Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vstm4T1NXB5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Vstm4T1NXB5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vstm4T1NXB5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vstm4T1NXB5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vstm4T1NXB5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vstm4T1NXB5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vstm4T1NXB5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vstm4T1NXB5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vstm4T1NXB5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vstm4T1NXB5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vstm4T1NXB5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vstm4T1NXB5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vstm4T1NXB5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vstm4T1NXB5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vstm4T1NXB5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vstm4T1NXB5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vstm4T1NXB5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vstm4T1NXB5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vstm4T1NXB5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vstm4T1NXB5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vstm4T1NXB5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vstm4T1NXB5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vstm4T1NXB5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vstm4T1NXB5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vstm4T1NXB5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vstm4T1NXB5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vstm4T1NXB5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vstm4T1NXB5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vstm4T1NXB5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vstm4T1NXB5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vstm4T1NXB5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vstm4T1NXB5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vstm4T1NXB5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vstm4T1NXB5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vstm4T1NXB5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vstm4T1NXB5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vstm4T1NXB5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vstm4T1NXB5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vstm4T1NXB5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vstm4T1NXB5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vstm4T1NXB5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vstm4T1NXB5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vstm4T1NXB5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vstm4T1NXB5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vstm4T1NXB5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vstm4T1NXB5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vstm4T1NXB5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vstm4T1NXB5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vstm4T1NXB5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vstm4T1NXB5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vstm4T1NXB5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vstm4T1NXB5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vstm4T1NXB5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vstm4T1NXB5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vstm4T1NXB5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vstm4T1NXB5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vstm4T1NXB5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vstm4T1NXB5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vstm4T1NXB5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vstm4T1NXB5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vstm4T1NXB5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vstm4T1NXB5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vstm4T1NXB5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vstm4T1NXB5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vstm4T1NXB5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vstm4T1NXB5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vstm4T1NXB5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vstm4T1NXB5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vstm4T1NXB5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Vstm4T1NXB5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vstm4T1NXB5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vstm4T1NXB5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vstm4T1NXB5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vstm4T1NXB5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vstm4T1NXB5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vstm4T1NXB5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vstm4T1NXB5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vstm4T1NXB5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vstm4T1NXB5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vstm4T1NXB5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vstm4T1NXB5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vstm4T1NXB5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vstm4T1NXB5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vstm4T1NXB5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vstm4T1NXB5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vstm4T1NXB5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vstm4T1NXB5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vstm4T1NXB5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vstm4T1NXB5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vstm4T1NXB5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vstm4T1NXB5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vstm4T1NXB5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vstm4T1NXB5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vstm4T1NXB5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vstm4T1NXB5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vstm4T1NXB5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vstm4T1NXB5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vstm4T1NXB5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vstm4T1NXB5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms