Protein–RNA interactions for Protein: P40093

YER156C, UPF0160 protein YER156C, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YER156CP40093 EST1YLR233C 2100 nt1.61□□□□□ -2.15
YER156CP40093 FYV8YGR196C 2454 nt1.61□□□□□ -2.15
YER156CP40093 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt1.6□□□□□ -2.15
YER156CP40093 ULP2YIL031W 3105 nt1.58□□□□□ -2.16
YER156CP40093 CDC25YLR310C 4770 nt1.57□□□□□ -2.16
YER156CP40093 EST2YLR318W 2655 nt1.56□□□□□ -2.16
YER156CP40093 snR69snR69 101 nt1.55□□□□□ -2.16
YER156CP40093 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt1.55□□□□□ -2.16
YER156CP40093 PET127YOR017W 2403 nt1.55□□□□□ -2.16
YER156CP40093 SPC110YDR356W 2835 nt1.54□□□□□ -2.16
YER156CP40093 CSE1YGL238W 2883 nt1.53□□□□□ -2.16
YER156CP40093 snR50snR50 90 nt1.53□□□□□ -2.16
YER156CP40093 SIP4YJL089W 2490 nt1.51□□□□□ -2.17
YER156CP40093 MSN5YDR335W 3675 nt1.51□□□□□ -2.17
YER156CP40093 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt1.49□□□□□ -2.17
YER156CP40093 YKL225WYKL225W 348 nt1.49□□□□□ -2.17
YER156CP40093 UTP20YBL004W 7482 nt1.49□□□□□ -2.17
YER156CP40093 RDS3YPR094W 324 nt1.48□□□□□ -2.17
YER156CP40093 DOP1YDR141C 5097 nt1.46□□□□□ -2.18
YER156CP40093 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.46□□□□□ -2.18
YER156CP40093 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt1.46□□□□□ -2.18
YER156CP40093 HKR1YDR420W 5409 nt1.44□□□□□ -2.18
YER156CP40093 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt1.44□□□□□ -2.18
YER156CP40093 YML054C-AYML054C-A 159 nt1.43□□□□□ -2.18
YER156CP40093 YOL014WYOL014W 375 nt1.43□□□□□ -2.18
YER156CP40093 SPT7YBR081C 3999 nt1.43□□□□□ -2.18
YER156CP40093 NIP1YMR309C 2439 nt1.42□□□□□ -2.18
YER156CP40093 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt1.41□□□□□ -2.18
YER156CP40093 RPL41AYDL184C 78 nt1.4□□□□□ -2.19
YER156CP40093 MYO1YHR023W 5787 nt1.38□□□□□ -2.19
YER156CP40093 BUL2YML111W 2763 nt1.38□□□□□ -2.19
YER156CP40093 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt1.37□□□□□ -2.19
YER156CP40093 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt1.35□□□□□ -2.19
YER156CP40093 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt1.33□□□□□ -2.2
YER156CP40093 snR38snR38 95 nt1.32□□□□□ -2.2
YER156CP40093 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt1.3□□□□□ -2.2
YER156CP40093 BUD3YCL014W 4911 nt1.3□□□□□ -2.2
YER156CP40093 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt1.29□□□□□ -2.2
YER156CP40093 RKR1YMR247C 4689 nt1.28□□□□□ -2.2
YER156CP40093 NST1YNL091W 3723 nt1.28□□□□□ -2.2
YER156CP40093 AI1Q0050 2505 nt1.25□□□□□ -2.21
YER156CP40093 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt1.25□□□□□ -2.21
YER156CP40093 SKI7YOR076C 2244 nt1.24□□□□□ -2.21
YER156CP40093 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt1.23□□□□□ -2.21
YER156CP40093 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt1.2□□□□□ -2.22
YER156CP40093 YMR160WYMR160W 2451 nt1.2□□□□□ -2.22
YER156CP40093 YER090C-AYER090C-A 90 nt1.18□□□□□ -2.22
YER156CP40093 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt1.16□□□□□ -2.22
YER156CP40093 VAM6YDL077C 3150 nt1.14□□□□□ -2.23
YER156CP40093 SCC2YDR180W 4482 nt1.14□□□□□ -2.23
YER156CP40093 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt1.14□□□□□ -2.23
YER156CP40093 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt1.14□□□□□ -2.23
YER156CP40093 YJR029WYJR029W 5268 nt1.1□□□□□ -2.23
YER156CP40093 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.1□□□□□ -2.23
YER156CP40093 YPR117WYPR117W 7470 nt1.07□□□□□ -2.24
YER156CP40093 BEM2YER155C 6504 nt1.07□□□□□ -2.24
YER156CP40093 PET111YMR257C 2403 nt1.07□□□□□ -2.24
YER156CP40093 snR67snR67 82 nt1.02□□□□□ -2.25
YER156CP40093 snR75snR75 89 nt1□□□□□ -2.25
YER156CP40093 YER078W-AYER078W-A 165 nt1□□□□□ -2.25
YER156CP40093 LTE1YAL024C 4308 nt1□□□□□ -2.25
YER156CP40093 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.98□□□□□ -2.25
YER156CP40093 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.98□□□□□ -2.25
YER156CP40093 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.98□□□□□ -2.25
YER156CP40093 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.98□□□□□ -2.25
YER156CP40093 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.98□□□□□ -2.25
YER156CP40093 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.9□□□□□ -2.27
YER156CP40093 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.9□□□□□ -2.27
YER156CP40093 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.9□□□□□ -2.27
YER156CP40093 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.9□□□□□ -2.27
YER156CP40093 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.9□□□□□ -2.27
YER156CP40093 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.9□□□□□ -2.27
YER156CP40093 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.9□□□□□ -2.27
YER156CP40093 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.9□□□□□ -2.27
YER156CP40093 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.9□□□□□ -2.27
YER156CP40093 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.9□□□□□ -2.27
YER156CP40093 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.9□□□□□ -2.27
YER156CP40093 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.88□□□□□ -2.27
YER156CP40093 FMP27YLR454W 7887 nt0.8□□□□□ -2.28
YER156CP40093 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt0.8□□□□□ -2.28
YER156CP40093 THO2YNL139C 4794 nt0.78□□□□□ -2.28
YER156CP40093 MLP1YKR095W 5628 nt0.78□□□□□ -2.29
YER156CP40093 MLP2YIL149C 5040 nt0.77□□□□□ -2.29
YER156CP40093 IQG1YPL242C 4488 nt0.77□□□□□ -2.29
YER156CP40093 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.73□□□□□ -2.29
YER156CP40093 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt0.72□□□□□ -2.29
YER156CP40093 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.72□□□□□ -2.29
YER156CP40093 UTP10YJL109C 5310 nt0.71□□□□□ -2.3
YER156CP40093 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.66□□□□□ -2.3
YER156CP40093 YML100W-AYML100W-A 174 nt0.65□□□□□ -2.31
YER156CP40093 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt0.62□□□□□ -2.31
YER156CP40093 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt0.56□□□□□ -2.32
YER156CP40093 SOV1YMR066W 2697 nt0.51□□□□□ -2.33
YER156CP40093 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt0.46□□□□□ -2.34
YER156CP40093 PAU9YBL108C-A 129 nt0.45□□□□□ -2.34
YER156CP40093 snR128snR128 126 nt0.45□□□□□ -2.34
YER156CP40093 snR77snR77 88 nt0.41□□□□□ -2.34
YER156CP40093 SBH2YER019C-A 267 nt0.38□□□□□ -2.35
YER156CP40093 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.35□□□□□ -2.35
YER156CP40093 ESP1YGR098C 4893 nt0.33□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.1 ms