Protein–RNA interactions for Protein: Q08960

TYW1, S-adenosyl-L-methionine-dependent tRNA 4-demethylwyosine synthase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 810 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TYW1Q08960 SPP41YDR464W 4308 nt1.98□□□□□ -2.09
TYW1Q08960 RDS3YPR094W 324 nt1.94□□□□□ -2.1
TYW1Q08960 EST2YLR318W 2655 nt1.93□□□□□ -2.1
TYW1Q08960 CSE1YGL238W 2883 nt1.92□□□□□ -2.1
TYW1Q08960 YOR093CYOR093C 4947 nt1.91□□□□□ -2.1
TYW1Q08960 BPH1YCR032W 6504 nt1.88□□□□□ -2.11
TYW1Q08960 IML1YJR138W 4755 nt1.88□□□□□ -2.11
TYW1Q08960 PET111YMR257C 2403 nt1.84□□□□□ -2.11
TYW1Q08960 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.84□□□□□ -2.11
TYW1Q08960 MON2YNL297C 4911 nt1.84□□□□□ -2.12
TYW1Q08960 FYV8YGR196C 2454 nt1.83□□□□□ -2.12
TYW1Q08960 IRA1YBR140C 9279 nt1.83□□□□□ -2.12
TYW1Q08960 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.81□□□□□ -2.12
TYW1Q08960 VPS15YBR097W 4365 nt1.8□□□□□ -2.12
TYW1Q08960 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt1.79□□□□□ -2.12
TYW1Q08960 CDC39YCR093W 6327 nt1.77□□□□□ -2.13
TYW1Q08960 BUL2YML111W 2763 nt1.74□□□□□ -2.13
TYW1Q08960 SIP4YJL089W 2490 nt1.73□□□□□ -2.13
TYW1Q08960 UTP20YBL004W 7482 nt1.71□□□□□ -2.14
TYW1Q08960 SPT7YBR081C 3999 nt1.71□□□□□ -2.14
TYW1Q08960 MLP2YIL149C 5040 nt1.71□□□□□ -2.14
TYW1Q08960 SPC110YDR356W 2835 nt1.7□□□□□ -2.14
TYW1Q08960 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt1.69□□□□□ -2.14
TYW1Q08960 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt1.69□□□□□ -2.14
TYW1Q08960 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt1.65□□□□□ -2.15
TYW1Q08960 LTE1YAL024C 4308 nt1.64□□□□□ -2.15
TYW1Q08960 YER090C-AYER090C-A 90 nt1.62□□□□□ -2.15
TYW1Q08960 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.58□□□□□ -2.16
TYW1Q08960 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.58□□□□□ -2.16
TYW1Q08960 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.58□□□□□ -2.16
TYW1Q08960 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.58□□□□□ -2.16
TYW1Q08960 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.58□□□□□ -2.16
TYW1Q08960 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.58□□□□□ -2.16
TYW1Q08960 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.58□□□□□ -2.16
TYW1Q08960 YPR117WYPR117W 7470 nt1.58□□□□□ -2.16
TYW1Q08960 HKR1YDR420W 5409 nt1.58□□□□□ -2.16
TYW1Q08960 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt1.56□□□□□ -2.16
TYW1Q08960 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt1.56□□□□□ -2.16
TYW1Q08960 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt1.56□□□□□ -2.16
TYW1Q08960 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt1.56□□□□□ -2.16
TYW1Q08960 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt1.56□□□□□ -2.16
TYW1Q08960 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt1.56□□□□□ -2.16
TYW1Q08960 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt1.56□□□□□ -2.16
TYW1Q08960 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt1.56□□□□□ -2.16
TYW1Q08960 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.56□□□□□ -2.16
TYW1Q08960 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.56□□□□□ -2.16
TYW1Q08960 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt1.55□□□□□ -2.16
TYW1Q08960 DOP1YDR141C 5097 nt1.51□□□□□ -2.17
TYW1Q08960 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt1.49□□□□□ -2.17
