RNAct
Search
Pairwise
Browse
Proteins
RNAs
Download
About
Search
Protein–RNA interactions for Protein: P34078
LTV1, Protein LTV1, yeast
Predictions only
Length
463 aa
.
Download Table
Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
LTV1
P34078
snR46
snR46
197 nt
-0.29
□□□□□ -2.46
LTV1
P34078
YGR164W
YGR164W
336 nt
-0.3
□□□□□ -2.46
LTV1
P34078
snR52
snR52
92 nt
-0.31
□□□□□ -2.46
LTV1
P34078
YJL077W-A
YJL077W-A
87 nt
-0.33
□□□□□ -2.46
LTV1
P34078
YOR329W-A
YOR329W-A
210 nt
-0.34
□□□□□ -2.46
LTV1
P34078
snR39B
snR39B
96 nt
-0.34
□□□□□ -2.46
LTV1
P34078
SBH2
YER019C-A
267 nt
-0.35
□□□□□ -2.47
LTV1
P34078
YLR342W-A
YLR342W-A
174 nt
-0.35
□□□□□ -2.47
LTV1
P34078
YGR146C-A
YGR146C-A
162 nt
-0.36
□□□□□ -2.47
LTV1
P34078
TFB5
YDR079C-A
219 nt
-0.38
□□□□□ -2.47
LTV1
P34078
snR69
snR69
101 nt
-0.41
□□□□□ -2.48
LTV1
P34078
tQ(UUG)Q
tQ(UUG)Q
76 nt
-0.41
□□□□□ -2.48
LTV1
P34078
snR48
snR48
113 nt
-0.41
□□□□□ -2.48
LTV1
P34078
YDR406W-A
YDR406W-A
246 nt
-0.47
□□□□□ -2.48
LTV1
P34078
YML100W-A
YML100W-A
174 nt
-0.47
□□□□□ -2.48
LTV1
P34078
PMP2
YEL017C-A
132 nt
-0.48
□□□□□ -2.49
LTV1
P34078
SEC10
YLR166C
2616 nt
-0.51
□□□□□ -2.49
LTV1
P34078
RDS3
YPR094W
324 nt
-0.51
□□□□□ -2.49
LTV1
P34078
tL(UAA)Q
tL(UAA)Q
85 nt
-0.52
□□□□□ -2.49
LTV1
P34078
YIL071W-A
YIL071W-A
477 nt
-0.52
□□□□□ -2.49
LTV1
P34078
YDL007C-A
YDL007C-A
258 nt
-0.54
□□□□□ -2.5
LTV1
P34078
YHL015W-A
YHL015W-A
84 nt
-0.54
□□□□□ -2.5
LTV1
P34078
YNL067W-B
YNL067W-B
141 nt
-0.55
□□□□□ -2.5
LTV1
P34078
URB1
YKL014C
5295 nt
-0.55
□□□□□ -2.5
LTV1
P34078
YER090C-A
YER090C-A
90 nt
-0.57
□□□□□ -2.5
LTV1
P34078
YOR102W
YOR102W
351 nt
-0.57
□□□□□ -2.5
LTV1
P34078
YNL205C
YNL205C
423 nt
-0.58
□□□□□ -2.5
LTV1
P34078
tD(GUC)Q
tD(GUC)Q
75 nt
-0.62
□□□□□ -2.51
LTV1
P34078
YMR046W-A
YMR046W-A
129 nt
-0.62
□□□□□ -2.51
LTV1
P34078
PAU9
YBL108C-A
129 nt
-0.62
□□□□□ -2.51
LTV1
P34078
snR50
snR50
90 nt
-0.62
□□□□□ -2.51
LTV1
P34078
tA(UGC)Q
tA(UGC)Q
76 nt
-0.63
□□□□□ -2.51
LTV1
P34078
YJL150W
YJL150W
303 nt
-0.64
□□□□□ -2.51
LTV1
P34078
YNL266W
YNL266W
420 nt
-0.64
□□□□□ -2.51
LTV1
P34078
JLP2
YMR132C
627 nt
-0.65
□□□□□ -2.51
LTV1
P34078
YNL198C
YNL198C
303 nt
-0.69
□□□□□ -2.52
LTV1
P34078
SPG3
YDR504C
384 nt
-0.7
□□□□□ -2.52
LTV1
P34078
YLR286W-A
YLR286W-A
135 nt
-0.7
□□□□□ -2.52
LTV1
P34078
YBR178W
YBR178W
375 nt
-0.7
□□□□□ -2.52
LTV1
P34078
YDL159C-B
YDL159C-B
177 nt
-0.76
□□□□□ -2.53
LTV1
P34078
YBL053W
YBL053W
375 nt
-0.8
□□□□□ -2.54
LTV1
P34078
YJL113W
YJL113W
4647 nt
-0.8
□□□□□ -2.54
LTV1
P34078
tM(CAU)Q1
tM(CAU)Q1
76 nt
-0.81
□□□□□ -2.54
LTV1
P34078
snR67
snR67
82 nt
-0.82
□□□□□ -2.54
LTV1
P34078
snR33
snR33
183 nt
-0.83
□□□□□ -2.54
LTV1
P34078
tT(UGU)G1
tT(UGU)G1
72 nt
-0.85
□□□□□ -2.55
LTV1
P34078
tT(UGU)G2
tT(UGU)G2
72 nt
-0.85
□□□□□ -2.55
LTV1
P34078
tT(UGU)P
tT(UGU)P
72 nt
-0.85
□□□□□ -2.55
LTV1
P34078
YBR196C-A
YBR196C-A
150 nt
-0.87
