Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVS6

Prkn, E3 ubiquitin-protein ligase parkin, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrknQ9WVS6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrknQ9WVS6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrknQ9WVS6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrknQ9WVS6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrknQ9WVS6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrknQ9WVS6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrknQ9WVS6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrknQ9WVS6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrknQ9WVS6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrknQ9WVS6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrknQ9WVS6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrknQ9WVS6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrknQ9WVS6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PrknQ9WVS6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrknQ9WVS6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrknQ9WVS6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrknQ9WVS6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrknQ9WVS6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrknQ9WVS6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrknQ9WVS6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrknQ9WVS6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrknQ9WVS6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrknQ9WVS6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrknQ9WVS6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrknQ9WVS6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrknQ9WVS6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrknQ9WVS6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrknQ9WVS6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrknQ9WVS6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrknQ9WVS6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrknQ9WVS6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrknQ9WVS6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrknQ9WVS6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PrknQ9WVS6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrknQ9WVS6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrknQ9WVS6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrknQ9WVS6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrknQ9WVS6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrknQ9WVS6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrknQ9WVS6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrknQ9WVS6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrknQ9WVS6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrknQ9WVS6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrknQ9WVS6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrknQ9WVS6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrknQ9WVS6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrknQ9WVS6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrknQ9WVS6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrknQ9WVS6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrknQ9WVS6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrknQ9WVS6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrknQ9WVS6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrknQ9WVS6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrknQ9WVS6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrknQ9WVS6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrknQ9WVS6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrknQ9WVS6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PrknQ9WVS6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrknQ9WVS6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrknQ9WVS6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrknQ9WVS6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrknQ9WVS6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrknQ9WVS6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrknQ9WVS6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrknQ9WVS6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrknQ9WVS6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrknQ9WVS6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PrknQ9WVS6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrknQ9WVS6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrknQ9WVS6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrknQ9WVS6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrknQ9WVS6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrknQ9WVS6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrknQ9WVS6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrknQ9WVS6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrknQ9WVS6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PrknQ9WVS6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PrknQ9WVS6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PrknQ9WVS6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrknQ9WVS6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrknQ9WVS6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrknQ9WVS6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrknQ9WVS6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrknQ9WVS6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrknQ9WVS6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrknQ9WVS6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrknQ9WVS6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrknQ9WVS6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrknQ9WVS6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrknQ9WVS6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrknQ9WVS6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrknQ9WVS6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrknQ9WVS6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrknQ9WVS6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrknQ9WVS6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrknQ9WVS6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrknQ9WVS6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrknQ9WVS6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrknQ9WVS6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PrknQ9WVS6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms