Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Robo3Q9Z2I4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Robo3Q9Z2I4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Robo3Q9Z2I4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Robo3Q9Z2I4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Robo3Q9Z2I4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Robo3Q9Z2I4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Robo3Q9Z2I4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Robo3Q9Z2I4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Robo3Q9Z2I4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Robo3Q9Z2I4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Robo3Q9Z2I4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Robo3Q9Z2I4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Robo3Q9Z2I4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Robo3Q9Z2I4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Robo3Q9Z2I4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Robo3Q9Z2I4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Robo3Q9Z2I4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Robo3Q9Z2I4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Robo3Q9Z2I4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Robo3Q9Z2I4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Robo3Q9Z2I4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Robo3Q9Z2I4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Robo3Q9Z2I4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Robo3Q9Z2I4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Robo3Q9Z2I4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Robo3Q9Z2I4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Robo3Q9Z2I4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Robo3Q9Z2I4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Robo3Q9Z2I4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Robo3Q9Z2I4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Robo3Q9Z2I4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Robo3Q9Z2I4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Robo3Q9Z2I4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Robo3Q9Z2I4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Robo3Q9Z2I4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Robo3Q9Z2I4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Robo3Q9Z2I4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Robo3Q9Z2I4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Robo3Q9Z2I4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Robo3Q9Z2I4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Robo3Q9Z2I4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Robo3Q9Z2I4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Robo3Q9Z2I4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Robo3Q9Z2I4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Robo3Q9Z2I4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Robo3Q9Z2I4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Robo3Q9Z2I4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Robo3Q9Z2I4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Robo3Q9Z2I4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Robo3Q9Z2I4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Robo3Q9Z2I4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Robo3Q9Z2I4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Robo3Q9Z2I4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Robo3Q9Z2I4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Robo3Q9Z2I4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Robo3Q9Z2I4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Robo3Q9Z2I4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Robo3Q9Z2I4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Robo3Q9Z2I4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Robo3Q9Z2I4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Robo3Q9Z2I4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Robo3Q9Z2I4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Robo3Q9Z2I4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Robo3Q9Z2I4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Robo3Q9Z2I4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Robo3Q9Z2I4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Robo3Q9Z2I4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Robo3Q9Z2I4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Robo3Q9Z2I4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Robo3Q9Z2I4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Robo3Q9Z2I4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Robo3Q9Z2I4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Robo3Q9Z2I4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Robo3Q9Z2I4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Robo3Q9Z2I4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Robo3Q9Z2I4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Robo3Q9Z2I4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Robo3Q9Z2I4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Robo3Q9Z2I4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Robo3Q9Z2I4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Robo3Q9Z2I4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Robo3Q9Z2I4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Robo3Q9Z2I4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Robo3Q9Z2I4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Robo3Q9Z2I4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Robo3Q9Z2I4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Robo3Q9Z2I4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Robo3Q9Z2I4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Robo3Q9Z2I4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Robo3Q9Z2I4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Robo3Q9Z2I4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Robo3Q9Z2I4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Robo3Q9Z2I4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Robo3Q9Z2I4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Robo3Q9Z2I4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Robo3Q9Z2I4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Robo3Q9Z2I4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Robo3Q9Z2I4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Robo3Q9Z2I4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.7 ms