Protein–RNA interactions for Protein: P47044

YJL055W, LOG family protein YJL055W, yeastyeast

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Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YJL055WP47044 URB1YKL014C 5295 nt-0.35□□□□□ -2.47
YJL055WP47044 YOR302WYOR302W 78 nt-0.36□□□□□ -2.47
YJL055WP47044 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt-0.37□□□□□ -2.47
YJL055WP47044 YOR170WYOR170W 306 nt-0.37□□□□□ -2.47
YJL055WP47044 SBH2YER019C-A 267 nt-0.4□□□□□ -2.47
YJL055WP47044 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt-0.42□□□□□ -2.48
YJL055WP47044 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.44□□□□□ -2.48
YJL055WP47044 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.44□□□□□ -2.48
YJL055WP47044 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.44□□□□□ -2.48
YJL055WP47044 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt-0.46□□□□□ -2.48
YJL055WP47044 snR161snR161 161 nt-0.46□□□□□ -2.48
YJL055WP47044 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt-0.49□□□□□ -2.49
YJL055WP47044 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt-0.51□□□□□ -2.49
YJL055WP47044 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.52□□□□□ -2.49
YJL055WP47044 YML100W-AYML100W-A 174 nt-0.52□□□□□ -2.49
YJL055WP47044 snR33snR33 183 nt-0.53□□□□□ -2.49
YJL055WP47044 Q0142Q0142 177 nt-0.56□□□□□ -2.5
YJL055WP47044 snR39BsnR39B 96 nt-0.56□□□□□ -2.5
YJL055WP47044 snR69snR69 101 nt-0.58□□□□□ -2.5
YJL055WP47044 snR80snR80 171 nt-0.59□□□□□ -2.5
YJL055WP47044 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.6□□□□□ -2.51
YJL055WP47044 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt-0.6□□□□□ -2.51
YJL055WP47044 snR48snR48 113 nt-0.61□□□□□ -2.51
YJL055WP47044 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt-0.63□□□□□ -2.51
YJL055WP47044 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt-0.63□□□□□ -2.51
YJL055WP47044 PMP2YEL017C-A 132 nt-0.64□□□□□ -2.51
YJL055WP47044 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt-0.65□□□□□ -2.51
YJL055WP47044 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.67□□□□□ -2.52
YJL055WP47044 snR52snR52 92 nt-0.67□□□□□ -2.52
YJL055WP47044 YER090C-AYER090C-A 90 nt-0.69□□□□□ -2.52
YJL055WP47044 RDS3YPR094W 324 nt-0.69□□□□□ -2.52
YJL055WP47044 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.76□□□□□ -2.53
YJL055WP47044 YNL205CYNL205C 423 nt-0.78□□□□□ -2.53
YJL055WP47044 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt-0.79□□□□□ -2.54
YJL055WP47044 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.79□□□□□ -2.54
YJL055WP47044 SKI7YOR076C 2244 nt-0.81□□□□□ -2.54
YJL055WP47044 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-0.81□□□□□ -2.54
YJL055WP47044 YNL266WYNL266W 420 nt-0.81□□□□□ -2.54
YJL055WP47044 snR50snR50 90 nt-0.83□□□□□ -2.54
YJL055WP47044 JLP2YMR132C 627 nt-0.84□□□□□ -2.54
YJL055WP47044 YOR102WYOR102W 351 nt-0.85□□□□□ -2.55
YJL055WP47044 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt-0.86□□□□□ -2.55
YJL055WP47044 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt-0.88□□□□□ -2.55
YJL055WP47044 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-0.91□□□□□ -2.56
YJL055WP47044 YNR077CYNR077C 255 nt-0.96□□□□□ -2.56
YJL055WP47044 YBR178WYBR178W 375 nt-0.96□□□□□ -2.56
YJL055WP47044 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt-0.97□□□□□ -2.56
YJL055WP47044 snR77snR77 88 nt-0.98□□□□□ -2.57
YJL055WP47044 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-0.98□□□□□ -2.57
YJL055WP47044 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-0.98□□□□□ -2.57