□□□□□ -2.55
LTV1
P34078
YHL009W-B
YHL009W-B
5409 nt
-0.87
□□□□□ -2.55
LTV1
P34078
YLR299C-A
YLR299C-A
93 nt
-0.91
□□□□□ -2.56
LTV1
P34078
SOM1
YEL059C-A
225 nt
-0.92
□□□□□ -2.56
LTV1
P34078
SKI7
YOR076C
2244 nt
-0.97
□□□□□ -2.57
LTV1
P34078
YCR095W-A
YCR095W-A
159 nt
-0.99
□□□□□ -2.57
LTV1
P34078
YLR466C-B
YLR466C-B
117 nt
-1.01
□□□□□ -2.57
LTV1
P34078
YGR151C
YGR151C
336 nt
-1.05
□□□□□ -2.58
LTV1
P34078
snR161
snR161
161 nt
-1.07
□□□□□ -2.58
LTV1
P34078
YML054C-A
YML054C-A
159 nt
-1.14
□□□□□ -2.59
LTV1
P34078
YNL338W
YNL338W
159 nt
-1.15
□□□□□ -2.59
LTV1
P34078
tP(UGG)Q
tP(UGG)Q
72 nt
-1.18
□□□□□ -2.6
LTV1
P34078
YBR223W-A
YBR223W-A
120 nt
-1.18
□□□□□ -2.6
LTV1
P34078
YHR180C-B
YHR180C-B
105 nt
-1.2
□□□□□ -2.6
LTV1
P34078
YCL001W-B
YCL001W-B
255 nt
-1.26
□□□□□ -2.61
LTV1
P34078
YNL337W
YNL337W
255 nt
-1.27
□□□□□ -2.61
LTV1
P34078
Q0032
Q0032
291 nt
-1.38
□□□□□ -2.63
LTV1
P34078
YOL083C-A
YOL083C-A
141 nt
-1.4
□□□□□ -2.63
LTV1
P34078
snR77
snR77
88 nt
-1.42
□□□□□ -2.64
LTV1
P34078
CDC65
tQ(CUG)M
72 nt
-1.42
□□□□□ -2.64
LTV1
P34078
YBL071C-B
YBL071C-B
99 nt
-1.45
□□□□□ -2.64
LTV1
P34078
YOR376W-A
YOR376W-A
156 nt
-1.45
□□□□□ -2.64
LTV1
P34078
YGL007C-A
YGL007C-A
87 nt
-1.46
□□□□□ -2.64
LTV1
P34078
YGR240C-A
YGR240C-A
201 nt
-1.47
□□□□□ -2.64
LTV1
P34078
RPL41A
YDL184C
78 nt
-1.5
□□□□□ -2.65
LTV1
P34078
YBR109W-A
YBR109W-A
225 nt
-1.5
□□□□□ -2.65
LTV1
P34078
YBR296C-A
YBR296C-A
120 nt
-1.5
□□□□□ -2.65
LTV1
P34078
YAL037C-A
YAL037C-A
93 nt
-1.52
□□□□□ -2.65
LTV1
P34078
YOL164W-A
YOL164W-A
183 nt
-1.52
□□□□□ -2.65
LTV1
P34078
YKL106C-A
YKL106C-A
120 nt
-1.55
□□□□□ -2.66
LTV1
P34078
tY(GUA)Q
tY(GUA)Q
84 nt
-1.56
□□□□□ -2.66
LTV1
P34078
YNR077C
YNR077C
255 nt
-1.56
□□□□□ -2.66
LTV1
P34078
YMR315W-A
YMR315W-A
108 nt
-1.6
□□□□□ -2.67
LTV1
P34078
snR81
snR81
201 nt
-1.62
□□□□□ -2.67
LTV1
P34078
YOR316C-A
YOR316C-A
210 nt
-1.63
□□□□□ -2.67
LTV1
P34078
snR38
snR38
95 nt
-1.65
□□□□□ -2.67
LTV1
P34078
YBL100W-C
YBL100W-C
120 nt
-1.66
□□□□□ -2.68
LTV1
P34078
snR47
snR47
99 nt
-1.66
□□□□□ -2.68
LTV1
P34078
YLR294C
YLR294C
330 nt
-1.8
□□□□□ -2.7
LTV1
P34078
YOR225W
YOR225W
330 nt
-1.81
□□□□□ -2.7
LTV1
P34078
YGL041C-B
YGL041C-B
183 nt
-1.88
□□□□□ -2.71
LTV1
P34078
YNL103W-A
YNL103W-A
90 nt
-1.89
□□□□□ -2.71
LTV1
P34078
YOR309C
YOR309C
381 nt
-1.91
□□□□□ -2.72
LTV1
P34078
snR61
snR61
90 nt
-1.92
□□□□□ -2.72
LTV1
P34078
tS(GCU)Q1
tS(GCU)Q1
86 nt
-1.93
□□□□□ -2.72
LTV1
P34078
YKL225W
YKL225W
348 nt
-1.97
□□□□□ -2.72
LTV1
P34078
YNL170W
YNL170W
396 nt
-1.98
□□□□□ -2.73
LTV1
P34078
YBR126W-B
YBR126W-B
144 nt
-2.06
□□□□□ -2.74
LTV1
P34078
YDR034C-A
YDR034C-A
177 nt
-2.11
□□□□□ -2.75
LTV1
P34078
snR6
snR6
112 nt
-2.12
□□□□□ -2.75
LTV1
P34078
snR62
snR62
100 nt
-2.16
□□□□□ -2.76
LTV1
P34078
ATP8
Q0080
147 nt
-2.19
□□□□□ -2.76
First
Previous
70
Next
Last
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 46.7 ms