Protein–RNA interactions for Protein: P53312

LSC2, Succinate--CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial, yeastyeast

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Length 427 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSC2P53312 BUL2YML111W 2763 nt1.7□□□□□ -2.14
LSC2P53312 SIP4YJL089W 2490 nt1.69□□□□□ -2.14
LSC2P53312 BRR2YER172C 6492 nt1.67□□□□□ -2.14
LSC2P53312 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt1.67□□□□□ -2.14
LSC2P53312 VPS15YBR097W 4365 nt1.64□□□□□ -2.15
LSC2P53312 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt1.64□□□□□ -2.15
LSC2P53312 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt1.64□□□□□ -2.15
LSC2P53312 LAA1YJL207C 6045 nt1.63□□□□□ -2.15
LSC2P53312 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.62□□□□□ -2.15
LSC2P53312 CAT8YMR280C 4302 nt1.6□□□□□ -2.15
LSC2P53312 SPC110YDR356W 2835 nt1.59□□□□□ -2.15
LSC2P53312 NUP192YJL039C 5052 nt1.59□□□□□ -2.15
LSC2P53312 FYV8YGR196C 2454 nt1.59□□□□□ -2.15
LSC2P53312 BST1YFL025C 3090 nt1.59□□□□□ -2.16
LSC2P53312 YER090C-AYER090C-A 90 nt1.56□□□□□ -2.16
LSC2P53312 MYO1YHR023W 5787 nt1.56□□□□□ -2.16
LSC2P53312 MEC1YBR136W 7107 nt1.55□□□□□ -2.16
LSC2P53312 IRA1YBR140C 9279 nt1.51□□□□□ -2.17
LSC2P53312 YGR130CYGR130C 2451 nt1.5□□□□□ -2.17
LSC2P53312 CCH1YGR217W 6120 nt1.49□□□□□ -2.17
LSC2P53312 CLU1YMR012W 3834 nt1.49□□□□□ -2.17
LSC2P53312 SSK2YNR031C 4740 nt1.49□□□□□ -2.17
LSC2P53312 FIG2YCR089W 4830 nt1.48□□□□□ -2.17
LSC2P53312 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt1.44□□□□□ -2.18
LSC2P53312 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt1.42□□□□□ -2.18
LSC2P53312 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.41□□□□□ -2.18
LSC2P53312 SPT7YBR081C 3999 nt1.41□□□□□ -2.18
LSC2P53312 snR67snR67 82 nt1.4□□□□□ -2.19
LSC2P53312 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.4□□□□□ -2.19
LSC2P53312 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.4□□□□□ -2.19
LSC2P53312 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.4□□□□□ -2.19
LSC2P53312 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.4□□□□□ -2.19
LSC2P53312 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.4□□□□□ -2.19
LSC2P53312 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.4□□□□□ -2.19
LSC2P53312 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.4□□□□□ -2.19
LSC2P53312 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt1.38□□□□□ -2.19
LSC2P53312 BUD3YCL014W 4911 nt1.35□□□□□ -2.19
LSC2P53312 VAM6YDL077C 3150 nt1.35□□□□□ -2.19
LSC2P53312 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt1.34□□□□□ -2.2
LSC2P53312 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt1.32□□□□□ -2.2
LSC2P53312 RKR1YMR247C 4689 nt1.31□□□□□ -2.2
LSC2P53312 YPR117WYPR117W 7470 nt1.3□□□□□ -2.2
LSC2P53312 BEM2YER155C 6504 nt1.29□□□□□ -2.2
LSC2P53312 HKR1YDR420W 5409 nt1.28□□□□□ -2.21
LSC2P53312 YMR160WYMR160W 2451 nt1.26□□□□□ -2.21
LSC2P53312 snR40snR40 97 nt1.22□□□□□ -2.21
LSC2P53312 MLP2YIL149C 5040 nt1.16□□□□□ -2.22
LSC2P53312 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.15□□□□□ -2.23
LSC2P53312 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.15□□□□□ -2.23
LSC2P53312 IML1YJR138W 4755 nt1.14□□□□□ -2.23
LSC2P53312 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt1.12□□□□□ -2.23
LSC2P53312 PAU24YBR301W 363 nt1.1□□□□□ -2.23
LSC2P53312 SCC2YDR180W 4482 nt1.08□□□□□ -2.24
LSC2P53312 DOP1YDR141C 5097 nt1.04□□□□□ -2.24
LSC2P53312 snR77snR77 88 nt1□□□□□ -2.25
LSC2P53312 LTE1YAL024C 4308 nt0.98□□□□□ -2.25
LSC2P53312 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt0.98□□□□□ -2.25
LSC2P53312 YJR029WYJR029W 5268 nt0.97□□□□□ -2.25
LSC2P53312 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.97□□□□□ -2.25
LSC2P53312 YML100W-AYML100W-A 174 nt0.95□□□□□ -2.26
LSC2P53312 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.89□□□□□ -2.27
LSC2P53312 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.89□□□□□ -2.27
LSC2P53312 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.89□□□□□ -2.27
LSC2P53312 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.89□□□□□ -2.27
LSC2P53312 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.89□□□□□ -2.27
LSC2P53312 SBH2YER019C-A 267 nt0.88□□□□□ -2.27
LSC2P53312 SOV1YMR066W 2697 nt0.88□□□□□ -2.27
LSC2P53312 MLP1YKR095W 5628 nt0.84□□□□□ -2.27
LSC2P53312 THO2YNL139C 4794 nt0.81□□□□□ -2.28
LSC2P53312 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.81□□□□□ -2.28
LSC2P53312 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.76□□□□□ -2.29
LSC2P53312 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.76□□□□□ -2.29
LSC2P53312 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.76□□□□□ -2.29
LSC2P53312 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.76□□□□□ -2.29
LSC2P53312 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.76□□□□□ -2.29
LSC2P53312 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.76□□□□□ -2.29
LSC2P53312 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.76□□□□□ -2.29
LSC2P53312 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.76□□□□□ -2.29
LSC2P53312 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.76□□□□□ -2.29
LSC2P53312 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.76□□□□□ -2.29
LSC2P53312 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.76□□□□□ -2.29
LSC2P53312 IQG1YPL242C 4488 nt0.73□□□□□ -2.29
LSC2P53312 ESP1YGR098C 4893 nt0.72□□□□□ -2.29
LSC2P53312 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.68□□□□□ -2.3
LSC2P53312 UTP20YBL004W 7482 nt0.65□□□□□ -2.3
LSC2P53312 UTP10YJL109C 5310 nt0.65□□□□□ -2.31
LSC2P53312 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.6□□□□□ -2.31
LSC2P53312 FMP27YLR454W 7887 nt0.59□□□□□ -2.31
LSC2P53312 PAU9YBL108C-A 129 nt0.59□□□□□ -2.31
LSC2P53312 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.53□□□□□ -2.32
LSC2P53312 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.53□□□□□ -2.32
LSC2P53312 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.53□□□□□ -2.32
LSC2P53312 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.53□□□□□ -2.32
LSC2P53312 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.53□□□□□ -2.32
LSC2P53312 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.53□□□□□ -2.32
LSC2P53312 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.53□□□□□ -2.32
LSC2P53312 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.53□□□□□ -2.32
LSC2P53312 YJL113WYJL113W 4647 nt0.52□□□□□ -2.33
LSC2P53312 snR128snR128 126 nt0.51□□□□□ -2.33
LSC2P53312 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.45□□□□□ -2.34
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