-A	174 nt		-0.87	□□□□□ -2.55
SIA1	Q12212	YBR223W-A	YBR223W-A	120 nt		-0.89	□□□□□ -2.55
SIA1	Q12212	JLP2	YMR132C	627 nt		-0.9	□□□□□ -2.55
SIA1	Q12212	tD(GUC)Q	tD(GUC)Q	75 nt		-0.91	□□□□□ -2.56
SIA1	Q12212	tL(UAA)Q	tL(UAA)Q	85 nt		-0.92	□□□□□ -2.56
SIA1	Q12212	YNL205C	YNL205C	423 nt		-0.92	□□□□□ -2.56
SIA1	Q12212	YLR286W-A	YLR286W-A	135 nt		-0.97	□□□□□ -2.56
SIA1	Q12212	YBR178W	YBR178W	375 nt		-0.98	□□□□□ -2.57
SIA1	Q12212	YHL015W-A	YHL015W-A	84 nt		-0.99	□□□□□ -2.57
SIA1	Q12212	YOR102W	YOR102W	351 nt		-1	□□□□□ -2.57
SIA1	Q12212	snR67	snR67	82 nt		-1.01	□□□□□ -2.57
SIA1	Q12212	YDL159C-B	YDL159C-B	177 nt		-1.03	□□□□□ -2.57
SIA1	Q12212	SKI7	YOR076C	2244 nt		-1.07	□□□□□ -2.58
SIA1	Q12212	YDR406W-A	YDR406W-A	246 nt		-1.08	□□□□□ -2.58
SIA1	Q12212	Q0142	Q0142	177 nt		-1.11	□□□□□ -2.59
SIA1	Q12212	tY(GUA)Q	tY(GUA)Q	84 nt		-1.16	□□□□□ -2.6
SIA1	Q12212	YBR196C-A	YBR196C-A	150 nt		-1.19	□□□□□ -2.6
SIA1	Q12212	YLR299C-A	YLR299C-A	93 nt		-1.2	□□□□□ -2.6
SIA1	Q12212	YNL198C	YNL198C	303 nt		-1.2	□□□□□ -2.6
SIA1	Q12212	YNR077C	YNR077C	255 nt		-1.21	□□□□□ -2.6
SIA1	Q12212	YJL150W	YJL150W	303 nt		-1.23	□□□□□ -2.61
SIA1	Q12212	snR77	snR77	88 nt		-1.27	□□□□□ -2.61
SIA1	Q12212	CDC65	tQ(CUG)M	72 nt		-1.27	□□□□□ -2.61
SIA1	Q12212	YBL053W	YBL053W	375 nt		-1.3	□□□□□ -2.62
SIA1	Q12212	YMR046W-A	YMR046W-A	129 nt		-1.31	□□□□□ -2.62
SIA1	Q12212	SOM1	YEL059C-A	225 nt		-1.36	□□□□□ -2.63
SIA1	Q12212	YML054C-A	YML054C-A	159 nt		-1.36	□□□□□ -2.63
SIA1	Q12212	snR81	snR81	201 nt		-1.37	□□□□□ -2.63
SIA1	Q12212	YMR315W-A	YMR315W-A	108 nt		-1.41	□□□□□ -2.64
SIA1	Q12212	SPG3	YDR504C	384 nt		-1.43	□□□□□ -2.64
SIA1	Q12212	YCR095W-A	YCR095W-A	159 nt		-1.44	□□□□□ -2.64
SIA1	Q12212	YGR240C-A	YGR240C-A	201 nt		-1.45	□□□□□ -2.64
SIA1	Q12212	YHR180C-B	YHR180C-B	105 nt		-1.49	□□□□□ -2.65
SIA1	Q12212	YOR309C	YOR309C	381 nt		-1.53	□□□□□ -2.65
SIA1	Q12212	tM(CAU)Q1	tM(CAU)Q1	76 nt		-1.54	□□□□□ -2.66
SIA1	Q12212	YBR126W-B	YBR126W-B	144 nt		-1.55	□□□□□ -2.66
SIA1	Q12212	YOR376W-A	YOR376W-A	156 nt		-1.61	□□□□□ -2.67
SIA1	Q12212	YLR466C-B	YLR466C-B	117 nt		-1.69	□□□□□ -2.68
SIA1	Q12212	YGR151C	YGR151C	336 nt		-1.71	□□□□□ -2.68
SIA1	Q12212	YKL106C-A	YKL106C-A	120 nt		-1.76	□□□□□ -2.69
SIA1	Q12212	YOL083C-A	YOL083C-A	141 nt		-1.77	□□□□□ -2.69
SIA1	Q12212	YCL001W-B	YCL001W-B	255 nt		-1.77	□□□□□ -2.69
SIA1	Q12212	YBR296C-A	YBR296C-A	120 nt		-1.78	□□□□□ -2.69
SIA1	Q12212	YOR316C-A	YOR316C-A	210 nt		-1.79	□□□□□ -2.7
SIA1	Q12212	YBR109W-A	YBR109W-A	225 nt		-1.79	□□□□□ -2.7
SIA1	Q12212	RPL41A	YDL184C	78 nt		-1.81	□□□□□ -2.7
SIA1	Q12212	YBL071C-B	YBL071C-B	99 nt		-1.81	□□□□□ -2.7
SIA1	Q12212	YNL338W	YNL338W	159 nt		-1.83	□□□□□ -2.7
SIA1	Q12212	YOL164W-A	YOL164W-A	183 nt		-1.9	□□□□□ -2.71
SIA1	Q12212	YAL037C-A	YAL037C-A	93 nt		-1.91	□□□□□ -2.72
SIA1	Q12212	snR38	snR38	95 nt		-1.92	□□□□□ -2.72
SIA1	Q12212	snR6	snR6	112 nt		-1.96	□□□□□ -2.72
SIA1	Q12212	YDR543C	YDR543C	300 nt		-2	□□□□□ -2.73
SIA1	Q12212	snR47	snR47	99 nt		-2.02	□□□□□ -2.73
SIA1	Q12212	YBL100W-C	YBL100W-C	120 nt		-2.04	□□□□□ -2.74
SIA1	Q12212	YNL337W	YNL337W	255 nt		-2.06	□□□□□ -2.74
SIA1	Q12212	snR73	snR73	106 nt		-2.09	□□□□□ -2.74
SIA1	Q12212	YOR335W-A	YOR335W-A	81 nt		-2.09	□□□□□ -2.74
SIA1	Q12212	Q0032	Q0032	291 nt		-2.14	□□□□□ -2.75
SIA1	Q12212	YGL007C-A	YGL007C-A	87 nt		-2.24	□□□□□ -2.77
SIA1	Q12212	tS(GCU)Q1	tS(GCU)Q1	86 nt		-2.29	□□□□□ -2.78
SIA1	Q12212	YKL225W	YKL225W	348 nt		-2.31	□□□□□ -2.78
SIA1	Q12212	YDR524C-A	YDR524C-A	120 nt		-2.32	□□□□□ -2.78
SIA1	Q12212	RPL41B	YDL133C-A	78 nt		-2.34	□□□□□ -2.78
SIA1	Q12212	YGL041C-B	YGL041C-B	183 nt		-2.36	□□□□□ -2.79
SIA1	Q12212	YNL103W-A	YNL103W-A	90 nt		-2.43	□□□□□ -2.8
SIA1	Q12212	snR61	snR61	90 nt		-2.44	□□□□□ -2.8
SIA1	Q12212	YOL166W-A	YOL166W-A	156 nt		-2.49	□□□□□ -2.81

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