TYW1Q08960 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt1.49□□□□□ -2.17
TYW1Q08960 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.49□□□□□ -2.17
TYW1Q08960 SCC2YDR180W 4482 nt1.45□□□□□ -2.18
TYW1Q08960 snR67snR67 82 nt1.43□□□□□ -2.18
TYW1Q08960 MYO1YHR023W 5787 nt1.38□□□□□ -2.19
TYW1Q08960 VAM6YDL077C 3150 nt1.38□□□□□ -2.19
TYW1Q08960 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt1.36□□□□□ -2.19
TYW1Q08960 YJR029WYJR029W 5268 nt1.35□□□□□ -2.19
TYW1Q08960 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.35□□□□□ -2.19
TYW1Q08960 IQG1YPL242C 4488 nt1.35□□□□□ -2.19
TYW1Q08960 YOL014WYOL014W 375 nt1.33□□□□□ -2.2
TYW1Q08960 snR40snR40 97 nt1.33□□□□□ -2.2
TYW1Q08960 YMR160WYMR160W 2451 nt1.32□□□□□ -2.2
TYW1Q08960 MLP1YKR095W 5628 nt1.31□□□□□ -2.2
TYW1Q08960 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt1.3□□□□□ -2.2
TYW1Q08960 BUD3YCL014W 4911 nt1.3□□□□□ -2.2
TYW1Q08960 BEM2YER155C 6504 nt1.3□□□□□ -2.2
TYW1Q08960 RKR1YMR247C 4689 nt1.27□□□□□ -2.21
TYW1Q08960 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.25□□□□□ -2.21
TYW1Q08960 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt1.16□□□□□ -2.22
TYW1Q08960 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.1□□□□□ -2.23
TYW1Q08960 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.1□□□□□ -2.23
TYW1Q08960 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.1□□□□□ -2.23
TYW1Q08960 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.1□□□□□ -2.23
TYW1Q08960 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.1□□□□□ -2.23
TYW1Q08960 snR77snR77 88 nt1.06□□□□□ -2.24
TYW1Q08960 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt1.06□□□□□ -2.24
TYW1Q08960 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt1.04□□□□□ -2.24
TYW1Q08960 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt1.02□□□□□ -2.25
TYW1Q08960 THO2YNL139C 4794 nt1.01□□□□□ -2.25
TYW1Q08960 YML100W-AYML100W-A 174 nt1□□□□□ -2.25
TYW1Q08960 SOV1YMR066W 2697 nt0.97□□□□□ -2.25
TYW1Q08960 SBH2YER019C-A 267 nt0.94□□□□□ -2.26
TYW1Q08960 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.93□□□□□ -2.26
TYW1Q08960 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.93□□□□□ -2.26
TYW1Q08960 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.93□□□□□ -2.26
TYW1Q08960 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.93□□□□□ -2.26
TYW1Q08960 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.93□□□□□ -2.26
TYW1Q08960 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.93□□□□□ -2.26
TYW1Q08960 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.93□□□□□ -2.26
TYW1Q08960 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.93□□□□□ -2.26
TYW1Q08960 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.93□□□□□ -2.26
TYW1Q08960 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.93□□□□□ -2.26
TYW1Q08960 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.93□□□□□ -2.26
TYW1Q08960 FMP27YLR454W 7887 nt0.92□□□□□ -2.26
TYW1Q08960 ESP1YGR098C 4893 nt0.89□□□□□ -2.27
TYW1Q08960 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.87□□□□□ -2.27
TYW1Q08960 YJL113WYJL113W 4647 nt0.76□□□□□ -2.29
TYW1Q08960 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.7□□□□□ -2.3
TYW1Q08960 UTP10YJL109C 5310 nt0.59□□□□□ -2.32
TYW1Q08960 PAU9YBL108C-A 129 nt0.57□□□□□ -2.32
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