YJL055WP47044 snR67snR67 82 nt-1□□□□□ -2.57
YJL055WP47044 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-1.01□□□□□ -2.57
YJL055WP47044 YJL150WYJL150W 303 nt-1.02□□□□□ -2.57
YJL055WP47044 YNL198CYNL198C 303 nt-1.04□□□□□ -2.58
YJL055WP47044 SPG3YDR504C 384 nt-1.11□□□□□ -2.59
YJL055WP47044 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-1.13□□□□□ -2.59
YJL055WP47044 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-1.15□□□□□ -2.59
YJL055WP47044 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-1.18□□□□□ -2.6
YJL055WP47044 snR81snR81 201 nt-1.19□□□□□ -2.6
YJL055WP47044 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt-1.19□□□□□ -2.6
YJL055WP47044 YBL053WYBL053W 375 nt-1.21□□□□□ -2.6
YJL055WP47044 YML054C-AYML054C-A 159 nt-1.22□□□□□ -2.6
YJL055WP47044 YOR309CYOR309C 381 nt-1.22□□□□□ -2.6
YJL055WP47044 SOM1YEL059C-A 225 nt-1.24□□□□□ -2.61
YJL055WP47044 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-1.24□□□□□ -2.61
YJL055WP47044 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt-1.26□□□□□ -2.61
YJL055WP47044 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.31□□□□□ -2.62
YJL055WP47044 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-1.32□□□□□ -2.62
YJL055WP47044 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt-1.46□□□□□ -2.64
YJL055WP47044 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-1.47□□□□□ -2.64
YJL055WP47044 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-1.49□□□□□ -2.65
YJL055WP47044 YGR151CYGR151C 336 nt-1.54□□□□□ -2.66
YJL055WP47044 snR6snR6 112 nt-1.56□□□□□ -2.66
YJL055WP47044 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-1.61□□□□□ -2.67
YJL055WP47044 YDR543CYDR543C 300 nt-1.63□□□□□ -2.67
YJL055WP47044 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-1.66□□□□□ -2.68
YJL055WP47044 snR73snR73 106 nt-1.67□□□□□ -2.68
YJL055WP47044 YNL338WYNL338W 159 nt-1.67□□□□□ -2.68
YJL055WP47044 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt-1.67□□□□□ -2.68
YJL055WP47044 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-1.72□□□□□ -2.68
YJL055WP47044 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-1.73□□□□□ -2.69
YJL055WP47044 YNL337WYNL337W 255 nt-1.76□□□□□ -2.69
YJL055WP47044 snR38snR38 95 nt-1.76□□□□□ -2.69
YJL055WP47044 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-1.77□□□□□ -2.69
YJL055WP47044 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-1.77□□□□□ -2.69
YJL055WP47044 RPL41AYDL184C 78 nt-1.8□□□□□ -2.7
YJL055WP47044 Q0032Q0032 291 nt-1.81□□□□□ -2.7
YJL055WP47044 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-1.82□□□□□ -2.7
YJL055WP47044 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-1.84□□□□□ -2.7
YJL055WP47044 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt-1.93□□□□□ -2.72
YJL055WP47044 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-1.99□□□□□ -2.73
YJL055WP47044 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-2.02□□□□□ -2.73
YJL055WP47044 snR47snR47 99 nt-2.03□□□□□ -2.73
YJL055WP47044 RPL41BYDL133C-A 78 nt-2.07□□□□□ -2.74
YJL055WP47044 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-2.07□□□□□ -2.74
YJL055WP47044 snR87snR87 109 nt-2.09□□□□□ -2.74
YJL055WP47044 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.09□□□□□ -2.74
YJL055WP47044 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-2.22□□□□□ -2.76
YJL055WP47044 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-2.25□□□□□ -2.77
YJL055WP47044 snR85snR85 171 nt-2.28□□□□□ -2.77
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